RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461214.1

COL5A3-202, Transcript of collagen type V alpha 3 chain, humanhuman

TSL 3

Gene COL5A3, Length 828 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A3-202ENST00000461214 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.87■■□□□ 1.09
COL5A3-202ENST00000461214 ROCK1Q13464 1354 aa21.87■■□□□ 1.09
COL5A3-202ENST00000461214 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
COL5A3-202ENST00000461214 PTPRKQ15262 1439 aa21.85■■□□□ 1.09
COL5A3-202ENST00000461214 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
COL5A3-202ENST00000461214 C3P01024 1663 aa21.84■■□□□ 1.09
COL5A3-202ENST00000461214 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.84■■□□□ 1.09
COL5A3-202ENST00000461214 TSPY4P0CV99 314 aa21.83■■□□□ 1.09
COL5A3-202ENST00000461214 TSPY10P0CW01 314 aa21.83■■□□□ 1.09
COL5A3-202ENST00000461214 AFAP1Q8N556 730 aa21.83■■□□□ 1.09
COL5A3-202ENST00000461214 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.82■■□□□ 1.08
COL5A3-202ENST00000461214 NCOA1Q15788 1441 aa21.81■■□□□ 1.08
COL5A3-202ENST00000461214 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
COL5A3-202ENST00000461214 DEPDC5O75140 1603 aa21.8■■□□□ 1.08
COL5A3-202ENST00000461214 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
COL5A3-202ENST00000461214 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
COL5A3-202ENST00000461214 HFM1A2PYH4 1435 aa21.78■■□□□ 1.08
COL5A3-202ENST00000461214 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.78■■□□□ 1.08
COL5A3-202ENST00000461214 ERBINQ96RT1 1412 aa21.77■■□□□ 1.08
COL5A3-202ENST00000461214 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
COL5A3-202ENST00000461214 A2MP01023 1474 aa21.76■■□□□ 1.07
COL5A3-202ENST00000461214 AGLP35573 1532 aa21.75■■□□□ 1.07
COL5A3-202ENST00000461214 KIF15Q9NS87 1388 aa21.75■■□□□ 1.07
COL5A3-202ENST00000461214 UNC13BO14795 1591 aa21.75■■□□□ 1.07
COL5A3-202ENST00000461214 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.75■■□□□ 1.07
COL5A3-202ENST00000461214 ITGAEP38570 1179 aa21.73■■□□□ 1.07
COL5A3-202ENST00000461214 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
COL5A3-202ENST00000461214 NAIPQ13075 1403 aa21.72■■□□□ 1.07
COL5A3-202ENST00000461214 PIP4K2BP78356 416 aa21.7■■□□□ 1.06
COL5A3-202ENST00000461214 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
COL5A3-202ENST00000461214 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
COL5A3-202ENST00000461214 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.69■■□□□ 1.06
COL5A3-202ENST00000461214 MROH1Q8NDA8 1641 aa21.69■■□□□ 1.06
COL5A3-202ENST00000461214 HSPA1LP34931 641 aa21.68■■□□□ 1.06
COL5A3-202ENST00000461214 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.68■■□□□ 1.06
COL5A3-202ENST00000461214 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.68■■□□□ 1.06
COL5A3-202ENST00000461214 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
COL5A3-202ENST00000461214 CEP152O94986 1710 aa21.66■■□□□ 1.06
COL5A3-202ENST00000461214 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.66■■□□□ 1.06
COL5A3-202ENST00000461214 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
COL5A3-202ENST00000461214 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.64■■□□□ 1.06
COL5A3-202ENST00000461214 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.63■■□□□ 1.05
COL5A3-202ENST00000461214 MROH2AA6NES4 1674 aa21.63■■□□□ 1.05
COL5A3-202ENST00000461214 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.62■■□□□ 1.05
COL5A3-202ENST00000461214 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.62■■□□□ 1.05
COL5A3-202ENST00000461214 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.61■■□□□ 1.05
COL5A3-202ENST00000461214 TET3O43151 1660 aa21.6■■□□□ 1.05
COL5A3-202ENST00000461214 PKD2Q13563 968 aa21.59■■□□□ 1.05
COL5A3-202ENST00000461214 NPATQ14207 1427 aa21.59■■□□□ 1.05
COL5A3-202ENST00000461214 ZMYM3Q14202 1370 aa21.59■■□□□ 1.05
COL5A3-202ENST00000461214 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.58■■□□□ 1.05
COL5A3-202ENST00000461214 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
COL5A3-202ENST00000461214 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
COL5A3-202ENST00000461214 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
COL5A3-202ENST00000461214 TOM1O60784 492 aa21.55■■□□□ 1.04
COL5A3-202ENST00000461214 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.55■■□□□ 1.04
COL5A3-202ENST00000461214 PLA2R1Q13018 1463 aa21.52■■□□□ 1.04
COL5A3-202ENST00000461214 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.52■■□□□ 1.04
COL5A3-202ENST00000461214 LMTK2Q8IWU2 1503 aa21.52■■□□□ 1.04
COL5A3-202ENST00000461214 ABCC3O15438 1527 aa21.51■■□□□ 1.03
COL5A3-202ENST00000461214 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.5■■□□□ 1.03
COL5A3-202ENST00000461214 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
COL5A3-202ENST00000461214 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.5■■□□□ 1.03
COL5A3-202ENST00000461214 E9PCH4 1651 aa21.5■■□□□ 1.03
COL5A3-202ENST00000461214 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
COL5A3-202ENST00000461214 KIF3BO15066 747 aa21.48■■□□□ 1.03
COL5A3-202ENST00000461214 HRCP23327 699 aa21.48■■□□□ 1.03
COL5A3-202ENST00000461214 KANK1Q14678 1352 aa21.47■■□□□ 1.03
COL5A3-202ENST00000461214 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.46■■□□□ 1.03
COL5A3-202ENST00000461214 GGT6Q6P531 493 aa21.44■■□□□ 1.02
COL5A3-202ENST00000461214 PZPP20742 1482 aa21.44■■□□□ 1.02
COL5A3-202ENST00000461214 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
COL5A3-202ENST00000461214 CPS1P31327 1500 aa21.41■■□□□ 1.02
COL5A3-202ENST00000461214 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
COL5A3-202ENST00000461214 NUP155O75694 1391 aa21.39■■□□□ 1.02
COL5A3-202ENST00000461214 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.37■■□□□ 1.01
COL5A3-202ENST00000461214 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.36■■□□□ 1.01
COL5A3-202ENST00000461214 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
COL5A3-202ENST00000461214 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.32■■□□□ 1
COL5A3-202ENST00000461214 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.32■■□□□ 1
COL5A3-202ENST00000461214 TRIM52Q96A61 297 aa21.32■■□□□ 1
COL5A3-202ENST00000461214 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.32■■□□□ 1
COL5A3-202ENST00000461214 PIK3C2BO00750 1634 aa21.31■■□□□ 1
COL5A3-202ENST00000461214 KIF1BO60333 1816 aa21.31■■□□□ 1
COL5A3-202ENST00000461214 TRPM2O94759 1503 aa21.3■■□□□ 1
COL5A3-202ENST00000461214 ALKQ9UM73 1620 aa21.3■■□□□ 1
COL5A3-202ENST00000461214 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
COL5A3-202ENST00000461214 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
COL5A3-202ENST00000461214 SYNMO15061 1565 aa21.28■■□□□ 1
COL5A3-202ENST00000461214 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
COL5A3-202ENST00000461214 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.28■■□□□ 1
COL5A3-202ENST00000461214 ERVK-7P63135 1459 aa21.27■■□□□ 1
COL5A3-202ENST00000461214 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
COL5A3-202ENST00000461214 TNRQ92752 1358 aa21.26■□□□□ 0.99
COL5A3-202ENST00000461214 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
COL5A3-202ENST00000461214 CLTCL1P53675 1640 aa21.25■□□□□ 0.99
COL5A3-202ENST00000461214 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.25■□□□□ 0.99
COL5A3-202ENST00000461214 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.24■□□□□ 0.99
COL5A3-202ENST00000461214 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
COL5A3-202ENST00000461214 NOS1P29475 1434 aa21.22■□□□□ 0.99
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