RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498562.2

CUL4A-211, Transcript of cullin 4A, human

TSL 3

Gene CUL4A, Length 790 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUL4A-211	ENST00000498562	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		41.03	■■■■■ 4.16
CUL4A-211	ENST00000498562	TSPY4	P0CV99	314 aa		40.99	■■■■■ 4.15
CUL4A-211	ENST00000498562	TSPY10	P0CW01	314 aa		40.99	■■■■■ 4.15
CUL4A-211	ENST00000498562	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	40.98	■■■■■ 4.15
CUL4A-211	ENST00000498562	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		40.98	■■■■■ 4.15
CUL4A-211	ENST00000498562	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		40.97	■■■■■ 4.15
CUL4A-211	ENST00000498562	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		40.96	■■■■■ 4.15
CUL4A-211	ENST00000498562	PZP	P20742	1482 aa		40.96	■■■■■ 4.15
CUL4A-211	ENST00000498562	MIA2	Q96PC5	1412 aa		40.96	■■■■■ 4.15
CUL4A-211	ENST00000498562	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	40.94	■■■■■ 4.14
CUL4A-211	ENST00000498562	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	40.92	■■■■■ 4.14
CUL4A-211	ENST00000498562	PKD2	Q13563	968 aa		40.9	■■■■■ 4.14
CUL4A-211	ENST00000498562	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		40.89	■■■■■ 4.14
CUL4A-211	ENST00000498562	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		40.89	■■■■■ 4.14
CUL4A-211	ENST00000498562	TNR	Q92752	1358 aa		40.88	■■■■■ 4.14
CUL4A-211	ENST00000498562	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	40.87	■■■■■ 4.13
CUL4A-211	ENST00000498562	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	40.87	■■■■■ 4.13
CUL4A-211	ENST00000498562	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	40.82	■■■■■ 4.13
CUL4A-211	ENST00000498562	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	40.8	■■■■■ 4.12
CUL4A-211	ENST00000498562	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	40.79	■■■■■ 4.12
CUL4A-211	ENST00000498562	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		40.78	■■■■■ 4.12
CUL4A-211	ENST00000498562	ABCC3	O15438	1527 aa		40.78	■■■■■ 4.12
CUL4A-211	ENST00000498562	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		40.78	■■■■■ 4.12
CUL4A-211	ENST00000498562	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		40.75	■■■■■ 4.11
CUL4A-211	ENST00000498562	NLRP1	Q9C000	1473 aa		40.74	■■■■■ 4.11
CUL4A-211	ENST00000498562	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		40.74	■■■■■ 4.11
CUL4A-211	ENST00000498562	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		40.73	■■■■■ 4.11
CUL4A-211	ENST00000498562	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		40.71	■■■■■ 4.11
CUL4A-211	ENST00000498562	APLP2	Q06481	763 aa		40.69	■■■■■ 4.1
CUL4A-211	ENST00000498562	CEP152	O94986	1710 aa		40.69	■■■■■ 4.1
CUL4A-211	ENST00000498562	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		40.69	■■■■■ 4.1
CUL4A-211	ENST00000498562	ABCC5	O15440	1437 aa		40.67	■■■■■ 4.1
CUL4A-211	ENST00000498562	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		40.67	■■■■■ 4.1
CUL4A-211	ENST00000498562	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	40.62	■■■■■ 4.09	3e-7	■□□□□ 8.2
CUL4A-211	ENST00000498562	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		40.62	■■■■■ 4.09
CUL4A-211	ENST00000498562	ERVK-7	P63135	1459 aa		40.62	■■■■■ 4.09
CUL4A-211	ENST00000498562	KIF15	Q9NS87	1388 aa		40.61	■■■■■ 4.09
CUL4A-211	ENST00000498562	DAPK1	P53355	1430 aa		40.6	■■■■■ 4.09
CUL4A-211	ENST00000498562	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	40.6	■■■■■ 4.09
CUL4A-211	ENST00000498562	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		40.59	■■■■■ 4.09
CUL4A-211	ENST00000498562	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	40.58	■■■■■ 4.09
CUL4A-211	ENST00000498562	DEPDC5	O75140	1603 aa		40.57	■■■■■ 4.09
CUL4A-211	ENST00000498562	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		40.54	■■■■■ 4.08
CUL4A-211	ENST00000498562	MED14	O60244	1454 aa		40.52	■■■■■ 4.08
CUL4A-211	ENST00000498562	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		40.5	■■■■■ 4.07
CUL4A-211	ENST00000498562	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	40.5	■■■■■ 4.07
CUL4A-211	ENST00000498562	CPS1	P31327	1500 aa		40.48	■■■■■ 4.07
CUL4A-211	ENST00000498562	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	40.48	■■■■■ 4.07
CUL4A-211	ENST00000498562	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		40.47	■■■■■ 4.07
CUL4A-211	ENST00000498562	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		40.46	■■■■■ 4.07
CUL4A-211	ENST00000498562	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		40.46	■■■■■ 4.07
CUL4A-211	ENST00000498562	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		40.46	■■■■■ 4.07
CUL4A-211	ENST00000498562	IQGAP1	P46940	1657 aa		40.46	■■■■■ 4.07
CUL4A-211	ENST00000498562	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		40.39	■■■■■ 4.06
CUL4A-211	ENST00000498562	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		40.38	■■■■■ 4.06
CUL4A-211	ENST00000498562	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		40.36	■■■■■ 4.05
CUL4A-211	ENST00000498562	ADGRL2	O95490	1459 aa		40.33	■■■■■ 4.05
CUL4A-211	ENST00000498562	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		40.33	■■■■■ 4.05
CUL4A-211	ENST00000498562	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	40.33	■■■■■ 4.05	3e-7	■■■■□ 20.4
CUL4A-211	ENST00000498562	KANK1	Q14678	1352 aa		40.32	■■■■■ 4.04
CUL4A-211	ENST00000498562	SLIT1	O75093	1534 aa		40.29	■■■■■ 4.04
CUL4A-211	ENST00000498562	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		40.29	■■■■■ 4.04
CUL4A-211	ENST00000498562	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		40.28	■■■■■ 4.04
CUL4A-211	ENST00000498562	PIK3C2B	O00750	1634 aa		40.27	■■■■■ 4.04
CUL4A-211	ENST00000498562	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	40.27	■■■■■ 4.04
CUL4A-211	ENST00000498562	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		40.21	■■■■■ 4.03
CUL4A-211	ENST00000498562	SYNM	O15061	1565 aa		40.2	■■■■■ 4.03
CUL4A-211	ENST00000498562	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	40.2	■■■■■ 4.03
CUL4A-211	ENST00000498562	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	40.19	■■■■■ 4.02
CUL4A-211	ENST00000498562	ILDR2	Q71H61	639 aa		40.18	■■■■■ 4.02
CUL4A-211	ENST00000498562	TOM1	O60784	492 aa		40.17	■■■■■ 4.02
CUL4A-211	ENST00000498562	LTK	P29376	864 aa		40.17	■■■■■ 4.02
CUL4A-211	ENST00000498562	ALK	Q9UM73	1620 aa		40.16	■■■■■ 4.02
CUL4A-211	ENST00000498562	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		40.15	■■■■■ 4.02
CUL4A-211	ENST00000498562	NOS1	P29475	1434 aa		40.12	■■■■■ 4.01
CUL4A-211	ENST00000498562	PIP4K2B	P78356	416 aa		40.12	■■■■■ 4.01
CUL4A-211	ENST00000498562	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		40.12	■■■■■ 4.01
CUL4A-211	ENST00000498562	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		40.12	■■■■■ 4.01
CUL4A-211	ENST00000498562	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	40.12	■■■■■ 4.01
CUL4A-211	ENST00000498562	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		40.11	■■■■■ 4.01
CUL4A-211	ENST00000498562	IDI1	Q13907	227 aa		40.06	■■■■■ 4
CUL4A-211	ENST00000498562	EID1	Q9Y6B2	187 aa		40.06	■■■■■ 4
CUL4A-211	ENST00000498562	HSPA1L	P34931	641 aa		40.05	■■■■■ 4
CUL4A-211	ENST00000498562	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		40.04	■■■■■ 4
CUL4A-211	ENST00000498562	ADGRB3	O60242	1522 aa		40.04	■■■■■ 4
CUL4A-211	ENST00000498562	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	40.02	■■■■■ 4
CUL4A-211	ENST00000498562	TET3	O43151	1660 aa		40.02	■■■■■ 4
CUL4A-211	ENST00000498562	UNC13B	O14795	1591 aa		40.01	■■■■□ 3.99
CUL4A-211	ENST00000498562	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	39.97	■■■■□ 3.99
CUL4A-211	ENST00000498562	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		39.96	■■■■□ 3.99
CUL4A-211	ENST00000498562	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		39.92	■■■■□ 3.98
CUL4A-211	ENST00000498562	ROCK1	Q13464	1354 aa		39.91	■■■■□ 3.98
CUL4A-211	ENST00000498562	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	39.9	■■■■□ 3.98
CUL4A-211	ENST00000498562	SOCS7	O14512	581 aa		39.89	■■■■□ 3.98
CUL4A-211	ENST00000498562	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		39.87	■■■■□ 3.97
CUL4A-211	ENST00000498562		E9PCH4	1651 aa		39.84	■■■■□ 3.97
CUL4A-211	ENST00000498562	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		39.83	■■■■□ 3.97
CUL4A-211	ENST00000498562	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		39.81	■■■■□ 3.96
CUL4A-211	ENST00000498562	ZFYVE9	O95405	1425 aa		39.81	■■■■□ 3.96
CUL4A-211	ENST00000498562	NWD1	Q149M9	1564 aa		39.79	■■■■□ 3.96

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