RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497251.1

TRAPPC3-207, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-207ENST00000497251 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC3-207ENST00000497251 MAP3K1Q13233 1512 aa26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC3-207ENST00000497251 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC3-207ENST00000497251 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC3-207ENST00000497251 PZPP20742 1482 aa26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC3-207ENST00000497251 TNRQ92752 1358 aa26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC3-207ENST00000497251 MIA2Q96PC5 1412 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC3-207ENST00000497251 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC3-207ENST00000497251 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC3-207ENST00000497251 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC3-207ENST00000497251 NLRP1Q9C000 1473 aa26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC3-207ENST00000497251 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC3-207ENST00000497251 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC3-207ENST00000497251 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC3-207ENST00000497251 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC3-207ENST00000497251 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC3-207ENST00000497251 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC3-207ENST00000497251 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC3-207ENST00000497251 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC3-207ENST00000497251 APLP2Q06481 763 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC3-207ENST00000497251 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC3-207ENST00000497251 CPS1P31327 1500 aa26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3-207ENST00000497251 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC3-207ENST00000497251 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC3-207ENST00000497251 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC3-207ENST00000497251 MED14O60244 1454 aa26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC3-207ENST00000497251 ABCC3O15438 1527 aa26.45■■□□□ 1.83
TRAPPC3-207ENST00000497251 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 TOM1O60784 492 aa26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 DEPDC5O75140 1603 aa26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC3-207ENST00000497251 ERVK-7P63135 1459 aa26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 SOCS7O14512 581 aa26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 ERBINQ96RT1 1412 aa26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 KIF15Q9NS87 1388 aa26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 ILDR2Q71H61 639 aa26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 ABCC5O15440 1437 aa26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC3-207ENST00000497251 KANK1Q14678 1352 aa26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC3-207ENST00000497251 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC3-207ENST00000497251 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC3-207ENST00000497251 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3-207ENST00000497251 IQGAP1P46940 1657 aa26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3-207ENST00000497251 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3-207ENST00000497251 DAPK1P53355 1430 aa26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3-207ENST00000497251 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3-207ENST00000497251 EID1Q9Y6B2 187 aa26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC3-207ENST00000497251 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC3-207ENST00000497251 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC3-207ENST00000497251 PIP4K2BP78356 416 aa26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC3-207ENST00000497251 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC3-207ENST00000497251 CEP152O94986 1710 aa26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC3-207ENST00000497251 SLIT1O75093 1534 aa26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC3-207ENST00000497251 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC3-207ENST00000497251 HSPA1LP34931 641 aa26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC3-207ENST00000497251 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC3-207ENST00000497251 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC3-207ENST00000497251 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC3-207ENST00000497251 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC3-207ENST00000497251 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC3-207ENST00000497251 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC3-207ENST00000497251 LTKP29376 864 aa26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC3-207ENST00000497251 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC3-207ENST00000497251 SYNMO15061 1565 aa26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC3-207ENST00000497251 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC3-207ENST00000497251 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC3-207ENST00000497251 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC3-207ENST00000497251 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC3-207ENST00000497251 ADGRL2O95490 1459 aa26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC3-207ENST00000497251 IDI1Q13907 227 aa26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC3-207ENST00000497251 NOS1P29475 1434 aa26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC3-207ENST00000497251 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC3-207ENST00000497251 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC3-207ENST00000497251 ALKQ9UM73 1620 aa26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC3-207ENST00000497251 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC3-207ENST00000497251 PIK3C2BO00750 1634 aa26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC3-207ENST00000497251 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC3-207ENST00000497251 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC3-207ENST00000497251 KCNA6P17658 529 aa26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC3-207ENST00000497251 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC3-207ENST00000497251 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC3-207ENST00000497251 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3-207ENST00000497251 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC3-207ENST00000497251 ADGRB3O60242 1522 aa25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC3-207ENST00000497251 TET3O43151 1660 aa25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC3-207ENST00000497251 ROCK1Q13464 1354 aa25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC3-207ENST00000497251 TMEM94Q12767 1356 aa25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC3-207ENST00000497251 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC3-207ENST00000497251 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC3-207ENST00000497251 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC3-207ENST00000497251 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.9■■□□□ 1.74
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