RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, human

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCZ1B-211	ENST00000486840	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	41.1	■■■■■ 4.17
CCZ1B-211	ENST00000486840	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	41.1	■■■■■ 4.17
CCZ1B-211	ENST00000486840	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		41.08	■■■■■ 4.17
CCZ1B-211	ENST00000486840	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		41.08	■■■■■ 4.17
CCZ1B-211	ENST00000486840	NPAT	Q14207	1427 aa		41.07	■■■■■ 4.16
CCZ1B-211	ENST00000486840	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		41.03	■■■■■ 4.16
CCZ1B-211	ENST00000486840	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		41.01	■■■■■ 4.16
CCZ1B-211	ENST00000486840	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		41.01	■■■■■ 4.16
CCZ1B-211	ENST00000486840	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		40.97	■■■■■ 4.15
CCZ1B-211	ENST00000486840	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	40.96	■■■■■ 4.15
CCZ1B-211	ENST00000486840	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	40.95	■■■■■ 4.15
CCZ1B-211	ENST00000486840	PTPRK	Q15262	1439 aa		40.93	■■■■■ 4.14
CCZ1B-211	ENST00000486840	ITGAE	P38570	1179 aa		40.93	■■■■■ 4.14
CCZ1B-211	ENST00000486840	NCOA1	Q15788	1441 aa		40.93	■■■■■ 4.14
CCZ1B-211	ENST00000486840	KANK1	Q14678	1352 aa		40.92	■■■■■ 4.14
CCZ1B-211	ENST00000486840	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		40.92	■■■■■ 4.14
CCZ1B-211	ENST00000486840	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	40.88	■■■■■ 4.13
CCZ1B-211	ENST00000486840	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	40.85	■■■■■ 4.13
CCZ1B-211	ENST00000486840	ADGRL2	O95490	1459 aa		40.83	■■■■■ 4.13
CCZ1B-211	ENST00000486840	PZP	P20742	1482 aa		40.83	■■■■■ 4.13
CCZ1B-211	ENST00000486840	TNR	Q92752	1358 aa		40.83	■■■■■ 4.13
CCZ1B-211	ENST00000486840	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	40.8	■■■■■ 4.12
CCZ1B-211	ENST00000486840	ABCC3	O15438	1527 aa		40.78	■■■■■ 4.12
CCZ1B-211	ENST00000486840	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	40.78	■■■■■ 4.12
CCZ1B-211	ENST00000486840	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		40.75	■■■■■ 4.11
CCZ1B-211	ENST00000486840	ROCK1	Q13464	1354 aa		40.71	■■■■■ 4.11
CCZ1B-211	ENST00000486840	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		40.71	■■■■■ 4.11
CCZ1B-211	ENST00000486840	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	40.68	■■■■■ 4.1
CCZ1B-211	ENST00000486840	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		40.67	■■■■■ 4.1
CCZ1B-211	ENST00000486840	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	40.67	■■■■■ 4.1
CCZ1B-211	ENST00000486840	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		40.67	■■■■■ 4.1
CCZ1B-211	ENST00000486840	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		40.64	■■■■■ 4.1
CCZ1B-211	ENST00000486840	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	40.64	■■■■■ 4.1
CCZ1B-211	ENST00000486840	PKD2	Q13563	968 aa		40.63	■■■■■ 4.09
CCZ1B-211	ENST00000486840	CEP152	O94986	1710 aa		40.62	■■■■■ 4.09
CCZ1B-211	ENST00000486840	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	40.62	■■■■■ 4.09
CCZ1B-211	ENST00000486840	NLRP1	Q9C000	1473 aa		40.62	■■■■■ 4.09
CCZ1B-211	ENST00000486840	DEPDC5	O75140	1603 aa		40.59	■■■■■ 4.09
CCZ1B-211	ENST00000486840	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	40.59	■■■■■ 4.09
CCZ1B-211	ENST00000486840	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		40.59	■■■■■ 4.09
CCZ1B-211	ENST00000486840	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		40.58	■■■■■ 4.09
CCZ1B-211	ENST00000486840	ERVK-7	P63135	1459 aa		40.57	■■■■■ 4.08
CCZ1B-211	ENST00000486840	PTPRT	O14522	1441 aa		40.56	■■■■■ 4.08
CCZ1B-211	ENST00000486840	PLA2R1	Q13018	1463 aa		40.54	■■■■■ 4.08
CCZ1B-211	ENST00000486840	STRC	Q7RTU9	1775 aa		40.53	■■■■■ 4.08
CCZ1B-211	ENST00000486840	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		40.52	■■■■■ 4.08
CCZ1B-211	ENST00000486840	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		40.52	■■■■■ 4.08
CCZ1B-211	ENST00000486840	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		40.5	■■■■■ 4.07
CCZ1B-211	ENST00000486840	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		40.48	■■■■■ 4.07
CCZ1B-211	ENST00000486840	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		40.48	■■■■■ 4.07
CCZ1B-211	ENST00000486840	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	40.46	■■■■■ 4.07
CCZ1B-211	ENST00000486840	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		40.43	■■■■■ 4.06
CCZ1B-211	ENST00000486840	NUP155	O75694	1391 aa		40.41	■■■■■ 4.06
CCZ1B-211	ENST00000486840	CERK	Q8TCT0	537 aa		40.39	■■■■■ 4.06
CCZ1B-211	ENST00000486840	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	40.38	■■■■■ 4.05
CCZ1B-211	ENST00000486840	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		40.36	■■■■■ 4.05
CCZ1B-211	ENST00000486840	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		40.34	■■■■■ 4.05
CCZ1B-211	ENST00000486840	FBXO41	Q8TF61	875 aa		40.33	■■■■■ 4.05
CCZ1B-211	ENST00000486840	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	40.32	■■■■■ 4.05
CCZ1B-211	ENST00000486840	UNC13B	O14795	1591 aa		40.32	■■■■■ 4.05
CCZ1B-211	ENST00000486840	EID1	Q9Y6B2	187 aa		40.32	■■■■■ 4.05
CCZ1B-211	ENST00000486840	IDI1	Q13907	227 aa		40.29	■■■■■ 4.04
CCZ1B-211	ENST00000486840	TET3	O43151	1660 aa		40.26	■■■■■ 4.04
CCZ1B-211	ENST00000486840	TRIM52	Q96A61	297 aa		40.25	■■■■■ 4.03
CCZ1B-211	ENST00000486840	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		40.24	■■■■■ 4.03
CCZ1B-211	ENST00000486840	NOS1	P29475	1434 aa		40.24	■■■■■ 4.03
CCZ1B-211	ENST00000486840	NAIP	Q13075	1403 aa		40.23	■■■■■ 4.03
CCZ1B-211	ENST00000486840	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	40.2	■■■■■ 4.03
CCZ1B-211	ENST00000486840	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	40.19	■■■■■ 4.02
CCZ1B-211	ENST00000486840	HFM1	A2PYH4	1435 aa		40.18	■■■■■ 4.02
CCZ1B-211	ENST00000486840	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		40.18	■■■■■ 4.02
CCZ1B-211	ENST00000486840	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		40.18	■■■■■ 4.02
CCZ1B-211	ENST00000486840	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	40.17	■■■■■ 4.02
CCZ1B-211	ENST00000486840	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	40.17	■■■■■ 4.02
CCZ1B-211	ENST00000486840	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		40.16	■■■■■ 4.02
CCZ1B-211	ENST00000486840	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	40.15	■■■■■ 4.02
CCZ1B-211	ENST00000486840	PIK3C2B	O00750	1634 aa		40.14	■■■■■ 4.02
CCZ1B-211	ENST00000486840	SYNM	O15061	1565 aa		40.12	■■■■■ 4.01
CCZ1B-211	ENST00000486840	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	40.12	■■■■■ 4.01
CCZ1B-211	ENST00000486840	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		40.11	■■■■■ 4.01
CCZ1B-211	ENST00000486840	MED14	O60244	1454 aa		40.1	■■■■■ 4.01
CCZ1B-211	ENST00000486840	BCAN	Q96GW7	911 aa		40.09	■■■■■ 4.01
CCZ1B-211	ENST00000486840	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		40.08	■■■■■ 4.01
CCZ1B-211	ENST00000486840	LTK	P29376	864 aa		40.07	■■■■■ 4.01
CCZ1B-211	ENST00000486840	SLIT1	O75093	1534 aa		40.06	■■■■■ 4
CCZ1B-211	ENST00000486840	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	40.04	■■■■■ 4
CCZ1B-211	ENST00000486840	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		40.04	■■■■■ 4
CCZ1B-211	ENST00000486840		E9PCH4	1651 aa		40.04	■■■■■ 4
CCZ1B-211	ENST00000486840	ADGRB3	O60242	1522 aa		40.03	■■■■■ 4
CCZ1B-211	ENST00000486840	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	40.02	■■■■■ 4
CCZ1B-211	ENST00000486840	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		40.02	■■■■■ 4
CCZ1B-211	ENST00000486840	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	40.02	■■■■■ 4
CCZ1B-211	ENST00000486840	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	40	■■■■□ 3.99
CCZ1B-211	ENST00000486840	IQGAP1	P46940	1657 aa		40	■■■■□ 3.99
CCZ1B-211	ENST00000486840	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	39.97	■■■■□ 3.99
CCZ1B-211	ENST00000486840	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		39.94	■■■■□ 3.98
CCZ1B-211	ENST00000486840	CPS1	P31327	1500 aa		39.91	■■■■□ 3.98
CCZ1B-211	ENST00000486840	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	39.89	■■■■□ 3.98
CCZ1B-211	ENST00000486840	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		39.88	■■■■□ 3.97
CCZ1B-211	ENST00000486840	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		39.86	■■■■□ 3.97

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