RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.42■■□□□ 1.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 USP47Q96K76 1375 aa21.42■■□□□ 1.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.4■■□□□ 1.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.4■■□□□ 1.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.39■■□□□ 1.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASXL2Q76L83 1435 aa21.37■■□□□ 1.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIF3BO15066 747 aa21.37■■□□□ 1.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.37■■□□□ 1.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.36■■□□□ 1.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.35■■□□□ 1.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.35■■□□□ 1.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLA2R1Q13018 1463 aa21.34■■□□□ 1.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.34■■□□□ 1.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.33■■□□□ 1.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FANCAO15360 1455 aa21.33■■□□□ 1.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.32■■□□□ 1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.32■■□□□ 1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABCC1P33527 1531 aa21.32■■□□□ 1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.3■■□□□ 1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRS2Q9HD23 443 aa21.3■■□□□ 1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAPGEF3O95398 923 aa21.28■■□□□ 1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADGRL1O94910 1474 aa21.27■■□□□ 1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GGT6Q6P531 493 aa21.25■□□□□ 0.99
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.25■□□□□ 0.99
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.23■□□□□ 0.99
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A2MP01023 1474 aa21.21■□□□□ 0.99
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.2■□□□□ 0.98
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KDM5CP41229 1560 aa21.19■□□□□ 0.98
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLXNC1O60486 1568 aa21.19■□□□□ 0.98
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.19■□□□□ 0.98
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UNC13BO14795 1591 aa21.18■□□□□ 0.98
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UGGT1Q9NYU2 1555 aa21.17■□□□□ 0.98
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.16■□□□□ 0.98
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD109Q6YHK3 1445 aa21.16■□□□□ 0.98
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ERBINQ96RT1 1412 aa21.16■□□□□ 0.98
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.15■□□□□ 0.98
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP7AQ04656 1500 aa21.15■□□□□ 0.98
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.14■□□□□ 0.97
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.13■□□□□ 0.97
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.12■□□□□ 0.97
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 E9PCH4 1651 aa21.11■□□□□ 0.97
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.09■□□□□ 0.97
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP10AO60312 1499 aa21.08■□□□□ 0.96
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.05■□□□□ 0.96
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KANK1Q14678 1352 aa21.04■□□□□ 0.96
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa21.04■□□□□ 0.96
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.04■□□□□ 0.96
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MSH5O43196 834 aa21.03■□□□□ 0.96
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TESK2Q96S53 571 aa21.03■□□□□ 0.96
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.03■□□□□ 0.96
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.03■□□□□ 0.96
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.02■□□□□ 0.96
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMC1Q8TDI8 760 aa21.02■□□□□ 0.96
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.01■□□□□ 0.95
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLTCL1P53675 1640 aa21.01■□□□□ 0.95
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PANK3Q9H999 370 aa21■□□□□ 0.95
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21■□□□□ 0.95
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21■□□□□ 0.95
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MLECQ14165 292 aa20.97■□□□□ 0.95
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.97■□□□□ 0.95
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.96■□□□□ 0.95
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.96■□□□□ 0.95
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CEP152O94986 1710 aa20.96■□□□□ 0.95
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSPOAP1O95153 1857 aa20.95■□□□□ 0.94
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.95■□□□□ 0.94
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.94■□□□□ 0.94
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MROH1Q8NDA8 1641 aa20.94■□□□□ 0.94
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.94■□□□□ 0.94
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.93■□□□□ 0.94
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.92■□□□□ 0.94
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMF1P82094 1093 aa20.91■□□□□ 0.94
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.91■□□□□ 0.94
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.91■□□□□ 0.94
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRPM2O94759 1503 aa20.9■□□□□ 0.94
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TET3O43151 1660 aa20.89■□□□□ 0.93
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DEPDC5O75140 1603 aa20.89■□□□□ 0.93
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTPRTO14522 1441 aa20.88■□□□□ 0.93
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.88■□□□□ 0.93
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPRASP1Q5JY77 1395 aa20.88■□□□□ 0.93
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.87■□□□□ 0.93
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABCA6Q8N139 1617 aa20.87■□□□□ 0.93
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPATQ14207 1427 aa20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms