RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511587.1

ZBED3-203, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ZBED3, Length 542 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-203ENST00000511587 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.65■■■■□ 3.3
ZBED3-203ENST00000511587 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
ZBED3-203ENST00000511587 CERKQ8TCT0 537 aa35.62■■■■□ 3.29
ZBED3-203ENST00000511587 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
ZBED3-203ENST00000511587 APLP2Q06481 763 aa35.61■■■■□ 3.29
ZBED3-203ENST00000511587 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.59■■■■□ 3.29
ZBED3-203ENST00000511587 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
ZBED3-203ENST00000511587 PZPP20742 1482 aa35.59■■■■□ 3.29
ZBED3-203ENST00000511587 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.57■■■■□ 3.28
ZBED3-203ENST00000511587 PLA2R1Q13018 1463 aa35.56■■■■□ 3.28
ZBED3-203ENST00000511587 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.54■■■■□ 3.28
ZBED3-203ENST00000511587 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.53■■■■□ 3.28
ZBED3-203ENST00000511587 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.53■■■■□ 3.28
ZBED3-203ENST00000511587 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
ZBED3-203ENST00000511587 ABCC5O15440 1437 aa35.51■■■■□ 3.28
ZBED3-203ENST00000511587 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.51■■■■□ 3.28
ZBED3-203ENST00000511587 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.51■■■■□ 3.28
ZBED3-203ENST00000511587 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
ZBED3-203ENST00000511587 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
ZBED3-203ENST00000511587 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.49■■■■□ 3.27
ZBED3-203ENST00000511587 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
ZBED3-203ENST00000511587 TNRQ92752 1358 aa35.48■■■■□ 3.27
ZBED3-203ENST00000511587 ABCC3O15438 1527 aa35.47■■■■□ 3.27
ZBED3-203ENST00000511587 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.47■■■■□ 3.27
ZBED3-203ENST00000511587 DAPK1P53355 1430 aa35.45■■■■□ 3.27
ZBED3-203ENST00000511587 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.44■■■■□ 3.26
ZBED3-203ENST00000511587 PKD2Q13563 968 aa35.41■■■■□ 3.26
ZBED3-203ENST00000511587 KIF15Q9NS87 1388 aa35.4■■■■□ 3.26
ZBED3-203ENST00000511587 ERBINQ96RT1 1412 aa35.38■■■■□ 3.25
ZBED3-203ENST00000511587 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.37■■■■□ 3.25
ZBED3-203ENST00000511587 CEP152O94986 1710 aa35.37■■■■□ 3.25
ZBED3-203ENST00000511587 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
ZBED3-203ENST00000511587 NLRP1Q9C000 1473 aa35.36■■■■□ 3.25
ZBED3-203ENST00000511587 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.25
ZBED3-203ENST00000511587 DEPDC5O75140 1603 aa35.32■■■■□ 3.24
ZBED3-203ENST00000511587 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.31■■■■□ 3.24
ZBED3-203ENST00000511587 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.3■■■■□ 3.24
ZBED3-203ENST00000511587 ERVK-7P63135 1459 aa35.3■■■■□ 3.24
ZBED3-203ENST00000511587 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.3■■■■□ 3.24
ZBED3-203ENST00000511587 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.28■■■■□ 3.24
ZBED3-203ENST00000511587 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
ZBED3-203ENST00000511587 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.25■■■■□ 3.23
ZBED3-203ENST00000511587 ADGRL2O95490 1459 aa35.23■■■■□ 3.23
ZBED3-203ENST00000511587 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa35.23■■■■□ 3.23
ZBED3-203ENST00000511587 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.22■■■■□ 3.23
ZBED3-203ENST00000511587 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.2■■■■□ 3.23
ZBED3-203ENST00000511587 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
ZBED3-203ENST00000511587 VWDEQ8N2E2 1590 aa35.17■■■■□ 3.22
ZBED3-203ENST00000511587 MED14O60244 1454 aa35.15■■■■□ 3.22
ZBED3-203ENST00000511587 LMTK2Q8IWU2 1503 aa35.14■■■■□ 3.22
ZBED3-203ENST00000511587 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
ZBED3-203ENST00000511587 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.13■■■■□ 3.21
ZBED3-203ENST00000511587 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.12■■■■□ 3.21
ZBED3-203ENST00000511587 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
ZBED3-203ENST00000511587 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.1■■■■□ 3.21
ZBED3-203ENST00000511587 KANK1Q14678 1352 aa35.1■■■■□ 3.21
ZBED3-203ENST00000511587 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.21
ZBED3-203ENST00000511587 IQGAP1P46940 1657 aa35.05■■■■□ 3.2
ZBED3-203ENST00000511587 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.02■■■■□ 3.2
ZBED3-203ENST00000511587 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.02■■■■□ 3.2
ZBED3-203ENST00000511587 CPS1P31327 1500 aa35.01■■■■□ 3.2
ZBED3-203ENST00000511587 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35■■■■□ 3.19
ZBED3-203ENST00000511587 SLIT1O75093 1534 aa35■■■■□ 3.19
ZBED3-203ENST00000511587 PIK3C2BO00750 1634 aa34.99■■■■□ 3.19
ZBED3-203ENST00000511587 SYNMO15061 1565 aa34.96■■■■□ 3.19
ZBED3-203ENST00000511587 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.18
ZBED3-203ENST00000511587 NOS1P29475 1434 aa34.94■■■■□ 3.18
ZBED3-203ENST00000511587 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
ZBED3-203ENST00000511587 UNC13BO14795 1591 aa34.91■■■■□ 3.18
ZBED3-203ENST00000511587 ROCK1Q13464 1354 aa34.91■■■■□ 3.18
ZBED3-203ENST00000511587 UBAP1LF5GYI3 381 aa34.89■■■■□ 3.18
ZBED3-203ENST00000511587 STRCP1A6NGW2 1772 aa34.88■■■■□ 3.17
ZBED3-203ENST00000511587 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
ZBED3-203ENST00000511587 TET3O43151 1660 aa34.88■■■■□ 3.17
ZBED3-203ENST00000511587 LTKP29376 864 aa34.87■■■■□ 3.17
ZBED3-203ENST00000511587 IDI1Q13907 227 aa34.85■■■■□ 3.17
ZBED3-203ENST00000511587 TMEM2Q9UHN6 1383 aa34.85■■■■□ 3.17
ZBED3-203ENST00000511587 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.82■■■■□ 3.17
ZBED3-203ENST00000511587 TXNDC2Q86VQ3 553 aa34.82■■■■□ 3.16
ZBED3-203ENST00000511587 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.16
ZBED3-203ENST00000511587 ADGRB3O60242 1522 aa34.81■■■■□ 3.16
ZBED3-203ENST00000511587 LRRC7Q96NW7 1537 aa34.76■■■■□ 3.16
ZBED3-203ENST00000511587 STAG3Q9UJ98 1225 aa34.76■■■■□ 3.16
ZBED3-203ENST00000511587 EID1Q9Y6B2 187 aa34.76■■■■□ 3.16
ZBED3-203ENST00000511587 IQGAP3Q86VI3 1631 aa34.76■■■■□ 3.15
ZBED3-203ENST00000511587 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.75■■■■□ 3.15
ZBED3-203ENST00000511587 ALKQ9UM73 1620 aa34.74■■■■□ 3.15
ZBED3-203ENST00000511587 E9PCH4 1651 aa34.73■■■■□ 3.15
ZBED3-203ENST00000511587 TOM1O60784 492 aa34.69■■■■□ 3.14
ZBED3-203ENST00000511587 ITGAEP38570 1179 aa34.69■■■■□ 3.14
ZBED3-203ENST00000511587 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
ZBED3-203ENST00000511587 MYO5BQ9ULV0 1848 aa34.65■■■■□ 3.14
ZBED3-203ENST00000511587 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.65■■■■□ 3.14
ZBED3-203ENST00000511587 ZFYVE9O95405 1425 aa34.63■■■■□ 3.13
ZBED3-203ENST00000511587 DISP3Q9P2K9 1392 aa34.62■■■■□ 3.13
ZBED3-203ENST00000511587 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP34.61■■■■□ 3.13
ZBED3-203ENST00000511587 NUP155O75694 1391 aa34.61■■■■□ 3.13
ZBED3-203ENST00000511587 PIP4K2BP78356 416 aa34.6■■■■□ 3.13
ZBED3-203ENST00000511587 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
ZBED3-203ENST00000511587 HSPA1LP34931 641 aa34.54■■■■□ 3.12
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