RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482168.1

PPCS-208, Transcript of phosphopantothenoylcysteine synthetase, human

TSL 2

Gene PPCS, Length 688 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPCS-208	ENST00000482168	JCAD	Q9P266	1359 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PPCS-208	ENST00000482168	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PPCS-208	ENST00000482168	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PPCS-208	ENST00000482168	RNF39	Q9H2S5	420 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PPCS-208	ENST00000482168	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PPCS-208	ENST00000482168	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
PPCS-208	ENST00000482168	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
PPCS-208	ENST00000482168	MED14	O60244	1454 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PPCS-208	ENST00000482168	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
PPCS-208	ENST00000482168	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
PPCS-208	ENST00000482168	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
PPCS-208	ENST00000482168	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
PPCS-208	ENST00000482168	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
PPCS-208	ENST00000482168	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PPCS-208	ENST00000482168	EP400	Q96L91	3159 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PPCS-208	ENST00000482168	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
PPCS-208	ENST00000482168	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PPCS-208	ENST00000482168	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	11.41	□□□□□ -0.58
PPCS-208	ENST00000482168	PLCH2	O75038	1416 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PPCS-208	ENST00000482168	IQGAP1	P46940	1657 aa		11.4	□□□□□ -0.59
PPCS-208	ENST00000482168	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.59
PPCS-208	ENST00000482168	DEPDC5	O75140	1603 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PPCS-208	ENST00000482168	PHLPP1	O60346	1717 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PPCS-208	ENST00000482168	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PPCS-208	ENST00000482168	AFAP1	Q8N556	730 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PPCS-208	ENST00000482168	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PPCS-208	ENST00000482168	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
PPCS-208	ENST00000482168	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
PPCS-208	ENST00000482168	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PPCS-208	ENST00000482168	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PPCS-208	ENST00000482168	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PPCS-208	ENST00000482168	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
PPCS-208	ENST00000482168	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PPCS-208	ENST00000482168	CEP350	Q5VT06	3117 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PPCS-208	ENST00000482168	ABCC1	P33527	1531 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PPCS-208	ENST00000482168	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PPCS-208	ENST00000482168	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PPCS-208	ENST00000482168	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PPCS-208	ENST00000482168	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
PPCS-208	ENST00000482168	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PPCS-208	ENST00000482168	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PPCS-208	ENST00000482168	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
PPCS-208	ENST00000482168	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PPCS-208	ENST00000482168	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PPCS-208	ENST00000482168	SLC34A2	O95436	690 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PPCS-208	ENST00000482168	AFF2	P51816	1311 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PPCS-208	ENST00000482168	P3H3	Q8IVL6	736 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PPCS-208	ENST00000482168	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PPCS-208	ENST00000482168	CCDC125	Q86Z20	511 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PPCS-208	ENST00000482168	SHPRH	Q149N8	1683 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PPCS-208	ENST00000482168	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PPCS-208	ENST00000482168	NWD1	Q149M9	1564 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PPCS-208	ENST00000482168	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PPCS-208	ENST00000482168	CAPN15	O75808	1086 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PPCS-208	ENST00000482168	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PPCS-208	ENST00000482168	TNR	Q92752	1358 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PPCS-208	ENST00000482168	C1QTNF8	P60827	252 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PPCS-208	ENST00000482168	POLA2	Q14181	598 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PPCS-208	ENST00000482168	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PPCS-208	ENST00000482168	MAP3K1	Q13233	1512 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PPCS-208	ENST00000482168	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PPCS-208	ENST00000482168	HRC	P23327	699 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PPCS-208	ENST00000482168	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PPCS-208	ENST00000482168	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PPCS-208	ENST00000482168	ATP7A	Q04656	1500 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PPCS-208	ENST00000482168	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PPCS-208	ENST00000482168	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PPCS-208	ENST00000482168	TMEM94	Q12767	1356 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PPCS-208	ENST00000482168	KIF14	Q15058	1648 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PPCS-208	ENST00000482168	NGLY1	Q96IV0	654 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PPCS-208	ENST00000482168	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PPCS-208	ENST00000482168	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PPCS-208	ENST00000482168	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PPCS-208	ENST00000482168	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PPCS-208	ENST00000482168	FBXO3	Q9UK99	471 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PPCS-208	ENST00000482168	SAMD9	Q5K651	1589 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PPCS-208	ENST00000482168	NLRP1	Q9C000	1473 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PPCS-208	ENST00000482168	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PPCS-208	ENST00000482168	PROM2	Q8N271	834 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PPCS-208	ENST00000482168	PLXNC1	O60486	1568 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PPCS-208	ENST00000482168	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PPCS-208	ENST00000482168	SLAIN2	Q9P270	581 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PPCS-208	ENST00000482168	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PPCS-208	ENST00000482168	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PPCS-208	ENST00000482168	DIP2A	Q14689	1571 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PPCS-208	ENST00000482168	GGT6	Q6P531	493 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PPCS-208	ENST00000482168	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PPCS-208	ENST00000482168	TIAM1	Q13009	1591 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PPCS-208	ENST00000482168	PZP	P20742	1482 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PPCS-208	ENST00000482168	C8orf37	Q96NL8	207 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PPCS-208	ENST00000482168	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PPCS-208	ENST00000482168	MIA2	Q96PC5	1412 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PPCS-208	ENST00000482168	MSH6	P52701	1360 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PPCS-208	ENST00000482168	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PPCS-208	ENST00000482168	ABCC3	O15438	1527 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PPCS-208	ENST00000482168	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PPCS-208	ENST00000482168	A2M	P01023	1474 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PPCS-208	ENST00000482168	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PPCS-208	ENST00000482168	UTRN	P46939	3433 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PPCS-208	ENST00000482168	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		11.1	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms