RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496565.5

LPIN3-204, Transcript of lipin 3, human

TSL 3

Gene LPIN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LPIN3-204	ENST00000496565	ATP10A	O60312	1499 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LPIN3-204	ENST00000496565	A2M	P01023	1474 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LPIN3-204	ENST00000496565	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LPIN3-204	ENST00000496565	DEPDC5	O75140	1603 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LPIN3-204	ENST00000496565	TONSL	Q96HA7	1378 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LPIN3-204	ENST00000496565	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LPIN3-204	ENST00000496565	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LPIN3-204	ENST00000496565	PKD2	Q13563	968 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LPIN3-204	ENST00000496565	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LPIN3-204	ENST00000496565	STAC3	Q96MF2	364 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LPIN3-204	ENST00000496565	RERE	Q9P2R6	1566 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LPIN3-204	ENST00000496565	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LPIN3-204	ENST00000496565	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LPIN3-204	ENST00000496565	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LPIN3-204	ENST00000496565	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LPIN3-204	ENST00000496565	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
LPIN3-204	ENST00000496565	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
LPIN3-204	ENST00000496565	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LPIN3-204	ENST00000496565	AGL	P35573	1532 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LPIN3-204	ENST00000496565	KIF3B	O15066	747 aa		13.48	□□□□□ -0.25
LPIN3-204	ENST00000496565	NEUROD1	Q13562	356 aa		13.48	□□□□□ -0.25
LPIN3-204	ENST00000496565	TET3	O43151	1660 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LPIN3-204	ENST00000496565	RAPGEF3	O95398	923 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LPIN3-204	ENST00000496565	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		13.46	□□□□□ -0.25
LPIN3-204	ENST00000496565	TSPOAP1	O95153	1857 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
LPIN3-204	ENST00000496565	ABCA6	Q8N139	1617 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LPIN3-204	ENST00000496565	PTPRT	O14522	1441 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LPIN3-204	ENST00000496565	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LPIN3-204	ENST00000496565	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		13.45	□□□□□ -0.26
LPIN3-204	ENST00000496565	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		13.44	□□□□□ -0.26
LPIN3-204	ENST00000496565	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		13.43	□□□□□ -0.26
LPIN3-204	ENST00000496565	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	13.43	□□□□□ -0.26	6e-7	■□□□□ 11.2
LPIN3-204	ENST00000496565	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
LPIN3-204	ENST00000496565	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LPIN3-204	ENST00000496565	TRPM2	O94759	1503 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LPIN3-204	ENST00000496565	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LPIN3-204	ENST00000496565	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LPIN3-204	ENST00000496565	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LPIN3-204	ENST00000496565	FOXD1	Q16676	465 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LPIN3-204	ENST00000496565	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LPIN3-204	ENST00000496565	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LPIN3-204	ENST00000496565	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		13.38	□□□□□ -0.27
LPIN3-204	ENST00000496565		E9PCH4	1651 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LPIN3-204	ENST00000496565	PLA2R1	Q13018	1463 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LPIN3-204	ENST00000496565	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		13.37	□□□□□ -0.27
LPIN3-204	ENST00000496565	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		13.36	□□□□□ -0.27
LPIN3-204	ENST00000496565	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
LPIN3-204	ENST00000496565	ABCC3	O15438	1527 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LPIN3-204	ENST00000496565	GGT6	Q6P531	493 aa		13.35	□□□□□ -0.27
LPIN3-204	ENST00000496565	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		13.34	□□□□□ -0.27
LPIN3-204	ENST00000496565	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		13.32	□□□□□ -0.28
LPIN3-204	ENST00000496565	NOS1	P29475	1434 aa		13.31	□□□□□ -0.28
LPIN3-204	ENST00000496565	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		13.31	□□□□□ -0.28
LPIN3-204	ENST00000496565	NPAT	Q14207	1427 aa		13.3	□□□□□ -0.28
LPIN3-204	ENST00000496565	CEP152	O94986	1710 aa		13.3	□□□□□ -0.28
LPIN3-204	ENST00000496565	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		13.3	□□□□□ -0.28
LPIN3-204	ENST00000496565	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	13.29	□□□□□ -0.28
LPIN3-204	ENST00000496565	KIF1B	O60333	1816 aa		13.28	□□□□□ -0.28
LPIN3-204	ENST00000496565	SLC24A1	O60721	1099 aa		13.28	□□□□□ -0.28
LPIN3-204	ENST00000496565	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LPIN3-204	ENST00000496565	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
LPIN3-204	ENST00000496565	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		13.27	□□□□□ -0.29
LPIN3-204	ENST00000496565	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
LPIN3-204	ENST00000496565	CLTCL1	P53675	1640 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LPIN3-204	ENST00000496565	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LPIN3-204	ENST00000496565	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LPIN3-204	ENST00000496565	PIK3C2B	O00750	1634 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LPIN3-204	ENST00000496565	MYOM2	P54296	1465 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LPIN3-204	ENST00000496565	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LPIN3-204	ENST00000496565	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
LPIN3-204	ENST00000496565	MROH2A	A6NES4	1674 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LPIN3-204	ENST00000496565	LAMC1	P11047	1609 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LPIN3-204	ENST00000496565	ZFYVE9	O95405	1425 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LPIN3-204	ENST00000496565	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LPIN3-204	ENST00000496565	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LPIN3-204	ENST00000496565	ADGRB3	O60242	1522 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LPIN3-204	ENST00000496565	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LPIN3-204	ENST00000496565	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
LPIN3-204	ENST00000496565	RGL3	Q3MIN7	710 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LPIN3-204	ENST00000496565	ERVK-7	P63135	1459 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LPIN3-204	ENST00000496565	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		13.2	□□□□□ -0.3
LPIN3-204	ENST00000496565	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
LPIN3-204	ENST00000496565	ZMYM3	Q14202	1370 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LPIN3-204	ENST00000496565	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LPIN3-204	ENST00000496565	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
LPIN3-204	ENST00000496565	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		13.17	□□□□□ -0.3
LPIN3-204	ENST00000496565	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		13.17	□□□□□ -0.3
LPIN3-204	ENST00000496565	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		13.17	□□□□□ -0.3
LPIN3-204	ENST00000496565	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
LPIN3-204	ENST00000496565	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
LPIN3-204	ENST00000496565	SYNM	O15061	1565 aa		13.16	□□□□□ -0.3
LPIN3-204	ENST00000496565	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
LPIN3-204	ENST00000496565	IDI1	Q13907	227 aa		13.16	□□□□□ -0.3
LPIN3-204	ENST00000496565	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		13.16	□□□□□ -0.3
LPIN3-204	ENST00000496565	IFT172	Q9UG01	1749 aa		13.16	□□□□□ -0.3
LPIN3-204	ENST00000496565	USP47	Q96K76	1375 aa		13.15	□□□□□ -0.3
LPIN3-204	ENST00000496565	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
LPIN3-204	ENST00000496565	MADD	Q8WXG6	1647 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LPIN3-204	ENST00000496565	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	13.14	□□□□□ -0.31

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