RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 PKD2Q13563 968 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPN3-209ENST00000466222 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
CAPN3-209ENST00000466222 ABCA6Q8N139 1617 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPN3-209ENST00000466222 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPN3-209ENST00000466222 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPN3-209ENST00000466222 GGT6Q6P531 493 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPN3-209ENST00000466222 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPN3-209ENST00000466222 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPN3-209ENST00000466222 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPN3-209ENST00000466222 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPN3-209ENST00000466222 UNC13BO14795 1591 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPN3-209ENST00000466222 ATP10AO60312 1499 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPN3-209ENST00000466222 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
CAPN3-209ENST00000466222 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.89■■□□□ 1.89
CAPN3-209ENST00000466222 KANK1Q14678 1352 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPN3-209ENST00000466222 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
CAPN3-209ENST00000466222 DEPDC5O75140 1603 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPN3-209ENST00000466222 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
CAPN3-209ENST00000466222 MLECQ14165 292 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPN3-209ENST00000466222 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
CAPN3-209ENST00000466222 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPN3-209ENST00000466222 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.83■■□□□ 1.88
CAPN3-209ENST00000466222 PLA2R1Q13018 1463 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPN3-209ENST00000466222 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.81■■□□□ 1.88
CAPN3-209ENST00000466222 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.79■■□□□ 1.88
CAPN3-209ENST00000466222 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
CAPN3-209ENST00000466222 TONSLQ96HA7 1378 aa26.78■■□□□ 1.88
CAPN3-209ENST00000466222 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
CAPN3-209ENST00000466222 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CAPN3-209ENST00000466222 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
CAPN3-209ENST00000466222 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPN3-209ENST00000466222 REREQ9P2R6 1566 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPN3-209ENST00000466222 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPN3-209ENST00000466222 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPN3-209ENST00000466222 AGLP35573 1532 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPN3-209ENST00000466222 ABCC3O15438 1527 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPN3-209ENST00000466222 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
CAPN3-209ENST00000466222 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.7■■□□□ 1.87
CAPN3-209ENST00000466222 NPATQ14207 1427 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPN3-209ENST00000466222 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPN3-209ENST00000466222 E9PCH4 1651 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPN3-209ENST00000466222 TET3O43151 1660 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPN3-209ENST00000466222 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPN3-209ENST00000466222 PTPRTO14522 1441 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPN3-209ENST00000466222 RGL3Q3MIN7 710 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPN3-209ENST00000466222 CEP152O94986 1710 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPN3-209ENST00000466222 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
CAPN3-209ENST00000466222 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPN3-209ENST00000466222 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPN3-209ENST00000466222 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPN3-209ENST00000466222 TRPM2O94759 1503 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPN3-209ENST00000466222 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPN3-209ENST00000466222 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
CAPN3-209ENST00000466222 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPN3-209ENST00000466222 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPN3-209ENST00000466222 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPN3-209ENST00000466222 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CAPN3-209ENST00000466222 NOS1P29475 1434 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPN3-209ENST00000466222 ZMYM3Q14202 1370 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPN3-209ENST00000466222 CLTCL1P53675 1640 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPN3-209ENST00000466222 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPN3-209ENST00000466222 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
CAPN3-209ENST00000466222 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPN3-209ENST00000466222 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPN3-209ENST00000466222 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
CAPN3-209ENST00000466222 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CAPN3-209ENST00000466222 IDI1Q13907 227 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPN3-209ENST00000466222 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPN3-209ENST00000466222 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPN3-209ENST00000466222 SYNMO15061 1565 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPN3-209ENST00000466222 ERVK-7P63135 1459 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPN3-209ENST00000466222 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CAPN3-209ENST00000466222 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CAPN3-209ENST00000466222 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.39■■□□□ 1.81
CAPN3-209ENST00000466222 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPN3-209ENST00000466222 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
CAPN3-209ENST00000466222 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPN3-209ENST00000466222 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPN3-209ENST00000466222 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPN3-209ENST00000466222 ADGRB3O60242 1522 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPN3-209ENST00000466222 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPN3-209ENST00000466222 PIK3C2BO00750 1634 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPN3-209ENST00000466222 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPN3-209ENST00000466222 MIER1Q8N108 512 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPN3-209ENST00000466222 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
CAPN3-209ENST00000466222 TNRQ92752 1358 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPN3-209ENST00000466222 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPN3-209ENST00000466222 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPN3-209ENST00000466222 MROH2AA6NES4 1674 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPN3-209ENST00000466222 MADDQ8WXG6 1647 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPN3-209ENST00000466222 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CAPN3-209ENST00000466222 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPN3-209ENST00000466222 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPN3-209ENST00000466222 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CAPN3-209ENST00000466222 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPN3-209ENST00000466222 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPN3-209ENST00000466222 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.2■■□□□ 1.78
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