RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496187.5

CCZ1B-213, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-213ENST00000496187 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP42.34■■■■■ 4.37
CCZ1B-213ENST00000496187 DAPK1P53355 1430 aa42.33■■■■■ 4.37
CCZ1B-213ENST00000496187 DUOX2Q9NRD8 1548 aa42.32■■■■■ 4.37
CCZ1B-213ENST00000496187 PTPRKQ15262 1439 aa42.3■■■■■ 4.36
CCZ1B-213ENST00000496187 DMRT2Q9Y5R5 561 aa42.28■■■■■ 4.36
CCZ1B-213ENST00000496187 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP42.27■■■■■ 4.36
CCZ1B-213ENST00000496187 KIF15Q9NS87 1388 aa42.27■■■■■ 4.36
CCZ1B-213ENST00000496187 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
CCZ1B-213ENST00000496187 MYO3AQ8NEV4 1616 aa42.22■■■■■ 4.35
CCZ1B-213ENST00000496187 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa42.21■■■■■ 4.35
CCZ1B-213ENST00000496187 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa42.21■■■■■ 4.35
CCZ1B-213ENST00000496187 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.34
CCZ1B-213ENST00000496187 ERBINQ96RT1 1412 aa42.19■■■■■ 4.34
CCZ1B-213ENST00000496187 PZPP20742 1482 aa42.18■■■■■ 4.34
CCZ1B-213ENST00000496187 STRCQ7RTU9 1775 aa42.16■■■■■ 4.34
CCZ1B-213ENST00000496187 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP42.16■■■■■ 4.34
CCZ1B-213ENST00000496187 CHIC2Q9UKJ5 165 aa42.14■■■■■ 4.34
CCZ1B-213ENST00000496187 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP42.13■■■■■ 4.33
CCZ1B-213ENST00000496187 TNRQ92752 1358 aa42.11■■■■■ 4.33
CCZ1B-213ENST00000496187 ABCC3O15438 1527 aa42.1■■■■■ 4.33
CCZ1B-213ENST00000496187 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa42.09■■■■■ 4.33
CCZ1B-213ENST00000496187 NCOA1Q15788 1441 aa42.09■■■■■ 4.33
CCZ1B-213ENST00000496187 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP42.08■■■■■ 4.33
CCZ1B-213ENST00000496187 MROH1Q8NDA8 1641 aa42.06■■■■■ 4.32
CCZ1B-213ENST00000496187 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP42.05■■■■■ 4.32
CCZ1B-213ENST00000496187 A2ML1A8K2U0 1454 aa42.04■■■■■ 4.32
CCZ1B-213ENST00000496187 PTPRTO14522 1441 aa42.04■■■■■ 4.32
CCZ1B-213ENST00000496187 ADGRL2O95490 1459 aa42.03■■■■■ 4.32
CCZ1B-213ENST00000496187 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP42.02■■■■■ 4.32
CCZ1B-213ENST00000496187 KANK1Q14678 1352 aa42.01■■■■■ 4.32
CCZ1B-213ENST00000496187 PLA2R1Q13018 1463 aa42■■■■■ 4.31
CCZ1B-213ENST00000496187 CEP152O94986 1710 aa42■■■■■ 4.31
CCZ1B-213ENST00000496187 PKD2Q13563 968 aa41.96■■■■■ 4.31
CCZ1B-213ENST00000496187 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.96■■■■■ 4.31
CCZ1B-213ENST00000496187 NLRP1Q9C000 1473 aa41.96■■■■■ 4.31
CCZ1B-213ENST00000496187 DEPDC5O75140 1603 aa41.95■■■■■ 4.31
CCZ1B-213ENST00000496187 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
CCZ1B-213ENST00000496187 FBXO41Q8TF61 875 aa41.93■■■■■ 4.3
CCZ1B-213ENST00000496187 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.89■■■■■ 4.3
CCZ1B-213ENST00000496187 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.88■■■■■ 4.29
CCZ1B-213ENST00000496187 ERVK-7P63135 1459 aa41.87■■■■■ 4.29
CCZ1B-213ENST00000496187 CERKQ8TCT0 537 aa41.86■■■■■ 4.29
CCZ1B-213ENST00000496187 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.86■■■■■ 4.29
CCZ1B-213ENST00000496187 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.86■■■■■ 4.29
CCZ1B-213ENST00000496187 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.84■■■■■ 4.29
CCZ1B-213ENST00000496187 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.84■■■■■ 4.29
CCZ1B-213ENST00000496187 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
CCZ1B-213ENST00000496187 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.82■■■■■ 4.29
CCZ1B-213ENST00000496187 ROCK1Q13464 1354 aa41.8■■■■■ 4.28
CCZ1B-213ENST00000496187 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.77■■■■■ 4.28
CCZ1B-213ENST00000496187 ITGAEP38570 1179 aa41.75■■■■■ 4.27
CCZ1B-213ENST00000496187 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.75■■■■■ 4.27
CCZ1B-213ENST00000496187 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP41.75■■■■■ 4.27
CCZ1B-213ENST00000496187 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.72■■■■■ 4.27
CCZ1B-213ENST00000496187 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.64■■■■■ 4.26
CCZ1B-213ENST00000496187 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
CCZ1B-213ENST00000496187 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.59■■■■■ 4.25
CCZ1B-213ENST00000496187 UNC13BO14795 1591 aa41.59■■■■■ 4.25
CCZ1B-213ENST00000496187 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.58■■■■■ 4.25
CCZ1B-213ENST00000496187 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.58■■■■■ 4.25
CCZ1B-213ENST00000496187 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.57■■■■■ 4.25
CCZ1B-213ENST00000496187 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
CCZ1B-213ENST00000496187 TET3O43151 1660 aa41.55■■■■■ 4.24
CCZ1B-213ENST00000496187 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
CCZ1B-213ENST00000496187 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.53■■■■■ 4.24
CCZ1B-213ENST00000496187 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
CCZ1B-213ENST00000496187 MED14O60244 1454 aa41.52■■■■■ 4.24
CCZ1B-213ENST00000496187 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.5■■■■■ 4.23
CCZ1B-213ENST00000496187 PIK3C2BO00750 1634 aa41.5■■■■■ 4.23
CCZ1B-213ENST00000496187 NOS1P29475 1434 aa41.48■■■■■ 4.23
CCZ1B-213ENST00000496187 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
CCZ1B-213ENST00000496187 IQGAP1P46940 1657 aa41.46■■■■■ 4.23
CCZ1B-213ENST00000496187 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.46■■■■■ 4.23
CCZ1B-213ENST00000496187 EID1Q9Y6B2 187 aa41.46■■■■■ 4.23
CCZ1B-213ENST00000496187 SYNMO15061 1565 aa41.45■■■■■ 4.23
CCZ1B-213ENST00000496187 IQGAP3Q86VI3 1631 aa41.44■■■■■ 4.22
CCZ1B-213ENST00000496187 SLIT1O75093 1534 aa41.44■■■■■ 4.22
CCZ1B-213ENST00000496187 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP41.43■■■■■ 4.22
CCZ1B-213ENST00000496187 IDI1Q13907 227 aa41.43■■■■■ 4.22
CCZ1B-213ENST00000496187 NUP155O75694 1391 aa41.42■■■■■ 4.22
CCZ1B-213ENST00000496187 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.41■■■■■ 4.22
CCZ1B-213ENST00000496187 TXNDC2Q86VQ3 553 aa41.39■■■■■ 4.22
CCZ1B-213ENST00000496187 TMEM2Q9UHN6 1383 aa41.37■■■■■ 4.21
CCZ1B-213ENST00000496187 CPS1P31327 1500 aa41.36■■■■■ 4.21
CCZ1B-213ENST00000496187 ADGRB3O60242 1522 aa41.34■■■■■ 4.21
CCZ1B-213ENST00000496187 E9PCH4 1651 aa41.32■■■■■ 4.2
CCZ1B-213ENST00000496187 LTKP29376 864 aa41.29■■■■■ 4.2
CCZ1B-213ENST00000496187 NAIPQ13075 1403 aa41.26■■■■■ 4.19
CCZ1B-213ENST00000496187 HDGFP51858 240 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
CCZ1B-213ENST00000496187 HFM1A2PYH4 1435 aa41.2■■■■■ 4.19
CCZ1B-213ENST00000496187 UBAP1LF5GYI3 381 aa41.19■■■■■ 4.18
CCZ1B-213ENST00000496187 CHGAP10645 457 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
CCZ1B-213ENST00000496187 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa41.13■■■■■ 4.17
CCZ1B-213ENST00000496187 MYO5BQ9ULV0 1848 aa41.12■■■■■ 4.17
CCZ1B-213ENST00000496187 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
CCZ1B-213ENST00000496187 BCANQ96GW7 911 aa41.11■■■■■ 4.17
CCZ1B-213ENST00000496187 TRIM52Q96A61 297 aa41.1■■■■■ 4.17
CCZ1B-213ENST00000496187 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa41.08■■■■■ 4.17
CCZ1B-213ENST00000496187 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP41.07■■■■■ 4.17
CCZ1B-213ENST00000496187 RIMS2Q9UQ26 1411 aa41.07■■■■■ 4.16
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