RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477886.5

PRKRIP1-205, Transcript of PRKR interacting protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKRIP1, Length 986 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1-205ENST00000477886 MAP3K1Q13233 1512 aa37.47■■■■□ 3.59
PRKRIP1-205ENST00000477886 APLP2Q06481 763 aa37.44■■■■□ 3.58
PRKRIP1-205ENST00000477886 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP37.43■■■■□ 3.58
PRKRIP1-205ENST00000477886 LTBP4Q8N2S1 1624 aa37.43■■■■□ 3.58
PRKRIP1-205ENST00000477886 PLA2R1Q13018 1463 aa37.42■■■■□ 3.58
PRKRIP1-205ENST00000477886 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.42■■■■□ 3.58
PRKRIP1-205ENST00000477886 PKD2Q13563 968 aa37.41■■■■□ 3.58
PRKRIP1-205ENST00000477886 A2ML1A8K2U0 1454 aa37.4■■■■□ 3.58
PRKRIP1-205ENST00000477886 TNRQ92752 1358 aa37.4■■■■□ 3.58
PRKRIP1-205ENST00000477886 FAM135AQ9P2D6 1515 aa37.39■■■■□ 3.58
PRKRIP1-205ENST00000477886 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
PRKRIP1-205ENST00000477886 PZPP20742 1482 aa37.37■■■■□ 3.57
PRKRIP1-205ENST00000477886 MAST1Q9Y2H9 1570 aa37.37■■■■□ 3.57
PRKRIP1-205ENST00000477886 MIA2Q96PC5 1412 aa37.36■■■■□ 3.57
PRKRIP1-205ENST00000477886 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
PRKRIP1-205ENST00000477886 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP37.34■■■■□ 3.57
PRKRIP1-205ENST00000477886 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP37.28■■■■□ 3.56
PRKRIP1-205ENST00000477886 IQSEC2Q5JU85 1478 aa37.26■■■■□ 3.56
PRKRIP1-205ENST00000477886 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
PRKRIP1-205ENST00000477886 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP37.24■■■■□ 3.55
PRKRIP1-205ENST00000477886 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP37.23■■■■□ 3.55
PRKRIP1-205ENST00000477886 PTPN23Q9H3S7 1636 aa37.21■■■■□ 3.55
PRKRIP1-205ENST00000477886 ABCC3O15438 1527 aa37.21■■■■□ 3.55
PRKRIP1-205ENST00000477886 DUOX2Q9NRD8 1548 aa37.19■■■■□ 3.54
PRKRIP1-205ENST00000477886 NLRP1Q9C000 1473 aa37.19■■■■□ 3.54
PRKRIP1-205ENST00000477886 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP37.18■■■■□ 3.54
PRKRIP1-205ENST00000477886 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP37.18■■■■□ 3.54
PRKRIP1-205ENST00000477886 UGGT1Q9NYU2 1555 aa37.17■■■■□ 3.54
PRKRIP1-205ENST00000477886 CEP152O94986 1710 aa37.17■■■■□ 3.54
PRKRIP1-205ENST00000477886 CROCC2H7BZ55 1655 aa37.17■■■■□ 3.54
PRKRIP1-205ENST00000477886 ANKLE2Q86XL3 938 aa37.15■■■■□ 3.54
PRKRIP1-205ENST00000477886 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa37.15■■■■□ 3.54
PRKRIP1-205ENST00000477886 UBAP1LF5GYI3 381 aa37.14■■■■□ 3.54
PRKRIP1-205ENST00000477886 KIF15Q9NS87 1388 aa37.14■■■■□ 3.54
PRKRIP1-205ENST00000477886 MROH1Q8NDA8 1641 aa37.13■■■■□ 3.53
PRKRIP1-205ENST00000477886 NEURL4Q96JN8 1562 aa37.12■■■■□ 3.53
PRKRIP1-205ENST00000477886 ABCC5O15440 1437 aa37.12■■■■□ 3.53
PRKRIP1-205ENST00000477886 SHANK2Q9UPX8 1470 aa37.1■■■■□ 3.53
PRKRIP1-205ENST00000477886 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
PRKRIP1-205ENST00000477886 DAPK1P53355 1430 aa37.09■■■■□ 3.53
PRKRIP1-205ENST00000477886 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.09■■■■□ 3.53
PRKRIP1-205ENST00000477886 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa37.08■■■■□ 3.53
PRKRIP1-205ENST00000477886 ERVK-7P63135 1459 aa37.07■■■■□ 3.53
PRKRIP1-205ENST00000477886 DISP3Q9P2K9 1392 aa37.07■■■■□ 3.53
PRKRIP1-205ENST00000477886 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP37.07■■■■□ 3.524e-9■■□□□ 11.4
PRKRIP1-205ENST00000477886 CHIC2Q9UKJ5 165 aa37.05■■■■□ 3.52
PRKRIP1-205ENST00000477886 ERBINQ96RT1 1412 aa37.04■■■■□ 3.52
PRKRIP1-205ENST00000477886 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP37.01■■■■□ 3.51
PRKRIP1-205ENST00000477886 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.99■■■■□ 3.51
PRKRIP1-205ENST00000477886 DEPDC5O75140 1603 aa36.99■■■■□ 3.51
PRKRIP1-205ENST00000477886 CPS1P31327 1500 aa36.97■■■■□ 3.51
PRKRIP1-205ENST00000477886 KANK1Q14678 1352 aa36.96■■■■□ 3.51
PRKRIP1-205ENST00000477886 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
PRKRIP1-205ENST00000477886 IQGAP1P46940 1657 aa36.96■■■■□ 3.51
PRKRIP1-205ENST00000477886 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.95■■■■□ 3.51
PRKRIP1-205ENST00000477886 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
PRKRIP1-205ENST00000477886 MED14O60244 1454 aa36.93■■■■□ 3.5
PRKRIP1-205ENST00000477886 UBR1Q8IWV7 1749 aa36.91■■■■□ 3.5
PRKRIP1-205ENST00000477886 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.9■■■■□ 3.5
PRKRIP1-205ENST00000477886 PIP4K2BP78356 416 aa36.88■■■■□ 3.49
PRKRIP1-205ENST00000477886 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.87■■■■□ 3.49
PRKRIP1-205ENST00000477886 TOM1O60784 492 aa36.84■■■■□ 3.49
PRKRIP1-205ENST00000477886 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.83■■■■□ 3.49
PRKRIP1-205ENST00000477886 TXNDC2Q86VQ3 553 aa36.79■■■■□ 3.48
PRKRIP1-205ENST00000477886 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
PRKRIP1-205ENST00000477886 PIK3C2BO00750 1634 aa36.78■■■■□ 3.48
PRKRIP1-205ENST00000477886 ILDR2Q71H61 639 aa36.78■■■■□ 3.48
PRKRIP1-205ENST00000477886 EID1Q9Y6B2 187 aa36.76■■■■□ 3.48
PRKRIP1-205ENST00000477886 ADGRL2O95490 1459 aa36.74■■■■□ 3.47
PRKRIP1-205ENST00000477886 STRCP1A6NGW2 1772 aa36.73■■■■□ 3.47
PRKRIP1-205ENST00000477886 LTKP29376 864 aa36.73■■■■□ 3.47
PRKRIP1-205ENST00000477886 SLIT1O75093 1534 aa36.72■■■■□ 3.47
PRKRIP1-205ENST00000477886 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.72■■■■□ 3.47
PRKRIP1-205ENST00000477886 ARHGAP23Q9P227 1491 aa36.7■■■■□ 3.47
PRKRIP1-205ENST00000477886 HSPA1LP34931 641 aa36.69■■■■□ 3.46
PRKRIP1-205ENST00000477886 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.67■■■■□ 3.46
PRKRIP1-205ENST00000477886 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.67■■■■□ 3.46
PRKRIP1-205ENST00000477886 SYNMO15061 1565 aa36.66■■■■□ 3.46
PRKRIP1-205ENST00000477886 LRRC7Q96NW7 1537 aa36.66■■■■□ 3.46
PRKRIP1-205ENST00000477886 IDI1Q13907 227 aa36.66■■■■□ 3.46
PRKRIP1-205ENST00000477886 TMEM2Q9UHN6 1383 aa36.65■■■■□ 3.46
PRKRIP1-205ENST00000477886 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
PRKRIP1-205ENST00000477886 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
PRKRIP1-205ENST00000477886 NOS1P29475 1434 aa36.57■■■■□ 3.44
PRKRIP1-205ENST00000477886 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
PRKRIP1-205ENST00000477886 ALKQ9UM73 1620 aa36.55■■■■□ 3.44
PRKRIP1-205ENST00000477886 BCANQ96GW7 911 aa36.54■■■■□ 3.44
PRKRIP1-205ENST00000477886 ADGRB3O60242 1522 aa36.54■■■■□ 3.44
PRKRIP1-205ENST00000477886 SOCS7O14512 581 aa36.53■■■■□ 3.44
PRKRIP1-205ENST00000477886 ITGAEP38570 1179 aa36.53■■■■□ 3.44
PRKRIP1-205ENST00000477886 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36.53■■■■□ 3.44
PRKRIP1-205ENST00000477886 TET3O43151 1660 aa36.51■■■■□ 3.44
PRKRIP1-205ENST00000477886 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
PRKRIP1-205ENST00000477886 SLC26A8Q96RN1 970 aa36.49■■■■□ 3.43
PRKRIP1-205ENST00000477886 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.46■■■■□ 3.43
PRKRIP1-205ENST00000477886 UNC13BO14795 1591 aa36.46■■■■□ 3.43
PRKRIP1-205ENST00000477886 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
PRKRIP1-205ENST00000477886 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
PRKRIP1-205ENST00000477886 CHGAP10645 457 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
PRKRIP1-205ENST00000477886 MYO5BQ9ULV0 1848 aa36.41■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms