RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483778.5

ATG4B-221, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 3

Gene ATG4B, Length 1,103 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-221ENST00000483778 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.49■■■□□ 2.15
ATG4B-221ENST00000483778 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.46■■■□□ 2.15
ATG4B-221ENST00000483778 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.43■■■□□ 2.14
ATG4B-221ENST00000483778 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.43■■■□□ 2.14
ATG4B-221ENST00000483778 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
ATG4B-221ENST00000483778 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.42■■■□□ 2.14
ATG4B-221ENST00000483778 MIA2Q96PC5 1412 aa28.41■■■□□ 2.14
ATG4B-221ENST00000483778 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.4■■■□□ 2.14
ATG4B-221ENST00000483778 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
ATG4B-221ENST00000483778 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
ATG4B-221ENST00000483778 PZPP20742 1482 aa28.39■■■□□ 2.13
ATG4B-221ENST00000483778 PLA2R1Q13018 1463 aa28.39■■■□□ 2.13
ATG4B-221ENST00000483778 TNRQ92752 1358 aa28.38■■■□□ 2.13
ATG4B-221ENST00000483778 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
ATG4B-221ENST00000483778 PKD2Q13563 968 aa28.37■■■□□ 2.13
ATG4B-221ENST00000483778 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
ATG4B-221ENST00000483778 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.33■■■□□ 2.13
ATG4B-221ENST00000483778 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.32■■■□□ 2.12
ATG4B-221ENST00000483778 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.32■■■□□ 2.12
ATG4B-221ENST00000483778 APLP2Q06481 763 aa28.31■■■□□ 2.12
ATG4B-221ENST00000483778 ABCC5O15440 1437 aa28.31■■■□□ 2.12
ATG4B-221ENST00000483778 ABCC3O15438 1527 aa28.31■■■□□ 2.12
ATG4B-221ENST00000483778 CEP152O94986 1710 aa28.29■■■□□ 2.12
ATG4B-221ENST00000483778 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
ATG4B-221ENST00000483778 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.28■■■□□ 2.12
ATG4B-221ENST00000483778 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
ATG4B-221ENST00000483778 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.27■■■□□ 2.12
ATG4B-221ENST00000483778 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.26■■■□□ 2.11
ATG4B-221ENST00000483778 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.25■■■□□ 2.115e-9■■■■□ 24.7
ATG4B-221ENST00000483778 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.25■■■□□ 2.11
ATG4B-221ENST00000483778 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.23■■■□□ 2.11
ATG4B-221ENST00000483778 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
ATG4B-221ENST00000483778 KIF15Q9NS87 1388 aa28.22■■■□□ 2.11
ATG4B-221ENST00000483778 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.21■■■□□ 2.11
ATG4B-221ENST00000483778 DAPK1P53355 1430 aa28.21■■■□□ 2.11
ATG4B-221ENST00000483778 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
ATG4B-221ENST00000483778 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.2■■■□□ 2.1
ATG4B-221ENST00000483778 NLRP1Q9C000 1473 aa28.2■■■□□ 2.1
ATG4B-221ENST00000483778 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.2■■■□□ 2.1
ATG4B-221ENST00000483778 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.2■■■□□ 2.1
ATG4B-221ENST00000483778 ERVK-7P63135 1459 aa28.18■■■□□ 2.1
ATG4B-221ENST00000483778 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.18■■■□□ 2.1
ATG4B-221ENST00000483778 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.17■■■□□ 2.1
ATG4B-221ENST00000483778 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.15■■■□□ 2.11e-13■□□□□ 10.9
ATG4B-221ENST00000483778 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.13■■■□□ 2.09
ATG4B-221ENST00000483778 ERBINQ96RT1 1412 aa28.11■■■□□ 2.09
ATG4B-221ENST00000483778 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
ATG4B-221ENST00000483778 DEPDC5O75140 1603 aa28.1■■■□□ 2.09
ATG4B-221ENST00000483778 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.09■■■□□ 2.09
ATG4B-221ENST00000483778 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
ATG4B-221ENST00000483778 MED14O60244 1454 aa28.08■■■□□ 2.09
ATG4B-221ENST00000483778 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.08■■■□□ 2.09
ATG4B-221ENST00000483778 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.05■■■□□ 2.08
ATG4B-221ENST00000483778 IQGAP1P46940 1657 aa28.05■■■□□ 2.08
ATG4B-221ENST00000483778 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
ATG4B-221ENST00000483778 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.05■■■□□ 2.08
ATG4B-221ENST00000483778 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.05■■■□□ 2.08
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ATG4B-221ENST00000483778 LTKP29376 864 aa28.01■■■□□ 2.07
ATG4B-221ENST00000483778 ILDR2Q71H61 639 aa28■■■□□ 2.07
ATG4B-221ENST00000483778 CPS1P31327 1500 aa27.99■■■□□ 2.07
ATG4B-221ENST00000483778 PIK3C2BO00750 1634 aa27.98■■■□□ 2.07
ATG4B-221ENST00000483778 ADGRL2O95490 1459 aa27.97■■■□□ 2.07
ATG4B-221ENST00000483778 KANK1Q14678 1352 aa27.97■■■□□ 2.07
ATG4B-221ENST00000483778 ARHGAP23Q9P227 1491 aa27.95■■■□□ 2.06
ATG4B-221ENST00000483778 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.94■■■□□ 2.06
ATG4B-221ENST00000483778 PIP4K2BP78356 416 aa27.94■■■□□ 2.06
ATG4B-221ENST00000483778 TXNDC2Q86VQ3 553 aa27.94■■■□□ 2.06
ATG4B-221ENST00000483778 IDI1Q13907 227 aa27.93■■■□□ 2.06
ATG4B-221ENST00000483778 SYNMO15061 1565 aa27.92■■■□□ 2.06
ATG4B-221ENST00000483778 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
ATG4B-221ENST00000483778 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
ATG4B-221ENST00000483778 ALKQ9UM73 1620 aa27.92■■■□□ 2.06
ATG4B-221ENST00000483778 SLIT1O75093 1534 aa27.92■■■□□ 2.06
ATG4B-221ENST00000483778 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
ATG4B-221ENST00000483778 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.87■■■□□ 2.05
ATG4B-221ENST00000483778 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.87■■■□□ 2.05
ATG4B-221ENST00000483778 TOM1O60784 492 aa27.87■■■□□ 2.05
ATG4B-221ENST00000483778 HSPA1LP34931 641 aa27.87■■■□□ 2.05
ATG4B-221ENST00000483778 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.87■■■□□ 2.05
ATG4B-221ENST00000483778 NOS1P29475 1434 aa27.86■■■□□ 2.05
ATG4B-221ENST00000483778 TMEM2Q9UHN6 1383 aa27.85■■■□□ 2.05
ATG4B-221ENST00000483778 STAG3Q9UJ98 1225 aa27.84■■■□□ 2.05
ATG4B-221ENST00000483778 EID1Q9Y6B2 187 aa27.83■■■□□ 2.05
ATG4B-221ENST00000483778 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
ATG4B-221ENST00000483778 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.83■■■□□ 2.05
ATG4B-221ENST00000483778 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
ATG4B-221ENST00000483778 ITGAEP38570 1179 aa27.77■■■□□ 2.04
ATG4B-221ENST00000483778 TET3O43151 1660 aa27.77■■■□□ 2.04
ATG4B-221ENST00000483778 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
ATG4B-221ENST00000483778 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.75■■■□□ 2.03
ATG4B-221ENST00000483778 UNC13BO14795 1591 aa27.74■■■□□ 2.03
ATG4B-221ENST00000483778 ADGRB3O60242 1522 aa27.73■■■□□ 2.03
ATG4B-221ENST00000483778 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.73■■■□□ 2.03
ATG4B-221ENST00000483778 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.73■■■□□ 2.03
ATG4B-221ENST00000483778 E9PCH4 1651 aa27.71■■■□□ 2.03
ATG4B-221ENST00000483778 ROCK1Q13464 1354 aa27.71■■■□□ 2.03
ATG4B-221ENST00000483778 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
ATG4B-221ENST00000483778 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
ATG4B-221ENST00000483778 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.67■■■□□ 2.02
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