RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472943.5

LINC00886-201, long intergenic non-protein coding RNA 886, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00886, Length 3,306 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00886-201ENST00000472943 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
LINC00886-201ENST00000472943 C9orf84Q5VXU9 1444 aa13.82□□□□□ -0.2
LINC00886-201ENST00000472943 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
LINC00886-201ENST00000472943 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
LINC00886-201ENST00000472943 PARD3Q8TEW0 1356 aa13.81□□□□□ -0.2
LINC00886-201ENST00000472943 PTPRGP23470 1445 aa13.81□□□□□ -0.2
LINC00886-201ENST00000472943 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa13.8□□□□□ -0.2
LINC00886-201ENST00000472943 ABCC10Q5T3U5 1492 aa13.79□□□□□ -0.2
LINC00886-201ENST00000472943 PDE4AP27815 886 aa13.79□□□□□ -0.2
LINC00886-201ENST00000472943 DCAF11Q8TEB1 546 aa13.79□□□□□ -0.2
LINC00886-201ENST00000472943 NLRP13Q86W25 1043 aa13.78□□□□□ -0.2
LINC00886-201ENST00000472943 PDE3BQ13370 1112 aa13.78□□□□□ -0.2
LINC00886-201ENST00000472943 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
LINC00886-201ENST00000472943 BACH2Q9BYV9 841 aa13.77□□□□□ -0.2
LINC00886-201ENST00000472943 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
LINC00886-201ENST00000472943 MS4A1P11836 297 aa13.76□□□□□ -0.21
LINC00886-201ENST00000472943 ABCA8O94911 1581 aa13.76□□□□□ -0.21
LINC00886-201ENST00000472943 PRAG1Q86YV5 1406 aa13.75□□□□□ -0.21
LINC00886-201ENST00000472943 ARHGEF5Q12774 1597 aa13.75□□□□□ -0.21
LINC00886-201ENST00000472943 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
LINC00886-201ENST00000472943 CDCA7LQ96GN5 454 aa13.75□□□□□ -0.21
LINC00886-201ENST00000472943 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
LINC00886-201ENST00000472943 FAM135AQ9P2D6 1515 aa13.74□□□□□ -0.21
LINC00886-201ENST00000472943 LAMC1P11047 1609 aa13.74□□□□□ -0.21
LINC00886-201ENST00000472943 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa13.74□□□□□ -0.21
LINC00886-201ENST00000472943 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
LINC00886-201ENST00000472943 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
LINC00886-201ENST00000472943 MYO5CQ9NQX4 1742 aa13.73□□□□□ -0.21
LINC00886-201ENST00000472943 INSRP06213 1382 aa13.73□□□□□ -0.21
LINC00886-201ENST00000472943 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
LINC00886-201ENST00000472943 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa13.71□□□□□ -0.21
LINC00886-201ENST00000472943 ATP10BO94823 1461 aa13.71□□□□□ -0.21
LINC00886-201ENST00000472943 TSPY4P0CV99 314 aa13.71□□□□□ -0.21
LINC00886-201ENST00000472943 TSPY10P0CW01 314 aa13.71□□□□□ -0.21
LINC00886-201ENST00000472943 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
LINC00886-201ENST00000472943 GPRASP1Q5JY77 1395 aa13.71□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 PLIN1O60240 522 aa13.7□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 SYNJ2O15056 1496 aa13.7□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 USP35Q9P2H5 1018 aa13.7□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa13.7□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 PLEKHD1A6NEE1 506 aa13.7□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 NEFMP07197 916 aa13.69□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 NBPF1Q3BBV0 1214 aa13.69□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa13.69□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 DISP3Q9P2K9 1392 aa13.69□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 CCDC144AA2RUR9 1427 aa13.69□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa13.69□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP13.69□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 A2MP01023 1474 aa13.68□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa13.68□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 CRBNQ96SW2 442 aa13.68□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 UNC13BO14795 1591 aa13.68□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 SKAP1Q86WV1 359 aa13.67□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 PLA2R1Q13018 1463 aa13.67□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 TESK2Q96S53 571 aa13.67□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 CCDC141Q6ZP82 1450 aa13.67□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 NUP160Q12769 1436 aa13.67□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 PREX2Q70Z35 1606 aa13.67□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 IL27Q8NEV9 243 aa13.66□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 JPH4Q96JJ6 628 aa13.66□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 ERBINQ96RT1 1412 aa13.65□□□□□ -0.22
LINC00886-201ENST00000472943 PANK3Q9H999 370 aa13.64□□□□□ -0.23
LINC00886-201ENST00000472943 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
LINC00886-201ENST00000472943 RGL3Q3MIN7 710 aa13.64□□□□□ -0.23
LINC00886-201ENST00000472943 KDM2BQ8NHM5 1336 aa13.63□□□□□ -0.23
LINC00886-201ENST00000472943 IQGAP3Q86VI3 1631 aa13.63□□□□□ -0.23
LINC00886-201ENST00000472943 C20orf194Q5TEA3 1177 aa13.63□□□□□ -0.23
LINC00886-201ENST00000472943 DDRGK1Q96HY6 314 aa13.62□□□□□ -0.23
LINC00886-201ENST00000472943 MAST1Q9Y2H9 1570 aa13.62□□□□□ -0.23
LINC00886-201ENST00000472943 FBLN2P98095 1184 aa13.6□□□□□ -0.23
LINC00886-201ENST00000472943 SYCP2Q9BX26 1530 aa13.6□□□□□ -0.23
LINC00886-201ENST00000472943 ADAMTS8Q9UP79 889 aa13.59□□□□□ -0.23
LINC00886-201ENST00000472943 SLC24A1O60721 1099 aa13.59□□□□□ -0.23
LINC00886-201ENST00000472943 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa13.59□□□□□ -0.23
LINC00886-201ENST00000472943 TMF1P82094 1093 aa13.59□□□□□ -0.23
LINC00886-201ENST00000472943 PLXNC1O60486 1568 aa13.58□□□□□ -0.24
LINC00886-201ENST00000472943 MAGI2Q86UL8 1455 aa13.58□□□□□ -0.24
LINC00886-201ENST00000472943 WDR7Q9Y4E6 1490 aa13.58□□□□□ -0.24
LINC00886-201ENST00000472943 IQGAP1P46940 1657 aa13.58□□□□□ -0.24
LINC00886-201ENST00000472943 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
LINC00886-201ENST00000472943 RSPH4AQ5TD94 716 aa13.57□□□□□ -0.24
LINC00886-201ENST00000472943 DUSP27Q5VZP5 1158 aa13.57□□□□□ -0.24
LINC00886-201ENST00000472943 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
LINC00886-201ENST00000472943 ATP10AO60312 1499 aa13.57□□□□□ -0.24
LINC00886-201ENST00000472943 CLASP1Q7Z460 1538 aa13.56□□□□□ -0.24
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF521Q96K83 1311 aa13.56□□□□□ -0.24
LINC00886-201ENST00000472943 TTC37Q6PGP7 1564 aa13.56□□□□□ -0.24
LINC00886-201ENST00000472943 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
LINC00886-201ENST00000472943 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
LINC00886-201ENST00000472943 NFKBIBQ15653 356 aa13.55□□□□□ -0.24
LINC00886-201ENST00000472943 C8orf34Q49A92 452 aa13.55□□□□□ -0.24
LINC00886-201ENST00000472943 SLC4A3P48751 1232 aa13.54□□□□□ -0.24
LINC00886-201ENST00000472943 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP13.54□□□□□ -0.24
LINC00886-201ENST00000472943 MADDQ8WXG6 1647 aa13.54□□□□□ -0.24
LINC00886-201ENST00000472943 PPP2R1AP30153 589 aa13.54□□□□□ -0.24
LINC00886-201ENST00000472943 SYNMO15061 1565 aa13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms