RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511669.1

CXCL3-204, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL3, Length 1,641 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-204ENST00000511669 ATP10AO60312 1499 aa23.15■■□□□ 1.3
CXCL3-204ENST00000511669 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CXCL3-204ENST00000511669 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.15■■□□□ 1.3
CXCL3-204ENST00000511669 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CXCL3-204ENST00000511669 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
CXCL3-204ENST00000511669 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.12■■□□□ 1.29
CXCL3-204ENST00000511669 KDM5CP41229 1560 aa23.12■■□□□ 1.29
CXCL3-204ENST00000511669 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.11■■□□□ 1.29
CXCL3-204ENST00000511669 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CXCL3-204ENST00000511669 GLI2P10070 1586 aa23.11■■□□□ 1.29
CXCL3-204ENST00000511669 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.11■■□□□ 1.29
CXCL3-204ENST00000511669 TET3O43151 1660 aa23.11■■□□□ 1.29
CXCL3-204ENST00000511669 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.09■■□□□ 1.29
CXCL3-204ENST00000511669 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.09■■□□□ 1.29
CXCL3-204ENST00000511669 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.09■■□□□ 1.29
CXCL3-204ENST00000511669 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.09■■□□□ 1.29
CXCL3-204ENST00000511669 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.08■■□□□ 1.29
CXCL3-204ENST00000511669 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
CXCL3-204ENST00000511669 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
CXCL3-204ENST00000511669 ANP32CO43423 234 aa23.07■■□□□ 1.28
CXCL3-204ENST00000511669 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.05■■□□□ 1.28
CXCL3-204ENST00000511669 A2MP01023 1474 aa23.05■■□□□ 1.28
CXCL3-204ENST00000511669 E9PCH4 1651 aa23.04■■□□□ 1.28
CXCL3-204ENST00000511669 KIF3BO15066 747 aa23.04■■□□□ 1.28
CXCL3-204ENST00000511669 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CXCL3-204ENST00000511669 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.03■■□□□ 1.28
CXCL3-204ENST00000511669 PLA2R1Q13018 1463 aa23.03■■□□□ 1.28
CXCL3-204ENST00000511669 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.02■■□□□ 1.28
CXCL3-204ENST00000511669 TRPM2O94759 1503 aa23.02■■□□□ 1.28
CXCL3-204ENST00000511669 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CXCL3-204ENST00000511669 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.01■■□□□ 1.27
CXCL3-204ENST00000511669 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CXCL3-204ENST00000511669 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.99■■□□□ 1.27
CXCL3-204ENST00000511669 STAC3Q96MF2 364 aa22.99■■□□□ 1.27
CXCL3-204ENST00000511669 USP47Q96K76 1375 aa22.98■■□□□ 1.27
CXCL3-204ENST00000511669 CEP152O94986 1710 aa22.97■■□□□ 1.27
CXCL3-204ENST00000511669 PTPRTO14522 1441 aa22.97■■□□□ 1.27
CXCL3-204ENST00000511669 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CXCL3-204ENST00000511669 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.97■■□□□ 1.27
CXCL3-204ENST00000511669 CCER2I3L3R5 266 aa22.97■■□□□ 1.27
CXCL3-204ENST00000511669 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.97■■□□□ 1.27
CXCL3-204ENST00000511669 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.96■■□□□ 1.27
CXCL3-204ENST00000511669 CCDC7Q96M83 1385 aa22.96■■□□□ 1.27
CXCL3-204ENST00000511669 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.96■■□□□ 1.27
CXCL3-204ENST00000511669 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.95■■□□□ 1.26
CXCL3-204ENST00000511669 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.95■■□□□ 1.26
CXCL3-204ENST00000511669 DIP2BQ9P265 1576 aa22.95■■□□□ 1.26
CXCL3-204ENST00000511669 RICTORQ6R327 1708 aa22.94■■□□□ 1.26
CXCL3-204ENST00000511669 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.94■■□□□ 1.26
CXCL3-204ENST00000511669 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.94■■□□□ 1.26
CXCL3-204ENST00000511669 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.93■■□□□ 1.26
CXCL3-204ENST00000511669 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.93■■□□□ 1.26
CXCL3-204ENST00000511669 LAMC1P11047 1609 aa22.93■■□□□ 1.26
CXCL3-204ENST00000511669 ABCA6Q8N139 1617 aa22.93■■□□□ 1.26
CXCL3-204ENST00000511669 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CXCL3-204ENST00000511669 RGL3Q3MIN7 710 aa22.91■■□□□ 1.26
CXCL3-204ENST00000511669 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.89■■□□□ 1.25
CXCL3-204ENST00000511669 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.88■■□□□ 1.25
CXCL3-204ENST00000511669 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.87■■□□□ 1.25
CXCL3-204ENST00000511669 CLTCL1P53675 1640 aa22.87■■□□□ 1.25
CXCL3-204ENST00000511669 KIF1BO60333 1816 aa22.85■■□□□ 1.25
CXCL3-204ENST00000511669 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CXCL3-204ENST00000511669 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.85■■□□□ 1.25
CXCL3-204ENST00000511669 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.85■■□□□ 1.25
CXCL3-204ENST00000511669 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.85■■□□□ 1.25
CXCL3-204ENST00000511669 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CXCL3-204ENST00000511669 RAPGEF3O95398 923 aa22.83■■□□□ 1.25
CXCL3-204ENST00000511669 GGT6Q6P531 493 aa22.79■■□□□ 1.24
CXCL3-204ENST00000511669 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.78■■□□□ 1.24
CXCL3-204ENST00000511669 MADDQ8WXG6 1647 aa22.78■■□□□ 1.24
CXCL3-204ENST00000511669 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CXCL3-204ENST00000511669 TSPOAP1O95153 1857 aa22.78■■□□□ 1.24
CXCL3-204ENST00000511669 ABCC3O15438 1527 aa22.78■■□□□ 1.24
CXCL3-204ENST00000511669 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.77■■□□□ 1.23
CXCL3-204ENST00000511669 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.76■■□□□ 1.23
CXCL3-204ENST00000511669 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.74■■□□□ 1.23
CXCL3-204ENST00000511669 MYOM2P54296 1465 aa22.73■■□□□ 1.23
CXCL3-204ENST00000511669 REREQ9P2R6 1566 aa22.73■■□□□ 1.23
CXCL3-204ENST00000511669 NPATQ14207 1427 aa22.71■■□□□ 1.23
CXCL3-204ENST00000511669 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.71■■□□□ 1.23
CXCL3-204ENST00000511669 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CXCL3-204ENST00000511669 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.69■■□□□ 1.22
CXCL3-204ENST00000511669 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.69■■□□□ 1.22
CXCL3-204ENST00000511669 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.69■■□□□ 1.22
CXCL3-204ENST00000511669 IFT172Q9UG01 1749 aa22.68■■□□□ 1.22
CXCL3-204ENST00000511669 ADGRB3O60242 1522 aa22.68■■□□□ 1.22
CXCL3-204ENST00000511669 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.68■■□□□ 1.22
CXCL3-204ENST00000511669 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CXCL3-204ENST00000511669 SLC24A1O60721 1099 aa22.67■■□□□ 1.22
CXCL3-204ENST00000511669 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.67■■□□□ 1.22
CXCL3-204ENST00000511669 AGLP35573 1532 aa22.66■■□□□ 1.22
CXCL3-204ENST00000511669 IQGAP1P46940 1657 aa22.65■■□□□ 1.22
CXCL3-204ENST00000511669 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CXCL3-204ENST00000511669 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.65■■□□□ 1.22
CXCL3-204ENST00000511669 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.64■■□□□ 1.22
CXCL3-204ENST00000511669 NOS1P29475 1434 aa22.64■■□□□ 1.21
CXCL3-204ENST00000511669 TMF1P82094 1093 aa22.64■■□□□ 1.21
CXCL3-204ENST00000511669 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.64■■□□□ 1.21
CXCL3-204ENST00000511669 MROH2AA6NES4 1674 aa22.64■■□□□ 1.21
CXCL3-204ENST00000511669 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
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