RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa11.64□□□□□ -0.55
PDE4D-208ENST00000502484 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa11.63□□□□□ -0.55
PDE4D-208ENST00000502484 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa11.63□□□□□ -0.55
PDE4D-208ENST00000502484 ERBINQ96RT1 1412 aa11.62□□□□□ -0.55
PDE4D-208ENST00000502484 MAGI2Q86UL8 1455 aa11.62□□□□□ -0.55
PDE4D-208ENST00000502484 MYT1LQ9UL68 1186 aa11.62□□□□□ -0.55
PDE4D-208ENST00000502484 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PDE4D-208ENST00000502484 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa11.61□□□□□ -0.55
PDE4D-208ENST00000502484 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa11.61□□□□□ -0.55
PDE4D-208ENST00000502484 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PDE4D-208ENST00000502484 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PDE4D-208ENST00000502484 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PDE4D-208ENST00000502484 KDM5CP41229 1560 aa11.59□□□□□ -0.55
PDE4D-208ENST00000502484 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PDE4D-208ENST00000502484 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa11.59□□□□□ -0.55
PDE4D-208ENST00000502484 NBPF8Q3BBV2 869 aa11.59□□□□□ -0.55
PDE4D-208ENST00000502484 MSH5O43196 834 aa11.58□□□□□ -0.56
PDE4D-208ENST00000502484 HECW2Q9P2P5 1572 aa11.58□□□□□ -0.56
PDE4D-208ENST00000502484 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
PDE4D-208ENST00000502484 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP11.57□□□□□ -0.56
PDE4D-208ENST00000502484 ATP7AQ04656 1500 aa11.57□□□□□ -0.56
PDE4D-208ENST00000502484 DEPDC5O75140 1603 aa11.57□□□□□ -0.56
PDE4D-208ENST00000502484 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
PDE4D-208ENST00000502484 MLH3Q9UHC1 1453 aa11.56□□□□□ -0.56
PDE4D-208ENST00000502484 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa11.56□□□□□ -0.56
PDE4D-208ENST00000502484 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa11.56□□□□□ -0.56
PDE4D-208ENST00000502484 YEATS2Q9ULM3 1422 aa11.56□□□□□ -0.56
PDE4D-208ENST00000502484 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
PDE4D-208ENST00000502484 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa11.54□□□□□ -0.56
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa11.54□□□□□ -0.56
PDE4D-208ENST00000502484 ATP10AO60312 1499 aa11.54□□□□□ -0.56
PDE4D-208ENST00000502484 PLA2R1Q13018 1463 aa11.53□□□□□ -0.56
PDE4D-208ENST00000502484 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
PDE4D-208ENST00000502484 ABCA6Q8N139 1617 aa11.52□□□□□ -0.56
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC144AA2RUR9 1427 aa11.52□□□□□ -0.56
PDE4D-208ENST00000502484 E9PCH4 1651 aa11.52□□□□□ -0.57
PDE4D-208ENST00000502484 RALGAPBQ86X10 1494 aa11.52□□□□□ -0.57
PDE4D-208ENST00000502484 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP11.52□□□□□ -0.575e-6■■■■□ 19.5
PDE4D-208ENST00000502484 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa11.52□□□□□ -0.57
PDE4D-208ENST00000502484 WASHC2AQ641Q2 1341 aa11.52□□□□□ -0.57
PDE4D-208ENST00000502484 TET3O43151 1660 aa11.51□□□□□ -0.57
PDE4D-208ENST00000502484 VWDEQ8N2E2 1590 aa11.5□□□□□ -0.57
PDE4D-208ENST00000502484 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PDE4D-208ENST00000502484 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa11.5□□□□□ -0.57
PDE4D-208ENST00000502484 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PDE4D-208ENST00000502484 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa11.48□□□□□ -0.57
PDE4D-208ENST00000502484 MROH1Q8NDA8 1641 aa11.48□□□□□ -0.57
PDE4D-208ENST00000502484 ANP32CO43423 234 aa11.48□□□□□ -0.57
PDE4D-208ENST00000502484 A2MP01023 1474 aa11.48□□□□□ -0.57
PDE4D-208ENST00000502484 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC7Q96M83 1385 aa11.48□□□□□ -0.57
PDE4D-208ENST00000502484 CEP152O94986 1710 aa11.47□□□□□ -0.57
PDE4D-208ENST00000502484 BCORL1Q5H9F3 1711 aa11.47□□□□□ -0.57
PDE4D-208ENST00000502484 CNTLNQ9NXG0 1405 aa11.47□□□□□ -0.57
PDE4D-208ENST00000502484 CCER2I3L3R5 266 aa11.47□□□□□ -0.57
PDE4D-208ENST00000502484 TRPM2O94759 1503 aa11.47□□□□□ -0.57
PDE4D-208ENST00000502484 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa11.46□□□□□ -0.57
PDE4D-208ENST00000502484 USP47Q96K76 1375 aa11.46□□□□□ -0.57
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PDE4D-208ENST00000502484 REREQ9P2R6 1566 aa11.46□□□□□ -0.57
PDE4D-208ENST00000502484 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
PDE4D-208ENST00000502484 DCAF11Q8TEB1 546 aa11.46□□□□□ -0.58
PDE4D-208ENST00000502484 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PDE4D-208ENST00000502484 PRAG1Q86YV5 1406 aa11.45□□□□□ -0.58
PDE4D-208ENST00000502484 LAMC1P11047 1609 aa11.45□□□□□ -0.58
PDE4D-208ENST00000502484 KANK1Q14678 1352 aa11.44□□□□□ -0.58
PDE4D-208ENST00000502484 PTPRTO14522 1441 aa11.44□□□□□ -0.58
PDE4D-208ENST00000502484 KIF3BO15066 747 aa11.44□□□□□ -0.58
PDE4D-208ENST00000502484 MLECQ14165 292 aa11.44□□□□□ -0.58
PDE4D-208ENST00000502484 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa11.43□□□□□ -0.58
PDE4D-208ENST00000502484 KIF7Q2M1P5 1343 aa11.43□□□□□ -0.58
PDE4D-208ENST00000502484 CLTCL1P53675 1640 aa11.43□□□□□ -0.58
PDE4D-208ENST00000502484 AGLP35573 1532 aa11.43□□□□□ -0.58
PDE4D-208ENST00000502484 GGT6Q6P531 493 aa11.42□□□□□ -0.58
PDE4D-208ENST00000502484 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa11.42□□□□□ -0.58
PDE4D-208ENST00000502484 LMTK2Q8IWU2 1503 aa11.42□□□□□ -0.58
PDE4D-208ENST00000502484 CARD11Q9BXL7 1154 aa11.42□□□□□ -0.58
PDE4D-208ENST00000502484 EFCAB6Q5THR3 1501 aa11.41□□□□□ -0.58
PDE4D-208ENST00000502484 PLPPR3Q6T4P5 718 aa11.41□□□□□ -0.58
PDE4D-208ENST00000502484 NEURL4Q96JN8 1562 aa11.41□□□□□ -0.58
PDE4D-208ENST00000502484 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
PDE4D-208ENST00000502484 GPRASP1Q5JY77 1395 aa11.4□□□□□ -0.58
PDE4D-208ENST00000502484 RGL3Q3MIN7 710 aa11.4□□□□□ -0.58
PDE4D-208ENST00000502484 KIF1BO60333 1816 aa11.39□□□□□ -0.59
PDE4D-208ENST00000502484 MADDQ8WXG6 1647 aa11.39□□□□□ -0.59
PDE4D-208ENST00000502484 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
PDE4D-208ENST00000502484 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa11.37□□□□□ -0.59
PDE4D-208ENST00000502484 ADAMTSL3P82987 1691 aa11.36□□□□□ -0.59
PDE4D-208ENST00000502484 IFT172Q9UG01 1749 aa11.36□□□□□ -0.59
PDE4D-208ENST00000502484 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa11.35□□□□□ -0.59
PDE4D-208ENST00000502484 STAC3Q96MF2 364 aa11.35□□□□□ -0.59
PDE4D-208ENST00000502484 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa11.35□□□□□ -0.59
PDE4D-208ENST00000502484 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa11.35□□□□□ -0.59
PDE4D-208ENST00000502484 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa11.35□□□□□ -0.59
PDE4D-208ENST00000502484 PPP6R1Q9UPN7 881 aa11.35□□□□□ -0.59
PDE4D-208ENST00000502484 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
PDE4D-208ENST00000502484 IQGAP1P46940 1657 aa11.34□□□□□ -0.59
PDE4D-208ENST00000502484 NBPF1Q3BBV0 1214 aa11.34□□□□□ -0.59
PDE4D-208ENST00000502484 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PDE4D-208ENST00000502484 MROH2AA6NES4 1674 aa11.34□□□□□ -0.59
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