RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484202.2

SH3BP5L-203, Transcript of SH3 binding domain protein 5 like, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP5L, Length 3,110 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5L-203ENST00000484202 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP5L-203ENST00000484202 MBD5Q9P267 1494 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP5L-203ENST00000484202 ADGRL2O95490 1459 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP5L-203ENST00000484202 NEFMP07197 916 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5L-203ENST00000484202 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP5L-203ENST00000484202 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP5L-203ENST00000484202 PTPRGP23470 1445 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BP5L-203ENST00000484202 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SH3BP5L-203ENST00000484202 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SH3BP5L-203ENST00000484202 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP5L-203ENST00000484202 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP5L-203ENST00000484202 KDM5CP41229 1560 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP5L-203ENST00000484202 RALBP1Q15311 655 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP5L-203ENST00000484202 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP5L-203ENST00000484202 NUP160Q12769 1436 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP5L-203ENST00000484202 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SH3BP5L-203ENST00000484202 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP5L-203ENST00000484202 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP5L-203ENST00000484202 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP5L-203ENST00000484202 PDE4AP27815 886 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP5L-203ENST00000484202 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5L-203ENST00000484202 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5L-203ENST00000484202 NLRP13Q86W25 1043 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5L-203ENST00000484202 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP5L-203ENST00000484202 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP5L-203ENST00000484202 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP5L-203ENST00000484202 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP5L-203ENST00000484202 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
SH3BP5L-203ENST00000484202 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SH3BP5L-203ENST00000484202 PANK3Q9H999 370 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP5L-203ENST00000484202 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SH3BP5L-203ENST00000484202 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP5L-203ENST00000484202 ABCA8O94911 1581 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP5L-203ENST00000484202 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP5L-203ENST00000484202 PLIN1O60240 522 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP5L-203ENST00000484202 USP35Q9P2H5 1018 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP5L-203ENST00000484202 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP5L-203ENST00000484202 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SH3BP5L-203ENST00000484202 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP5L-203ENST00000484202 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP5L-203ENST00000484202 BACH2Q9BYV9 841 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP5L-203ENST00000484202 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP5L-203ENST00000484202 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP5L-203ENST00000484202 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SH3BP5L-203ENST00000484202 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP5L-203ENST00000484202 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP5L-203ENST00000484202 TMF1P82094 1093 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP5L-203ENST00000484202 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP5L-203ENST00000484202 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP5L-203ENST00000484202 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SH3BP5L-203ENST00000484202 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP5L-203ENST00000484202 SKAP1Q86WV1 359 aa21.58■■□□□ 1.04
SH3BP5L-203ENST00000484202 TESK2Q96S53 571 aa21.58■■□□□ 1.04
SH3BP5L-203ENST00000484202 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP5L-203ENST00000484202 MS4A1P11836 297 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP5L-203ENST00000484202 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP5L-203ENST00000484202 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP5L-203ENST00000484202 PLA2R1Q13018 1463 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP5L-203ENST00000484202 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SH3BP5L-203ENST00000484202 A2MP01023 1474 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP5L-203ENST00000484202 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP5L-203ENST00000484202 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP5L-203ENST00000484202 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP5L-203ENST00000484202 SLC4A3P48751 1232 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP5L-203ENST00000484202 GSE1Q14687 1217 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP5L-203ENST00000484202 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP5L-203ENST00000484202 ERBINQ96RT1 1412 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP5L-203ENST00000484202 PDE3BQ13370 1112 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP5L-203ENST00000484202 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
SH3BP5L-203ENST00000484202 AFAP1Q8N556 730 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP5L-203ENST00000484202 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP5L-203ENST00000484202 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BP5L-203ENST00000484202 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP5L-203ENST00000484202 CRBNQ96SW2 442 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP5L-203ENST00000484202 NFKBIBQ15653 356 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP5L-203ENST00000484202 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP5L-203ENST00000484202 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP5L-203ENST00000484202 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP5L-203ENST00000484202 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP5L-203ENST00000484202 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP5L-203ENST00000484202 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP5L-203ENST00000484202 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP5L-203ENST00000484202 PREX2Q70Z35 1606 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP5L-203ENST00000484202 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
SH3BP5L-203ENST00000484202 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP5L-203ENST00000484202 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP5L-203ENST00000484202 PPP2R1AP30153 589 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP5L-203ENST00000484202 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP5L-203ENST00000484202 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP5L-203ENST00000484202 KIF3BO15066 747 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP5L-203ENST00000484202 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SH3BP5L-203ENST00000484202 E9PCH4 1651 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP5L-203ENST00000484202 CDCA8Q53HL2 280 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP5L-203ENST00000484202 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP5L-203ENST00000484202 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
SH3BP5L-203ENST00000484202 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP5L-203ENST00000484202 GOLGA2Q08379 1002 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP5L-203ENST00000484202 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
SH3BP5L-203ENST00000484202 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
SH3BP5L-203ENST00000484202 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms