RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 CCDC7Q96M83 1385 aa23.38■■□□□ 1.33
TOM1-216ENST00000492723 CCER2I3L3R5 266 aa23.38■■□□□ 1.33
TOM1-216ENST00000492723 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.38■■□□□ 1.33
TOM1-216ENST00000492723 PLA2R1Q13018 1463 aa23.38■■□□□ 1.33
TOM1-216ENST00000492723 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.37■■□□□ 1.33
TOM1-216ENST00000492723 ATP7AQ04656 1500 aa23.36■■□□□ 1.33
TOM1-216ENST00000492723 USP47Q96K76 1375 aa23.35■■□□□ 1.33
TOM1-216ENST00000492723 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
TOM1-216ENST00000492723 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.34■■□□□ 1.33
TOM1-216ENST00000492723 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.32■■□□□ 1.32
TOM1-216ENST00000492723 RGL3Q3MIN7 710 aa23.31■■□□□ 1.32
TOM1-216ENST00000492723 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.31■■□□□ 1.32
TOM1-216ENST00000492723 CD109Q6YHK3 1445 aa23.3■■□□□ 1.32
TOM1-216ENST00000492723 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.3■■□□□ 1.32
TOM1-216ENST00000492723 KDM5CP41229 1560 aa23.29■■□□□ 1.32
TOM1-216ENST00000492723 ATP10AO60312 1499 aa23.28■■□□□ 1.32
TOM1-216ENST00000492723 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
TOM1-216ENST00000492723 DEPDC5O75140 1603 aa23.25■■□□□ 1.31
TOM1-216ENST00000492723 KIF3BO15066 747 aa23.25■■□□□ 1.31
TOM1-216ENST00000492723 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.25■■□□□ 1.31
TOM1-216ENST00000492723 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TOM1-216ENST00000492723 A2MP01023 1474 aa23.23■■□□□ 1.31
TOM1-216ENST00000492723 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.23■■□□□ 1.31
TOM1-216ENST00000492723 E9PCH4 1651 aa23.23■■□□□ 1.31
TOM1-216ENST00000492723 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.23■■□□□ 1.31
TOM1-216ENST00000492723 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TOM1-216ENST00000492723 KANK1Q14678 1352 aa23.23■■□□□ 1.31
TOM1-216ENST00000492723 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.22■■□□□ 1.31
TOM1-216ENST00000492723 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.21■■□□□ 1.31
TOM1-216ENST00000492723 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.2■■□□□ 1.3
TOM1-216ENST00000492723 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
TOM1-216ENST00000492723 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.18■■□□□ 1.3
TOM1-216ENST00000492723 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.18■■□□□ 1.3
TOM1-216ENST00000492723 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.17■■□□□ 1.3
TOM1-216ENST00000492723 TET3O43151 1660 aa23.17■■□□□ 1.3
TOM1-216ENST00000492723 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.17■■□□□ 1.3
TOM1-216ENST00000492723 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.16■■□□□ 1.3
TOM1-216ENST00000492723 TRPM2O94759 1503 aa23.15■■□□□ 1.3
TOM1-216ENST00000492723 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
TOM1-216ENST00000492723 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
TOM1-216ENST00000492723 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
TOM1-216ENST00000492723 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.14■■□□□ 1.29
TOM1-216ENST00000492723 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.14■■□□□ 1.29
TOM1-216ENST00000492723 PTPRTO14522 1441 aa23.13■■□□□ 1.29
TOM1-216ENST00000492723 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.13■■□□□ 1.29
TOM1-216ENST00000492723 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.1■■□□□ 1.29
TOM1-216ENST00000492723 NEO1Q92859 1461 aa23.1■■□□□ 1.29
TOM1-216ENST00000492723 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.09■■□□□ 1.29
TOM1-216ENST00000492723 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.09■■□□□ 1.29
TOM1-216ENST00000492723 CLTCL1P53675 1640 aa23.09■■□□□ 1.29
TOM1-216ENST00000492723 CEP152O94986 1710 aa23.07■■□□□ 1.28
TOM1-216ENST00000492723 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.07■■□□□ 1.28
TOM1-216ENST00000492723 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.07■■□□□ 1.28
TOM1-216ENST00000492723 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.07■■□□□ 1.28
TOM1-216ENST00000492723 RAPGEF3O95398 923 aa23.07■■□□□ 1.28
TOM1-216ENST00000492723 CCDC184Q52MB2 194 aa23.04■■□□□ 1.28
TOM1-216ENST00000492723 LAMC1P11047 1609 aa23.04■■□□□ 1.28
TOM1-216ENST00000492723 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.04■■□□□ 1.28
TOM1-216ENST00000492723 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.04■■□□□ 1.28
TOM1-216ENST00000492723 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
TOM1-216ENST00000492723 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
TOM1-216ENST00000492723 ABCA6Q8N139 1617 aa23.02■■□□□ 1.28
TOM1-216ENST00000492723 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.02■■□□□ 1.28
TOM1-216ENST00000492723 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
TOM1-216ENST00000492723 GGT6Q6P531 493 aa23.01■■□□□ 1.27
TOM1-216ENST00000492723 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23■■□□□ 1.27
TOM1-216ENST00000492723 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
TOM1-216ENST00000492723 MRS2Q9HD23 443 aa23■■□□□ 1.27
TOM1-216ENST00000492723 MADDQ8WXG6 1647 aa23■■□□□ 1.27
TOM1-216ENST00000492723 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
TOM1-216ENST00000492723 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.98■■□□□ 1.27
TOM1-216ENST00000492723 STAC3Q96MF2 364 aa22.97■■□□□ 1.27
TOM1-216ENST00000492723 GLI2P10070 1586 aa22.97■■□□□ 1.27
TOM1-216ENST00000492723 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.94■■□□□ 1.26
TOM1-216ENST00000492723 TESK2Q96S53 571 aa22.94■■□□□ 1.26
TOM1-216ENST00000492723 RICTORQ6R327 1708 aa22.94■■□□□ 1.26
TOM1-216ENST00000492723 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.94■■□□□ 1.26
TOM1-216ENST00000492723 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.93■■□□□ 1.26
TOM1-216ENST00000492723 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.93■■□□□ 1.26
TOM1-216ENST00000492723 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.93■■□□□ 1.26
TOM1-216ENST00000492723 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TOM1-216ENST00000492723 KIF1BO60333 1816 aa22.91■■□□□ 1.26
TOM1-216ENST00000492723 NPATQ14207 1427 aa22.91■■□□□ 1.26
TOM1-216ENST00000492723 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.91■■□□□ 1.26
TOM1-216ENST00000492723 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TOM1-216ENST00000492723 ABCC3O15438 1527 aa22.89■■□□□ 1.25
TOM1-216ENST00000492723 DIP2BQ9P265 1576 aa22.88■■□□□ 1.25
TOM1-216ENST00000492723 TMF1P82094 1093 aa22.88■■□□□ 1.25
TOM1-216ENST00000492723 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.87■■□□□ 1.25
TOM1-216ENST00000492723 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
TOM1-216ENST00000492723 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
TOM1-216ENST00000492723 IQGAP1P46940 1657 aa22.86■■□□□ 1.25
TOM1-216ENST00000492723 MROH2AA6NES4 1674 aa22.85■■□□□ 1.25
TOM1-216ENST00000492723 MYOM2P54296 1465 aa22.85■■□□□ 1.25
TOM1-216ENST00000492723 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
TOM1-216ENST00000492723 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.84■■□□□ 1.25
TOM1-216ENST00000492723 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.83■■□□□ 1.24
TOM1-216ENST00000492723 ADGRB3O60242 1522 aa22.82■■□□□ 1.24
TOM1-216ENST00000492723 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.82■■□□□ 1.24
TOM1-216ENST00000492723 TSPOAP1O95153 1857 aa22.81■■□□□ 1.24
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