RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 ZNF687Q8N1G0 1237 aa10.78□□□□□ -0.68
CCL20-204ENST00000489160 NUTM2FA1L443 756 aa10.77□□□□□ -0.69
CCL20-204ENST00000489160 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
CCL20-204ENST00000489160 BCL2L12Q9HB09 334 aa10.76□□□□□ -0.69
CCL20-204ENST00000489160 POTEB3A0JP26 581 aa10.75□□□□□ -0.69
CCL20-204ENST00000489160 GPR37O15354 613 aa10.75□□□□□ -0.69
CCL20-204ENST00000489160 POTEBQ6S5H4 581 aa10.75□□□□□ -0.69
CCL20-204ENST00000489160 ADAM33Q9BZ11 813 aa10.75□□□□□ -0.69
CCL20-204ENST00000489160 MAP3K7O43318 606 aa10.74□□□□□ -0.69
CCL20-204ENST00000489160 PBX2P40425 430 aa10.74□□□□□ -0.69
CCL20-204ENST00000489160 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
CCL20-204ENST00000489160 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
CCL20-204ENST00000489160 KCNH8Q96L42 1107 aa10.73□□□□□ -0.69
CCL20-204ENST00000489160 PTPREP23469 700 aa10.72□□□□□ -0.69
CCL20-204ENST00000489160 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa10.72□□□□□ -0.69
CCL20-204ENST00000489160 AK7Q96M32 723 aa10.72□□□□□ -0.69
CCL20-204ENST00000489160 FCHSD2O94868 740 aa10.71□□□□□ -0.69
CCL20-204ENST00000489160 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
CCL20-204ENST00000489160 ARHGAP33O14559 1287 aa10.7□□□□□ -0.7
CCL20-204ENST00000489160 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CCL20-204ENST00000489160 HIC1Q14526 733 aa10.69□□□□□ -0.7
CCL20-204ENST00000489160 GNPATO15228 680 aa10.68□□□□□ -0.7
CCL20-204ENST00000489160 CERKQ8TCT0 537 aa10.68□□□□□ -0.7
CCL20-204ENST00000489160 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa10.67□□□□□ -0.7
CCL20-204ENST00000489160 PTGDRQ13258 359 aa10.67□□□□□ -0.7
CCL20-204ENST00000489160 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
CCL20-204ENST00000489160 KCNK17Q96T54 332 aa10.67□□□□□ -0.7
CCL20-204ENST00000489160 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
CCL20-204ENST00000489160 MAP2K5Q13163 448 aa10.66□□□□□ -0.7
CCL20-204ENST00000489160 NEUROD2Q15784 382 aa10.66□□□□□ -0.7
CCL20-204ENST00000489160 POTEEQ6S8J3 1075 aa10.66□□□□□ -0.7
CCL20-204ENST00000489160 PSEN2P49810 448 aa10.64□□□□□ -0.71
CCL20-204ENST00000489160 AXIN2Q9Y2T1 843 aa10.64□□□□□ -0.71
CCL20-204ENST00000489160 CDHR5Q9HBB8 845 aa10.63□□□□□ -0.71
CCL20-204ENST00000489160 TRIM66O15016 1216 aa10.62□□□□□ -0.71
CCL20-204ENST00000489160 COL9A1P20849 921 aa10.62□□□□□ -0.71
CCL20-204ENST00000489160 TMEM132AQ24JP5 1023 aa10.62□□□□□ -0.71
CCL20-204ENST00000489160 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CCL20-204ENST00000489160 IRF6O14896 467 aa10.61□□□□□ -0.71
CCL20-204ENST00000489160 SLC4A5Q9BY07 1137 aa10.61□□□□□ -0.71
CCL20-204ENST00000489160 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CCL20-204ENST00000489160 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP10.6□□□□□ -0.71
CCL20-204ENST00000489160 ZBED2Q9BTP6 218 aa10.6□□□□□ -0.71
CCL20-204ENST00000489160 FECHP22830 423 aa10.59□□□□□ -0.71
CCL20-204ENST00000489160 PRSS12P56730 875 aa10.59□□□□□ -0.71
CCL20-204ENST00000489160 DMRTA1Q5VZB9 504 aa10.59□□□□□ -0.71
CCL20-204ENST00000489160 CCDC102AQ96A19 550 aa10.59□□□□□ -0.71
CCL20-204ENST00000489160 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CCL20-204ENST00000489160 TK2O00142 265 aa10.58□□□□□ -0.72
CCL20-204ENST00000489160 PDE4DQ08499 809 aa10.58□□□□□ -0.72
CCL20-204ENST00000489160 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa10.58□□□□□ -0.72
CCL20-204ENST00000489160 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa10.58□□□□□ -0.72
CCL20-204ENST00000489160 CDCA7LQ96GN5 454 aa10.57□□□□□ -0.72
CCL20-204ENST00000489160 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa10.55□□□□□ -0.72
CCL20-204ENST00000489160 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa10.54□□□□□ -0.72
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CCL20-204ENST00000489160 SPNS2Q8IVW8 549 aa10.54□□□□□ -0.72
CCL20-204ENST00000489160 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa10.54□□□□□ -0.72
CCL20-204ENST00000489160 MMRN1Q13201 1228 aa10.53□□□□□ -0.72
CCL20-204ENST00000489160 AMHR2Q16671 573 aa10.53□□□□□ -0.72
CCL20-204ENST00000489160 PROX2Q3B8N5 592 aa10.53□□□□□ -0.72
CCL20-204ENST00000489160 TTC13Q8NBP0 860 aa10.53□□□□□ -0.72
CCL20-204ENST00000489160 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
CCL20-204ENST00000489160 ADGRD1Q6QNK2 874 aa10.52□□□□□ -0.73
CCL20-204ENST00000489160 PADI6Q6TGC4 694 aa10.52□□□□□ -0.73
CCL20-204ENST00000489160 KDM4CQ9H3R0 1056 aa10.52□□□□□ -0.73
CCL20-204ENST00000489160 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
CCL20-204ENST00000489160 RABGEF1Q9UJ41 708 aa10.51□□□□□ -0.73
CCL20-204ENST00000489160 TSKSQ9UJT2 592 aa10.51□□□□□ -0.73
CCL20-204ENST00000489160 KIAA1468Q9P260 1216 aa10.5□□□□□ -0.73
CCL20-204ENST00000489160 FAM198AQ9UFP1 575 aa10.49□□□□□ -0.73
CCL20-204ENST00000489160 NBPF26B4DH59 902 aa10.48□□□□□ -0.73
CCL20-204ENST00000489160 STAC3Q96MF2 364 aa10.48□□□□□ -0.73
CCL20-204ENST00000489160 NBPF3Q9H094 633 aa10.48□□□□□ -0.73
CCL20-204ENST00000489160 HRO43593 1189 aa10.47□□□□□ -0.73
CCL20-204ENST00000489160 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
CCL20-204ENST00000489160 OATP04181 439 aa10.46□□□□□ -0.73
CCL20-204ENST00000489160 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
CCL20-204ENST00000489160 PARP9Q8IXQ6 854 aa10.46□□□□□ -0.73
CCL20-204ENST00000489160 TATDN2Q93075 761 aa10.46□□□□□ -0.73
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CCL20-204ENST00000489160 NUDT18Q6ZVK8 323 aa10.44□□□□□ -0.74
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CCL20-204ENST00000489160 ADGRG1Q9Y653 693 aa10.44□□□□□ -0.74
CCL20-204ENST00000489160 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CCL20-204ENST00000489160 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa10.43□□□□□ -0.74
CCL20-204ENST00000489160 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
CCL20-204ENST00000489160 IL27Q8NEV9 243 aa10.42□□□□□ -0.74
CCL20-204ENST00000489160 CLCN1P35523 988 aa10.41□□□□□ -0.74
CCL20-204ENST00000489160 FAM161AQ3B820 660 aa10.41□□□□□ -0.74
CCL20-204ENST00000489160 EYA1Q99502 592 aa10.41□□□□□ -0.74
CCL20-204ENST00000489160 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
CCL20-204ENST00000489160 PXYLP1Q8TE99 480 aa10.4□□□□□ -0.74
CCL20-204ENST00000489160 DDRGK1Q96HY6 314 aa10.4□□□□□ -0.74
CCL20-204ENST00000489160 PHOX2BQ99453 314 aa10.4□□□□□ -0.74
CCL20-204ENST00000489160 GOLGA8CPA6NN73 597 aa10.39□□□□□ -0.75
CCL20-204ENST00000489160 C3orf80F5H4A9 247 aa10.39□□□□□ -0.75
CCL20-204ENST00000489160 SMAPO00193 183 aa10.39□□□□□ -0.75
CCL20-204ENST00000489160 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
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