RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448775.3

CLMP-201, Transcript of CXADR like membrane protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLMP, Length 5,072 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMP-201ENST00000448775 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CLMP-201ENST00000448775 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CLMP-201ENST00000448775 KANK1Q14678 1352 aa22.5■■□□□ 1.19
CLMP-201ENST00000448775 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.5■■□□□ 1.19
CLMP-201ENST00000448775 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.49■■□□□ 1.19
CLMP-201ENST00000448775 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CLMP-201ENST00000448775 MRE11P49959 708 aa22.48■■□□□ 1.19
CLMP-201ENST00000448775 HMMRO75330 724 aa22.46■■□□□ 1.19
CLMP-201ENST00000448775 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CLMP-201ENST00000448775 USP47Q96K76 1375 aa22.45■■□□□ 1.18
CLMP-201ENST00000448775 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.45■■□□□ 1.18
CLMP-201ENST00000448775 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.45■■□□□ 1.18
CLMP-201ENST00000448775 CCDC7Q96M83 1385 aa22.45■■□□□ 1.18
CLMP-201ENST00000448775 COG6Q9Y2V7 657 aa22.45■■□□□ 1.18
CLMP-201ENST00000448775 TPM4P67936 248 aa22.44■■□□□ 1.18
CLMP-201ENST00000448775 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.44■■□□□ 1.18
CLMP-201ENST00000448775 PANK3Q9H999 370 aa22.44■■□□□ 1.18
CLMP-201ENST00000448775 GGT6Q6P531 493 aa22.44■■□□□ 1.18
CLMP-201ENST00000448775 MAP7D2Q96T17 732 aa22.44■■□□□ 1.18
CLMP-201ENST00000448775 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.43■■□□□ 1.18
CLMP-201ENST00000448775 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.42■■□□□ 1.18
CLMP-201ENST00000448775 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.41■■□□□ 1.18
CLMP-201ENST00000448775 NGEFQ8N5V2 710 aa22.41■■□□□ 1.18
CLMP-201ENST00000448775 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CLMP-201ENST00000448775 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CLMP-201ENST00000448775 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
CLMP-201ENST00000448775 JPH4Q96JJ6 628 aa22.39■■□□□ 1.18
CLMP-201ENST00000448775 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.38■■□□□ 1.17
CLMP-201ENST00000448775 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
CLMP-201ENST00000448775 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CLMP-201ENST00000448775 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CLMP-201ENST00000448775 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CLMP-201ENST00000448775 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.37■■□□□ 1.17
CLMP-201ENST00000448775 TPM2P07951 284 aa22.37■■□□□ 1.17
CLMP-201ENST00000448775 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CLMP-201ENST00000448775 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa22.37■■□□□ 1.17
CLMP-201ENST00000448775 KIF16BQ96L93 1317 aa22.37■■□□□ 1.17
CLMP-201ENST00000448775 MLECQ14165 292 aa22.36■■□□□ 1.17
CLMP-201ENST00000448775 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CLMP-201ENST00000448775 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.36■■□□□ 1.17
CLMP-201ENST00000448775 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.35■■□□□ 1.17
CLMP-201ENST00000448775 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CLMP-201ENST00000448775 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
CLMP-201ENST00000448775 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.35■■□□□ 1.17
CLMP-201ENST00000448775 BACH2Q9BYV9 841 aa22.33■■□□□ 1.17
CLMP-201ENST00000448775 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.33■■□□□ 1.17
CLMP-201ENST00000448775 APAF1O14727 1248 aa22.33■■□□□ 1.16
CLMP-201ENST00000448775 AAMPQ13685 434 aa22.33■■□□□ 1.16
CLMP-201ENST00000448775 IGF1RP08069 1367 aa22.32■■□□□ 1.16
CLMP-201ENST00000448775 MSH5O43196 834 aa22.32■■□□□ 1.16
CLMP-201ENST00000448775 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CLMP-201ENST00000448775 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.32■■□□□ 1.16
CLMP-201ENST00000448775 A0A0G2JS52 829 aa22.31■■□□□ 1.16
CLMP-201ENST00000448775 NUCB2P80303 420 aa22.31■■□□□ 1.16
CLMP-201ENST00000448775 TRAK2O60296 914 aa22.3■■□□□ 1.16
CLMP-201ENST00000448775 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.3■■□□□ 1.16
CLMP-201ENST00000448775 STK31Q9BXU1 1019 aa22.3■■□□□ 1.16
CLMP-201ENST00000448775 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CLMP-201ENST00000448775 UACAQ9BZF9 1416 aa22.28■■□□□ 1.16
CLMP-201ENST00000448775 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CLMP-201ENST00000448775 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.28■■□□□ 1.16
CLMP-201ENST00000448775 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.28■■□□□ 1.16
CLMP-201ENST00000448775 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CLMP-201ENST00000448775 KIF3BO15066 747 aa22.27■■□□□ 1.16
CLMP-201ENST00000448775 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.27■■□□□ 1.16
CLMP-201ENST00000448775 GPATCH3Q96I76 525 aa22.26■■□□□ 1.15
CLMP-201ENST00000448775 REC8O95072 547 aa22.26■■□□□ 1.15
CLMP-201ENST00000448775 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.26■■□□□ 1.15
CLMP-201ENST00000448775 STK26Q9P289 416 aa22.26■■□□□ 1.15
CLMP-201ENST00000448775 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.25■■□□□ 1.15
CLMP-201ENST00000448775 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CLMP-201ENST00000448775 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.25■■□□□ 1.15
CLMP-201ENST00000448775 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.24■■□□□ 1.15
CLMP-201ENST00000448775 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CLMP-201ENST00000448775 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.24■■□□□ 1.15
CLMP-201ENST00000448775 KIF3AQ9Y496 699 aa22.23■■□□□ 1.15
CLMP-201ENST00000448775 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.23■■□□□ 1.15
CLMP-201ENST00000448775 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.22■■□□□ 1.15
CLMP-201ENST00000448775 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.22■■□□□ 1.15
CLMP-201ENST00000448775 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CLMP-201ENST00000448775 SOX12O15370 315 aa22.21■■□□□ 1.15
CLMP-201ENST00000448775 BECN2A8MW95 431 aa22.21■■□□□ 1.15
CLMP-201ENST00000448775 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CLMP-201ENST00000448775 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.21■■□□□ 1.15
CLMP-201ENST00000448775 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CLMP-201ENST00000448775 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CLMP-201ENST00000448775 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CLMP-201ENST00000448775 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.21■■□□□ 1.15
CLMP-201ENST00000448775 NCAPD3P42695 1498 aa22.2■■□□□ 1.14
CLMP-201ENST00000448775 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CLMP-201ENST00000448775 MCTP1Q6DN14 999 aa22.2■■□□□ 1.14
CLMP-201ENST00000448775 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.2■■□□□ 1.14
CLMP-201ENST00000448775 AKNAQ7Z591 1439 aa22.2■■□□□ 1.14
CLMP-201ENST00000448775 GPS2Q13227 327 aa22.18■■□□□ 1.14
CLMP-201ENST00000448775 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CLMP-201ENST00000448775 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.18■■□□□ 1.14
CLMP-201ENST00000448775 ZNF592Q92610 1267 aa22.18■■□□□ 1.14
CLMP-201ENST00000448775 KIF21BO75037 1637 aa22.17■■□□□ 1.14
CLMP-201ENST00000448775 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.17■■□□□ 1.14
CLMP-201ENST00000448775 TEX35Q5T0J7 233 aa22.17■■□□□ 1.14
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