RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CERKQ8TCT0 537 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ABCC5O15440 1437 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NCOA1Q15788 1441 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PZPP20742 1482 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PKD2Q13563 968 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TNRQ92752 1358 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KIF15Q9NS87 1388 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DAPK1P53355 1430 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PLA2R1Q13018 1463 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ERBINQ96RT1 1412 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ABCC3O15438 1527 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXC-AS3-201ENST00000509870 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NLRP1Q9C000 1473 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KANK1Q14678 1352 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.33■■□□□ 1.33
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADGRL2O95490 1459 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ERVK-7P63135 1459 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DEPDC5O75140 1603 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CEP152O94986 1710 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MED14O60244 1454 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ROCK1Q13464 1354 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
HOXC-AS3-201ENST00000509870 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ITGAEP38570 1179 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IDI1Q13907 227 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EID1Q9Y6B2 187 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NOS1P29475 1434 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CPS1P31327 1500 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLIT1O75093 1534 aa23.08■■□□□ 1.28
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LTKP29376 864 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IQGAP1P46940 1657 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PIK3C2BO00750 1634 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UNC13BO14795 1591 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SYNMO15061 1565 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TET3O43151 1660 aa23■■□□□ 1.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NUP155O75694 1391 aa23■■□□□ 1.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TOM1O60784 492 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADGRB3O60242 1522 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PIP4K2BP78356 416 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BCANQ96GW7 911 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 E9PCH4 1651 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KCNA6P17658 529 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NAIPQ13075 1403 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
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