RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475304.5

TAPBP-238, Transcript of TAP binding protein, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TAPBP, Length 1,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAPBP-238	ENST00000475304	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	24.96	■■□□□ 1.59
TAPBP-238	ENST00000475304	RICTOR	Q6R327	1708 aa		24.95	■■□□□ 1.58
TAPBP-238	ENST00000475304	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	24.93	■■□□□ 1.58
TAPBP-238	ENST00000475304	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	24.91	■■□□□ 1.58
TAPBP-238	ENST00000475304	PKD2	Q13563	968 aa		24.91	■■□□□ 1.58
TAPBP-238	ENST00000475304	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		24.9	■■□□□ 1.58
TAPBP-238	ENST00000475304	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	24.9	■■□□□ 1.58
TAPBP-238	ENST00000475304	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		24.87	■■□□□ 1.57
TAPBP-238	ENST00000475304	A2M	P01023	1474 aa		24.85	■■□□□ 1.57
TAPBP-238	ENST00000475304	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	24.85	■■□□□ 1.57
TAPBP-238	ENST00000475304	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		24.85	■■□□□ 1.57
TAPBP-238	ENST00000475304	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	24.84	■■□□□ 1.57
TAPBP-238	ENST00000475304	TET3	O43151	1660 aa		24.83	■■□□□ 1.57
TAPBP-238	ENST00000475304	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		24.83	■■□□□ 1.57
TAPBP-238	ENST00000475304	KANK1	Q14678	1352 aa		24.83	■■□□□ 1.57
TAPBP-238	ENST00000475304	ABCA6	Q8N139	1617 aa		24.83	■■□□□ 1.57
TAPBP-238	ENST00000475304	FOXD1	Q16676	465 aa		24.82	■■□□□ 1.56
TAPBP-238	ENST00000475304	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	24.82	■■□□□ 1.56
TAPBP-238	ENST00000475304	ATP10A	O60312	1499 aa		24.81	■■□□□ 1.56
TAPBP-238	ENST00000475304	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		24.78	■■□□□ 1.56
TAPBP-238	ENST00000475304	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		24.78	■■□□□ 1.56
TAPBP-238	ENST00000475304	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	24.77	■■□□□ 1.56
TAPBP-238	ENST00000475304	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		24.77	■■□□□ 1.56
TAPBP-238	ENST00000475304		E9PCH4	1651 aa		24.75	■■□□□ 1.55
TAPBP-238	ENST00000475304	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		24.74	■■□□□ 1.55
TAPBP-238	ENST00000475304	KIF3B	O15066	747 aa		24.73	■■□□□ 1.55
TAPBP-238	ENST00000475304	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		24.72	■■□□□ 1.55
TAPBP-238	ENST00000475304	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		24.72	■■□□□ 1.55
TAPBP-238	ENST00000475304	RAPGEF3	O95398	923 aa		24.71	■■□□□ 1.55
TAPBP-238	ENST00000475304	RERE	Q9P2R6	1566 aa		24.7	■■□□□ 1.55
TAPBP-238	ENST00000475304	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		24.7	■■□□□ 1.54
TAPBP-238	ENST00000475304	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	24.68	■■□□□ 1.54
TAPBP-238	ENST00000475304	TRPM2	O94759	1503 aa		24.67	■■□□□ 1.54
TAPBP-238	ENST00000475304	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		24.67	■■□□□ 1.54
TAPBP-238	ENST00000475304	CEP152	O94986	1710 aa		24.65	■■□□□ 1.54
TAPBP-238	ENST00000475304	PLA2R1	Q13018	1463 aa		24.64	■■□□□ 1.54
TAPBP-238	ENST00000475304	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	24.64	■■□□□ 1.53
TAPBP-238	ENST00000475304	PTPRT	O14522	1441 aa		24.63	■■□□□ 1.53
TAPBP-238	ENST00000475304	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		24.62	■■□□□ 1.53
TAPBP-238	ENST00000475304	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		24.61	■■□□□ 1.53
TAPBP-238	ENST00000475304	AGL	P35573	1532 aa		24.59	■■□□□ 1.53
TAPBP-238	ENST00000475304	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		24.59	■■□□□ 1.53
TAPBP-238	ENST00000475304	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		24.57	■■□□□ 1.52
TAPBP-238	ENST00000475304	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		24.56	■■□□□ 1.52
TAPBP-238	ENST00000475304	ABCC3	O15438	1527 aa		24.56	■■□□□ 1.52
TAPBP-238	ENST00000475304	KIF1B	O60333	1816 aa		24.54	■■□□□ 1.52
TAPBP-238	ENST00000475304	STAC3	Q96MF2	364 aa		24.53	■■□□□ 1.52
TAPBP-238	ENST00000475304	CLTCL1	P53675	1640 aa		24.52	■■□□□ 1.52
TAPBP-238	ENST00000475304	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	24.51	■■□□□ 1.51
TAPBP-238	ENST00000475304	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		24.51	■■□□□ 1.51
TAPBP-238	ENST00000475304	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		24.5	■■□□□ 1.51
TAPBP-238	ENST00000475304	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		24.5	■■□□□ 1.51
TAPBP-238	ENST00000475304	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		24.49	■■□□□ 1.51
TAPBP-238	ENST00000475304	GGT6	Q6P531	493 aa		24.49	■■□□□ 1.51
TAPBP-238	ENST00000475304	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		24.48	■■□□□ 1.51
TAPBP-238	ENST00000475304	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		24.48	■■□□□ 1.51
TAPBP-238	ENST00000475304	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	24.47	■■□□□ 1.51
TAPBP-238	ENST00000475304	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		24.47	■■□□□ 1.51
TAPBP-238	ENST00000475304	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		24.47	■■□□□ 1.51
TAPBP-238	ENST00000475304	NPAT	Q14207	1427 aa		24.45	■■□□□ 1.5
TAPBP-238	ENST00000475304	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	24.44	■■□□□ 1.5
TAPBP-238	ENST00000475304	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		24.44	■■□□□ 1.5
TAPBP-238	ENST00000475304	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		24.43	■■□□□ 1.5
TAPBP-238	ENST00000475304	LAMC1	P11047	1609 aa		24.43	■■□□□ 1.5
TAPBP-238	ENST00000475304	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		24.42	■■□□□ 1.5
TAPBP-238	ENST00000475304	NOS1	P29475	1434 aa		24.39	■■□□□ 1.49
TAPBP-238	ENST00000475304	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	24.39	■■□□□ 1.49
TAPBP-238	ENST00000475304	PIK3C2B	O00750	1634 aa		24.38	■■□□□ 1.49
TAPBP-238	ENST00000475304	IFT172	Q9UG01	1749 aa		24.37	■■□□□ 1.49
TAPBP-238	ENST00000475304	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		24.37	■■□□□ 1.49
TAPBP-238	ENST00000475304	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		24.36	■■□□□ 1.49
TAPBP-238	ENST00000475304	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	24.36	■■□□□ 1.49
TAPBP-238	ENST00000475304	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		24.36	■■□□□ 1.49
TAPBP-238	ENST00000475304	RGL3	Q3MIN7	710 aa		24.35	■■□□□ 1.49
TAPBP-238	ENST00000475304	ADGRB3	O60242	1522 aa		24.35	■■□□□ 1.49
TAPBP-238	ENST00000475304	MADD	Q8WXG6	1647 aa		24.34	■■□□□ 1.49
TAPBP-238	ENST00000475304	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	24.34	■■□□□ 1.49
TAPBP-238	ENST00000475304	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		24.34	■■□□□ 1.49
TAPBP-238	ENST00000475304	MYOM2	P54296	1465 aa		24.33	■■□□□ 1.48
TAPBP-238	ENST00000475304	MROH2A	A6NES4	1674 aa		24.32	■■□□□ 1.48
TAPBP-238	ENST00000475304	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	24.32	■■□□□ 1.48
TAPBP-238	ENST00000475304	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		24.32	■■□□□ 1.48
TAPBP-238	ENST00000475304	SYNM	O15061	1565 aa		24.3	■■□□□ 1.48
TAPBP-238	ENST00000475304	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		24.3	■■□□□ 1.48
TAPBP-238	ENST00000475304	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	24.29	■■□□□ 1.48
TAPBP-238	ENST00000475304	USP47	Q96K76	1375 aa		24.29	■■□□□ 1.48
TAPBP-238	ENST00000475304	PPL	O60437	1756 aa		24.28	■■□□□ 1.48
TAPBP-238	ENST00000475304	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		24.27	■■□□□ 1.48
TAPBP-238	ENST00000475304	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		24.27	■■□□□ 1.48
TAPBP-238	ENST00000475304	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		24.26	■■□□□ 1.47
TAPBP-238	ENST00000475304	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	24.24	■■□□□ 1.47
TAPBP-238	ENST00000475304	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	24.24	■■□□□ 1.47
TAPBP-238	ENST00000475304	ERVK-7	P63135	1459 aa		24.23	■■□□□ 1.47
TAPBP-238	ENST00000475304	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		24.22	■■□□□ 1.47
TAPBP-238	ENST00000475304	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		24.21	■■□□□ 1.47
TAPBP-238	ENST00000475304	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	24.19	■■□□□ 1.46
TAPBP-238	ENST00000475304	IQGAP1	P46940	1657 aa		24.18	■■□□□ 1.46
TAPBP-238	ENST00000475304	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		24.18	■■□□□ 1.46
TAPBP-238	ENST00000475304	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	24.18	■■□□□ 1.46
TAPBP-238	ENST00000475304	CCDC7	Q96M83	1385 aa		24.17	■■□□□ 1.46

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