RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498439.1

CHTF18-213, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 2

Gene CHTF18, Length 673 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-213ENST00000498439 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.74■■■□□ 2.19
CHTF18-213ENST00000498439 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.74■■■□□ 2.19
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CHTF18-213ENST00000498439 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
CHTF18-213ENST00000498439 TNRQ92752 1358 aa28.71■■■□□ 2.19
CHTF18-213ENST00000498439 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.71■■■□□ 2.19
CHTF18-213ENST00000498439 APLP2Q06481 763 aa28.69■■■□□ 2.18
CHTF18-213ENST00000498439 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
CHTF18-213ENST00000498439 PZPP20742 1482 aa28.68■■■□□ 2.18
CHTF18-213ENST00000498439 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.68■■■□□ 2.18
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CHTF18-213ENST00000498439 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.67■■■□□ 2.18
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CHTF18-213ENST00000498439 MIA2Q96PC5 1412 aa28.64■■■□□ 2.18
CHTF18-213ENST00000498439 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.64■■■□□ 2.18
CHTF18-213ENST00000498439 NLRP1Q9C000 1473 aa28.61■■■□□ 2.17
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CHTF18-213ENST00000498439 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
CHTF18-213ENST00000498439 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
CHTF18-213ENST00000498439 TOM1O60784 492 aa28.54■■■□□ 2.16
CHTF18-213ENST00000498439 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.54■■■□□ 2.16
CHTF18-213ENST00000498439 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
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CHTF18-213ENST00000498439 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.46■■■□□ 2.15
CHTF18-213ENST00000498439 ABCC3O15438 1527 aa28.44■■■□□ 2.14
CHTF18-213ENST00000498439 DEPDC5O75140 1603 aa28.44■■■□□ 2.14
CHTF18-213ENST00000498439 MED14O60244 1454 aa28.44■■■□□ 2.14
CHTF18-213ENST00000498439 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CHTF18-213ENST00000498439 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.43■■■□□ 2.14
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CHTF18-213ENST00000498439 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
CHTF18-213ENST00000498439 SOCS7O14512 581 aa28.41■■■□□ 2.14
CHTF18-213ENST00000498439 KANK1Q14678 1352 aa28.39■■■□□ 2.14
CHTF18-213ENST00000498439 ILDR2Q71H61 639 aa28.39■■■□□ 2.14
CHTF18-213ENST00000498439 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.39■■■□□ 2.14
CHTF18-213ENST00000498439 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.13
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CHTF18-213ENST00000498439 ERBINQ96RT1 1412 aa28.38■■■□□ 2.13
CHTF18-213ENST00000498439 ERVK-7P63135 1459 aa28.38■■■□□ 2.13
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CHTF18-213ENST00000498439 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.35■■■□□ 2.13
CHTF18-213ENST00000498439 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.35■■■□□ 2.13
CHTF18-213ENST00000498439 EID1Q9Y6B2 187 aa28.34■■■□□ 2.13
CHTF18-213ENST00000498439 ABCC5O15440 1437 aa28.34■■■□□ 2.13
CHTF18-213ENST00000498439 IQGAP1P46940 1657 aa28.33■■■□□ 2.13
CHTF18-213ENST00000498439 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.33■■■□□ 2.13
CHTF18-213ENST00000498439 CEP152O94986 1710 aa28.32■■■□□ 2.12
CHTF18-213ENST00000498439 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.32■■■□□ 2.12
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CHTF18-213ENST00000498439 DAPK1P53355 1430 aa28.3■■■□□ 2.12
CHTF18-213ENST00000498439 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.29■■■□□ 2.12
CHTF18-213ENST00000498439 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.29■■■□□ 2.12
CHTF18-213ENST00000498439 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.29■■■□□ 2.12
CHTF18-213ENST00000498439 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.27■■■□□ 2.12
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CHTF18-213ENST00000498439 HSPA1LP34931 641 aa28.26■■■□□ 2.11
CHTF18-213ENST00000498439 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.25■■■□□ 2.11
CHTF18-213ENST00000498439 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
CHTF18-213ENST00000498439 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.24■■■□□ 2.11
CHTF18-213ENST00000498439 SLIT1O75093 1534 aa28.2■■■□□ 2.1
CHTF18-213ENST00000498439 LTKP29376 864 aa28.18■■■□□ 2.1
CHTF18-213ENST00000498439 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.18■■■□□ 2.1
CHTF18-213ENST00000498439 SYNMO15061 1565 aa28.17■■■□□ 2.1
CHTF18-213ENST00000498439 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.16■■■□□ 2.1
CHTF18-213ENST00000498439 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.15■■■□□ 2.1
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CHTF18-213ENST00000498439 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.15■■■□□ 2.1
CHTF18-213ENST00000498439 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.14■■■□□ 2.1
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CHTF18-213ENST00000498439 PIK3C2BO00750 1634 aa28.1■■■□□ 2.09
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CHTF18-213ENST00000498439 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
CHTF18-213ENST00000498439 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.08■■■□□ 2.09
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CHTF18-213ENST00000498439 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.04■■■□□ 2.08
CHTF18-213ENST00000498439 KCNA6P17658 529 aa28.04■■■□□ 2.08
CHTF18-213ENST00000498439 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
CHTF18-213ENST00000498439 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
CHTF18-213ENST00000498439 NOS1P29475 1434 aa28.02■■■□□ 2.08
CHTF18-213ENST00000498439 ALKQ9UM73 1620 aa28■■■□□ 2.07
CHTF18-213ENST00000498439 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
CHTF18-213ENST00000498439 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.96■■■□□ 2.07
CHTF18-213ENST00000498439 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
CHTF18-213ENST00000498439 ADGRB3O60242 1522 aa27.94■■■□□ 2.06
CHTF18-213ENST00000498439 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
CHTF18-213ENST00000498439 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP27.94■■■□□ 2.06
CHTF18-213ENST00000498439 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.92■■■□□ 2.06
CHTF18-213ENST00000498439 TMEM94Q12767 1356 aa27.92■■■□□ 2.06
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