RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486192.1

SORCS1-208, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene SORCS1, Length 632 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS1-208ENST00000486192 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa13.54□□□□□ -0.24
SORCS1-208ENST00000486192 NCOA1Q15788 1441 aa13.53□□□□□ -0.24
SORCS1-208ENST00000486192 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa13.53□□□□□ -0.24
SORCS1-208ENST00000486192 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
SORCS1-208ENST00000486192 A2MP01023 1474 aa13.52□□□□□ -0.25
SORCS1-208ENST00000486192 ABCA6Q8N139 1617 aa13.52□□□□□ -0.25
SORCS1-208ENST00000486192 C3P01024 1663 aa13.51□□□□□ -0.25
SORCS1-208ENST00000486192 AGLP35573 1532 aa13.51□□□□□ -0.25
SORCS1-208ENST00000486192 KIF15Q9NS87 1388 aa13.51□□□□□ -0.25
SORCS1-208ENST00000486192 ADGBQ8N7X0 1667 aa13.5□□□□□ -0.25
SORCS1-208ENST00000486192 DUOX2Q9NRD8 1548 aa13.5□□□□□ -0.25
SORCS1-208ENST00000486192 PTPRKQ15262 1439 aa13.5□□□□□ -0.25
SORCS1-208ENST00000486192 ERBINQ96RT1 1412 aa13.5□□□□□ -0.25
SORCS1-208ENST00000486192 LTBP4Q8N2S1 1624 aa13.49□□□□□ -0.25
SORCS1-208ENST00000486192 ITGAEP38570 1179 aa13.48□□□□□ -0.25
SORCS1-208ENST00000486192 CHIC2Q9UKJ5 165 aa13.48□□□□□ -0.25
SORCS1-208ENST00000486192 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa13.47□□□□□ -0.25
SORCS1-208ENST00000486192 HFM1A2PYH4 1435 aa13.47□□□□□ -0.25
SORCS1-208ENST00000486192 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
SORCS1-208ENST00000486192 PPP6R1Q9UPN7 881 aa13.46□□□□□ -0.25
SORCS1-208ENST00000486192 PTPRTO14522 1441 aa13.46□□□□□ -0.26
SORCS1-208ENST00000486192 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa13.46□□□□□ -0.26
SORCS1-208ENST00000486192 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
SORCS1-208ENST00000486192 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SORCS1-208ENST00000486192 UBAP1LF5GYI3 381 aa13.44□□□□□ -0.26
SORCS1-208ENST00000486192 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SORCS1-208ENST00000486192 FAM135AQ9P2D6 1515 aa13.44□□□□□ -0.26
SORCS1-208ENST00000486192 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa13.43□□□□□ -0.26
SORCS1-208ENST00000486192 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SORCS1-208ENST00000486192 NAIPQ13075 1403 aa13.42□□□□□ -0.26
SORCS1-208ENST00000486192 KIF3BO15066 747 aa13.41□□□□□ -0.26
SORCS1-208ENST00000486192 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa13.4□□□□□ -0.26
SORCS1-208ENST00000486192 CNTLNQ9NXG0 1405 aa13.39□□□□□ -0.27
SORCS1-208ENST00000486192 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SORCS1-208ENST00000486192 GCC2Q8IWJ2 1684 aa13.38□□□□□ -0.27
SORCS1-208ENST00000486192 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
SORCS1-208ENST00000486192 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
SORCS1-208ENST00000486192 KANK1Q14678 1352 aa13.37□□□□□ -0.27
SORCS1-208ENST00000486192 HRCP23327 699 aa13.37□□□□□ -0.27
SORCS1-208ENST00000486192 GGT6Q6P531 493 aa13.37□□□□□ -0.27
SORCS1-208ENST00000486192 SETD5Q9C0A6 1442 aa13.37□□□□□ -0.27
SORCS1-208ENST00000486192 DEPDC5O75140 1603 aa13.36□□□□□ -0.27
SORCS1-208ENST00000486192 KDM5DQ9BY66 1539 aa13.36□□□□□ -0.27
SORCS1-208ENST00000486192 PIP4K2BP78356 416 aa13.35□□□□□ -0.27
SORCS1-208ENST00000486192 IQSEC2Q5JU85 1478 aa13.35□□□□□ -0.27
SORCS1-208ENST00000486192 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa13.34□□□□□ -0.27
SORCS1-208ENST00000486192 UNC13BO14795 1591 aa13.33□□□□□ -0.28
SORCS1-208ENST00000486192 MROH1Q8NDA8 1641 aa13.33□□□□□ -0.28
SORCS1-208ENST00000486192 HSPA1LP34931 641 aa13.33□□□□□ -0.28
SORCS1-208ENST00000486192 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SORCS1-208ENST00000486192 LMTK2Q8IWU2 1503 aa13.33□□□□□ -0.28
SORCS1-208ENST00000486192 VWDEQ8N2E2 1590 aa13.32□□□□□ -0.28
SORCS1-208ENST00000486192 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
SORCS1-208ENST00000486192 ZMYM3Q14202 1370 aa13.32□□□□□ -0.28
SORCS1-208ENST00000486192 NUP155O75694 1391 aa13.31□□□□□ -0.28
SORCS1-208ENST00000486192 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa13.31□□□□□ -0.28
SORCS1-208ENST00000486192 ABCC3O15438 1527 aa13.3□□□□□ -0.28
SORCS1-208ENST00000486192 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa13.3□□□□□ -0.28
SORCS1-208ENST00000486192 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
SORCS1-208ENST00000486192 MROH2AA6NES4 1674 aa13.29□□□□□ -0.28
SORCS1-208ENST00000486192 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP13.29□□□□□ -0.28
SORCS1-208ENST00000486192 MYO3AQ8NEV4 1616 aa13.28□□□□□ -0.28
SORCS1-208ENST00000486192 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
SORCS1-208ENST00000486192 IQGAP3Q86VI3 1631 aa13.28□□□□□ -0.28
SORCS1-208ENST00000486192 PZPP20742 1482 aa13.27□□□□□ -0.29
SORCS1-208ENST00000486192 NPATQ14207 1427 aa13.26□□□□□ -0.29
SORCS1-208ENST00000486192 TRIM52Q96A61 297 aa13.26□□□□□ -0.29
SORCS1-208ENST00000486192 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
SORCS1-208ENST00000486192 EFCAB6Q5THR3 1501 aa13.25□□□□□ -0.29
SORCS1-208ENST00000486192 PKD2Q13563 968 aa13.25□□□□□ -0.29
SORCS1-208ENST00000486192 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
SORCS1-208ENST00000486192 TET3O43151 1660 aa13.24□□□□□ -0.29
SORCS1-208ENST00000486192 ADRA2BP18089 450 aa13.22□□□□□ -0.29
SORCS1-208ENST00000486192 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
SORCS1-208ENST00000486192 PCGF6Q9BYE7 350 aa13.22□□□□□ -0.29
SORCS1-208ENST00000486192 CEP152O94986 1710 aa13.2□□□□□ -0.3
SORCS1-208ENST00000486192 TOM1O60784 492 aa13.2□□□□□ -0.3
SORCS1-208ENST00000486192 MPHOSPH9Q99550 1183 aa13.2□□□□□ -0.3
SORCS1-208ENST00000486192 PLA2R1Q13018 1463 aa13.2□□□□□ -0.3
SORCS1-208ENST00000486192 ERVK-7P63135 1459 aa13.19□□□□□ -0.3
SORCS1-208ENST00000486192 NOS1P29475 1434 aa13.19□□□□□ -0.3
SORCS1-208ENST00000486192 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
SORCS1-208ENST00000486192 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
SORCS1-208ENST00000486192 TNRQ92752 1358 aa13.18□□□□□ -0.3
SORCS1-208ENST00000486192 SLC52A1Q9NWF4 448 aa13.17□□□□□ -0.3
SORCS1-208ENST00000486192 NLRP1Q9C000 1473 aa13.16□□□□□ -0.3
SORCS1-208ENST00000486192 NEURL4Q96JN8 1562 aa13.15□□□□□ -0.3
SORCS1-208ENST00000486192 A2ML1A8K2U0 1454 aa13.15□□□□□ -0.3
SORCS1-208ENST00000486192 E9PCH4 1651 aa13.15□□□□□ -0.31
SORCS1-208ENST00000486192 ALKQ9UM73 1620 aa13.14□□□□□ -0.31
SORCS1-208ENST00000486192 TRPM2O94759 1503 aa13.13□□□□□ -0.31
SORCS1-208ENST00000486192 CPS1P31327 1500 aa13.13□□□□□ -0.31
SORCS1-208ENST00000486192 STRCP1A6NGW2 1772 aa13.12□□□□□ -0.31
SORCS1-208ENST00000486192 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
SORCS1-208ENST00000486192 SYNMO15061 1565 aa13.11□□□□□ -0.31
SORCS1-208ENST00000486192 ANKLE2Q86XL3 938 aa13.1□□□□□ -0.31
SORCS1-208ENST00000486192 CCDC144AA2RUR9 1427 aa13.1□□□□□ -0.31
SORCS1-208ENST00000486192 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-208ENST00000486192 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa13.09□□□□□ -0.31
SORCS1-208ENST00000486192 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms