RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466657.1

SIKE1-205, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 3

Gene SIKE1, Length 415 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-205ENST00000466657 PLA2R1Q13018 1463 aa28.36■■■□□ 2.13
SIKE1-205ENST00000466657 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
SIKE1-205ENST00000466657 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.35■■■□□ 2.13
SIKE1-205ENST00000466657 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
SIKE1-205ENST00000466657 KIF3BO15066 747 aa28.32■■■□□ 2.12
SIKE1-205ENST00000466657 PZPP20742 1482 aa28.32■■■□□ 2.12
SIKE1-205ENST00000466657 TSPY4P0CV99 314 aa28.31■■■□□ 2.12
SIKE1-205ENST00000466657 TSPY10P0CW01 314 aa28.31■■■□□ 2.12
SIKE1-205ENST00000466657 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
SIKE1-205ENST00000466657 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
SIKE1-205ENST00000466657 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.3■■■□□ 2.12
SIKE1-205ENST00000466657 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.29■■■□□ 2.12
SIKE1-205ENST00000466657 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
SIKE1-205ENST00000466657 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
SIKE1-205ENST00000466657 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.25■■■□□ 2.11
SIKE1-205ENST00000466657 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.25■■■□□ 2.11
SIKE1-205ENST00000466657 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.23■■■□□ 2.11
SIKE1-205ENST00000466657 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.22■■■□□ 2.11
SIKE1-205ENST00000466657 PKD2Q13563 968 aa28.22■■■□□ 2.11
SIKE1-205ENST00000466657 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.21■■■□□ 2.11
SIKE1-205ENST00000466657 ABCC3O15438 1527 aa28.21■■■□□ 2.11
SIKE1-205ENST00000466657 TNRQ92752 1358 aa28.21■■■□□ 2.11
SIKE1-205ENST00000466657 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.2■■■□□ 2.11
SIKE1-205ENST00000466657 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.19■■■□□ 2.1
SIKE1-205ENST00000466657 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
SIKE1-205ENST00000466657 CEP152O94986 1710 aa28.18■■■□□ 2.1
SIKE1-205ENST00000466657 NLRP1Q9C000 1473 aa28.16■■■□□ 2.1
SIKE1-205ENST00000466657 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.16■■■□□ 2.1
SIKE1-205ENST00000466657 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.16■■■□□ 2.1
SIKE1-205ENST00000466657 ABCC5O15440 1437 aa28.14■■■□□ 2.1
SIKE1-205ENST00000466657 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.12■■■□□ 2.09
SIKE1-205ENST00000466657 APLP2Q06481 763 aa28.12■■■□□ 2.09
SIKE1-205ENST00000466657 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
SIKE1-205ENST00000466657 DEPDC5O75140 1603 aa28.11■■■□□ 2.09
SIKE1-205ENST00000466657 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
SIKE1-205ENST00000466657 DAPK1P53355 1430 aa28.09■■■□□ 2.09
SIKE1-205ENST00000466657 ERBINQ96RT1 1412 aa28.09■■■□□ 2.09
SIKE1-205ENST00000466657 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.09■■■□□ 2.09
SIKE1-205ENST00000466657 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
SIKE1-205ENST00000466657 KIF15Q9NS87 1388 aa28.07■■■□□ 2.08
SIKE1-205ENST00000466657 ERVK-7P63135 1459 aa28.07■■■□□ 2.08
SIKE1-205ENST00000466657 MED14O60244 1454 aa28.02■■■□□ 2.08
SIKE1-205ENST00000466657 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.01■■■□□ 2.08
SIKE1-205ENST00000466657 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.01■■■□□ 2.07
SIKE1-205ENST00000466657 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.01■■■□□ 2.07
SIKE1-205ENST00000466657 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
SIKE1-205ENST00000466657 IQGAP1P46940 1657 aa27.97■■■□□ 2.07
SIKE1-205ENST00000466657 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.96■■■□□ 2.07
SIKE1-205ENST00000466657 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.96■■■□□ 2.07
SIKE1-205ENST00000466657 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.96■■■□□ 2.07
SIKE1-205ENST00000466657 CPS1P31327 1500 aa27.96■■■□□ 2.07
SIKE1-205ENST00000466657 ADGRL2O95490 1459 aa27.95■■■□□ 2.06
SIKE1-205ENST00000466657 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.94■■■□□ 2.06
SIKE1-205ENST00000466657 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.93■■■□□ 2.06
SIKE1-205ENST00000466657 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
SIKE1-205ENST00000466657 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
SIKE1-205ENST00000466657 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.88■■■□□ 2.05
SIKE1-205ENST00000466657 SLIT1O75093 1534 aa27.87■■■□□ 2.05
SIKE1-205ENST00000466657 ARHGAP23Q9P227 1491 aa27.87■■■□□ 2.05
SIKE1-205ENST00000466657 PIK3C2BO00750 1634 aa27.86■■■□□ 2.05
SIKE1-205ENST00000466657 KANK1Q14678 1352 aa27.86■■■□□ 2.05
SIKE1-205ENST00000466657 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.84■■■□□ 2.05
SIKE1-205ENST00000466657 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.83■■■□□ 2.05
SIKE1-205ENST00000466657 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.82■■■□□ 2.04
SIKE1-205ENST00000466657 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
SIKE1-205ENST00000466657 SYNMO15061 1565 aa27.81■■■□□ 2.04
SIKE1-205ENST00000466657 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.8■■■□□ 2.04
SIKE1-205ENST00000466657 NOS1P29475 1434 aa27.76■■■□□ 2.04
SIKE1-205ENST00000466657 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.75■■■□□ 2.03
SIKE1-205ENST00000466657 ALKQ9UM73 1620 aa27.75■■■□□ 2.03
SIKE1-205ENST00000466657 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
SIKE1-205ENST00000466657 TET3O43151 1660 aa27.74■■■□□ 2.03
SIKE1-205ENST00000466657 UNC13BO14795 1591 aa27.73■■■□□ 2.03
SIKE1-205ENST00000466657 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.73■■■□□ 2.03
SIKE1-205ENST00000466657 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
SIKE1-205ENST00000466657 LTKP29376 864 aa27.72■■■□□ 2.03
SIKE1-205ENST00000466657 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.72■■■□□ 2.03
SIKE1-205ENST00000466657 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.71■■■□□ 2.03
SIKE1-205ENST00000466657 TMEM2Q9UHN6 1383 aa27.71■■■□□ 2.03
SIKE1-205ENST00000466657 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
SIKE1-205ENST00000466657 ADGRB3O60242 1522 aa27.69■■■□□ 2.02
SIKE1-205ENST00000466657 TOM1O60784 492 aa27.67■■■□□ 2.02
SIKE1-205ENST00000466657 TXNDC2Q86VQ3 553 aa27.67■■■□□ 2.02
SIKE1-205ENST00000466657 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.67■■■□□ 2.02
SIKE1-205ENST00000466657 ROCK1Q13464 1354 aa27.66■■■□□ 2.02
SIKE1-205ENST00000466657 IDI1Q13907 227 aa27.66■■■□□ 2.02
SIKE1-205ENST00000466657 EID1Q9Y6B2 187 aa27.63■■■□□ 2.01
SIKE1-205ENST00000466657 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.62■■■□□ 2.01
SIKE1-205ENST00000466657 E9PCH4 1651 aa27.62■■■□□ 2.01
SIKE1-205ENST00000466657 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.61■■■□□ 2.01
SIKE1-205ENST00000466657 ILDR2Q71H61 639 aa27.58■■■□□ 2.01
SIKE1-205ENST00000466657 STAG3Q9UJ98 1225 aa27.58■■■□□ 2.01
SIKE1-205ENST00000466657 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.57■■■□□ 2
SIKE1-205ENST00000466657 PIP4K2BP78356 416 aa27.56■■■□□ 2
SIKE1-205ENST00000466657 HSPA1LP34931 641 aa27.55■■■□□ 2
SIKE1-205ENST00000466657 ZFYVE9O95405 1425 aa27.53■■■□□ 2
SIKE1-205ENST00000466657 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
SIKE1-205ENST00000466657 NWD1Q149M9 1564 aa27.52■■■□□ 2
SIKE1-205ENST00000466657 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
SIKE1-205ENST00000466657 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.7 ms