RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488905.1

HDAC6-231, Transcript of histone deacetylase 6, human

TSL 4

Gene HDAC6, Length 492 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC6-231	ENST00000488905	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		29.3	■■■□□ 2.28
HDAC6-231	ENST00000488905	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		29.29	■■■□□ 2.28
HDAC6-231	ENST00000488905	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		29.29	■■■□□ 2.28
HDAC6-231	ENST00000488905	PZP	P20742	1482 aa		29.29	■■■□□ 2.28
HDAC6-231	ENST00000488905	KIF3B	O15066	747 aa		29.28	■■■□□ 2.28
HDAC6-231	ENST00000488905	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	29.28	■■■□□ 2.28
HDAC6-231	ENST00000488905	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		29.27	■■■□□ 2.28
HDAC6-231	ENST00000488905	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	29.27	■■■□□ 2.28
HDAC6-231	ENST00000488905	PKD2	Q13563	968 aa		29.24	■■■□□ 2.27
HDAC6-231	ENST00000488905	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
HDAC6-231	ENST00000488905	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
HDAC6-231	ENST00000488905	TSPY4	P0CV99	314 aa		29.22	■■■□□ 2.27
HDAC6-231	ENST00000488905	TSPY10	P0CW01	314 aa		29.22	■■■□□ 2.27
HDAC6-231	ENST00000488905	TNR	Q92752	1358 aa		29.22	■■■□□ 2.27
HDAC6-231	ENST00000488905	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		29.2	■■■□□ 2.27
HDAC6-231	ENST00000488905	MIA2	Q96PC5	1412 aa		29.19	■■■□□ 2.26
HDAC6-231	ENST00000488905	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
HDAC6-231	ENST00000488905	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
HDAC6-231	ENST00000488905	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		29.18	■■■□□ 2.26
HDAC6-231	ENST00000488905	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		29.17	■■■□□ 2.26
HDAC6-231	ENST00000488905	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		29.16	■■■□□ 2.26
HDAC6-231	ENST00000488905	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	29.16	■■■□□ 2.26
HDAC6-231	ENST00000488905	ABCC3	O15438	1527 aa		29.15	■■■□□ 2.26
HDAC6-231	ENST00000488905	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		29.13	■■■□□ 2.25
HDAC6-231	ENST00000488905	NLRP1	Q9C000	1473 aa		29.12	■■■□□ 2.25
HDAC6-231	ENST00000488905	CEP152	O94986	1710 aa		29.12	■■■□□ 2.25
HDAC6-231	ENST00000488905	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		29.09	■■■□□ 2.25
HDAC6-231	ENST00000488905	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		29.08	■■■□□ 2.25
HDAC6-231	ENST00000488905	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		29.08	■■■□□ 2.25
HDAC6-231	ENST00000488905	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		29.07	■■■□□ 2.24
HDAC6-231	ENST00000488905	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		29.06	■■■□□ 2.24
HDAC6-231	ENST00000488905	DEPDC5	O75140	1603 aa		29.05	■■■□□ 2.24
HDAC6-231	ENST00000488905	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
HDAC6-231	ENST00000488905	ERVK-7	P63135	1459 aa		29.03	■■■□□ 2.24
HDAC6-231	ENST00000488905	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	29.02	■■■□□ 2.24
HDAC6-231	ENST00000488905	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
HDAC6-231	ENST00000488905	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		29	■■■□□ 2.23
HDAC6-231	ENST00000488905	CPS1	P31327	1500 aa		28.99	■■■□□ 2.23
HDAC6-231	ENST00000488905	IQGAP1	P46940	1657 aa		28.99	■■■□□ 2.23
HDAC6-231	ENST00000488905	KIF15	Q9NS87	1388 aa		28.98	■■■□□ 2.23
HDAC6-231	ENST00000488905	MED14	O60244	1454 aa		28.97	■■■□□ 2.23
HDAC6-231	ENST00000488905	ABCC5	O15440	1437 aa		28.97	■■■□□ 2.23
HDAC6-231	ENST00000488905	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		28.97	■■■□□ 2.23
HDAC6-231	ENST00000488905	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
HDAC6-231	ENST00000488905	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		28.96	■■■□□ 2.23
HDAC6-231	ENST00000488905	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		28.96	■■■□□ 2.23
HDAC6-231	ENST00000488905	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		28.96	■■■□□ 2.23
HDAC6-231	ENST00000488905	APLP2	Q06481	763 aa		28.95	■■■□□ 2.22
HDAC6-231	ENST00000488905	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		28.95	■■■□□ 2.22
HDAC6-231	ENST00000488905	DAPK1	P53355	1430 aa		28.94	■■■□□ 2.22
HDAC6-231	ENST00000488905	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		28.94	■■■□□ 2.22
HDAC6-231	ENST00000488905	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
HDAC6-231	ENST00000488905	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		28.88	■■■□□ 2.21
HDAC6-231	ENST00000488905	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		28.86	■■■□□ 2.21
HDAC6-231	ENST00000488905	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		28.85	■■■□□ 2.21
HDAC6-231	ENST00000488905	SYNM	O15061	1565 aa		28.84	■■■□□ 2.21
HDAC6-231	ENST00000488905	ILDR2	Q71H61	639 aa		28.81	■■■□□ 2.2
HDAC6-231	ENST00000488905	PIK3C2B	O00750	1634 aa		28.8	■■■□□ 2.2
HDAC6-231	ENST00000488905	SLIT1	O75093	1534 aa		28.79	■■■□□ 2.2
HDAC6-231	ENST00000488905	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
HDAC6-231	ENST00000488905	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		28.79	■■■□□ 2.2
HDAC6-231	ENST00000488905	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		28.79	■■■□□ 2.2
HDAC6-231	ENST00000488905	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		28.78	■■■□□ 2.2
HDAC6-231	ENST00000488905	KANK1	Q14678	1352 aa		28.77	■■■□□ 2.2
HDAC6-231	ENST00000488905	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
HDAC6-231	ENST00000488905	ADGRL2	O95490	1459 aa		28.76	■■■□□ 2.19
HDAC6-231	ENST00000488905	ALK	Q9UM73	1620 aa		28.76	■■■□□ 2.19
HDAC6-231	ENST00000488905	TOM1	O60784	492 aa		28.75	■■■□□ 2.19
HDAC6-231	ENST00000488905	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	28.75	■■■□□ 2.19	1e-6	■■■■■ 28.7
HDAC6-231	ENST00000488905	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		28.74	■■■□□ 2.19
HDAC6-231	ENST00000488905	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
HDAC6-231	ENST00000488905	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		28.73	■■■□□ 2.19
HDAC6-231	ENST00000488905	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		28.72	■■■□□ 2.19
HDAC6-231	ENST00000488905	PIP4K2B	P78356	416 aa		28.71	■■■□□ 2.19
HDAC6-231	ENST00000488905	LTK	P29376	864 aa		28.66	■■■□□ 2.18
HDAC6-231	ENST00000488905	HSPA1L	P34931	641 aa		28.66	■■■□□ 2.18
HDAC6-231	ENST00000488905	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
HDAC6-231	ENST00000488905	SOCS7	O14512	581 aa		28.65	■■■□□ 2.18
HDAC6-231	ENST00000488905	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.18
HDAC6-231	ENST00000488905	ADGRB3	O60242	1522 aa		28.64	■■■□□ 2.17
HDAC6-231	ENST00000488905	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		28.63	■■■□□ 2.17
HDAC6-231	ENST00000488905	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		28.63	■■■□□ 2.17
HDAC6-231	ENST00000488905	NOS1	P29475	1434 aa		28.62	■■■□□ 2.17
HDAC6-231	ENST00000488905	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
HDAC6-231	ENST00000488905	EID1	Q9Y6B2	187 aa		28.61	■■■□□ 2.17
HDAC6-231	ENST00000488905	TET3	O43151	1660 aa		28.61	■■■□□ 2.17
HDAC6-231	ENST00000488905	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		28.6	■■■□□ 2.17
HDAC6-231	ENST00000488905	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		28.58	■■■□□ 2.17
HDAC6-231	ENST00000488905	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		28.58	■■■□□ 2.17
HDAC6-231	ENST00000488905	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
HDAC6-231	ENST00000488905	UNC13B	O14795	1591 aa		28.57	■■■□□ 2.16
HDAC6-231	ENST00000488905	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		28.57	■■■□□ 2.16
HDAC6-231	ENST00000488905	IDI1	Q13907	227 aa		28.56	■■■□□ 2.16
HDAC6-231	ENST00000488905	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		28.48	■■■□□ 2.15
HDAC6-231	ENST00000488905	NWD1	Q149M9	1564 aa		28.48	■■■□□ 2.15
HDAC6-231	ENST00000488905		E9PCH4	1651 aa		28.46	■■■□□ 2.15
HDAC6-231	ENST00000488905	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		28.45	■■■□□ 2.14
HDAC6-231	ENST00000488905	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		28.45	■■■□□ 2.14
HDAC6-231	ENST00000488905	ROCK1	Q13464	1354 aa		28.43	■■■□□ 2.14
HDAC6-231	ENST00000488905	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	28.42	■■■□□ 2.14

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