RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-206ENST00000446904 MAP3K1Q13233 1512 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-206ENST00000446904 LTBP4Q8N2S1 1624 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4-206ENST00000446904 MYOM3Q5VTT5 1437 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4-206ENST00000446904 PKD2Q13563 968 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4-206ENST00000446904 TNRQ92752 1358 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4-206ENST00000446904 PLA2R1Q13018 1463 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-206ENST00000446904 KDM5DQ9BY66 1539 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-206ENST00000446904 A2ML1A8K2U0 1454 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-206ENST00000446904 APLP2Q06481 763 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-206ENST00000446904 PZPP20742 1482 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-206ENST00000446904 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-206ENST00000446904 MIA2Q96PC5 1412 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM135AQ9P2D6 1515 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-206ENST00000446904 MAST1Q9Y2H9 1570 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-206ENST00000446904 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-206ENST00000446904 ABCC3O15438 1527 aa16.14■□□□□ 0.18
SH3BP4-206ENST00000446904 IQSEC2Q5JU85 1478 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4-206ENST00000446904 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4-206ENST00000446904 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4-206ENST00000446904 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4-206ENST00000446904 KIF15Q9NS87 1388 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4-206ENST00000446904 ABCC5O15440 1437 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4-206ENST00000446904 NLRP1Q9C000 1473 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4-206ENST00000446904 ANKLE2Q86XL3 938 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4-206ENST00000446904 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4-206ENST00000446904 UBAP1LF5GYI3 381 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4-206ENST00000446904 DUOX2Q9NRD8 1548 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4-206ENST00000446904 MROH1Q8NDA8 1641 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-206ENST00000446904 PTPN23Q9H3S7 1636 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-206ENST00000446904 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-206ENST00000446904 FGD6Q6ZV73 1430 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-206ENST00000446904 SHANK2Q9UPX8 1470 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-206ENST00000446904 NEURL4Q96JN8 1562 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-206ENST00000446904 UGGT1Q9NYU2 1555 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-206ENST00000446904 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.162e-7■□□□□ 11
SH3BP4-206ENST00000446904 CHIC2Q9UKJ5 165 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-206ENST00000446904 DAPK1P53355 1430 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-206ENST00000446904 ERVK-7P63135 1459 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-206ENST00000446904 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-206ENST00000446904 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-206ENST00000446904 ERBINQ96RT1 1412 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-206ENST00000446904 DISP3Q9P2K9 1392 aa16.06■□□□□ 0.16
SH3BP4-206ENST00000446904 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SH3BP4-206ENST00000446904 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SH3BP4-206ENST00000446904 CROCC2H7BZ55 1655 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-206ENST00000446904 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-206ENST00000446904 CEP152O94986 1710 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-206ENST00000446904 MED14O60244 1454 aa16.02■□□□□ 0.15
SH3BP4-206ENST00000446904 CPS1P31327 1500 aa16.01■□□□□ 0.15
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SH3BP4-206ENST00000446904 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa16.01■□□□□ 0.15
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SH3BP4-206ENST00000446904 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SH3BP4-206ENST00000446904 DEPDC5O75140 1603 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-206ENST00000446904 VWDEQ8N2E2 1590 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-206ENST00000446904 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-206ENST00000446904 PIP4K2BP78356 416 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-206ENST00000446904 ILDR2Q71H61 639 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-206ENST00000446904 TOM1O60784 492 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-206ENST00000446904 LTKP29376 864 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-206ENST00000446904 TXNDC2Q86VQ3 553 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-206ENST00000446904 IQGAP1P46940 1657 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-206ENST00000446904 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
SH3BP4-206ENST00000446904 UBR1Q8IWV7 1749 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-206ENST00000446904 STAG3Q9UJ98 1225 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-206ENST00000446904 HSPA1LP34931 641 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-206ENST00000446904 EID1Q9Y6B2 187 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-206ENST00000446904 ADGRL2O95490 1459 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-206ENST00000446904 ARHGAP23Q9P227 1491 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-206ENST00000446904 IDI1Q13907 227 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-206ENST00000446904 SLIT1O75093 1534 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-206ENST00000446904 LMTK2Q8IWU2 1503 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM2Q9UHN6 1383 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-206ENST00000446904 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-206ENST00000446904 LRRC7Q96NW7 1537 aa15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4-206ENST00000446904 PIK3C2BO00750 1634 aa15.9■□□□□ 0.14
SH3BP4-206ENST00000446904 STRCP1A6NGW2 1772 aa15.89■□□□□ 0.13
SH3BP4-206ENST00000446904 EFCAB6Q5THR3 1501 aa15.89■□□□□ 0.13
SH3BP4-206ENST00000446904 NOS1P29475 1434 aa15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4-206ENST00000446904 FOXD1Q16676 465 aa15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4-206ENST00000446904 SYNMO15061 1565 aa15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4-206ENST00000446904 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4-206ENST00000446904 ALKQ9UM73 1620 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC52A1Q9NWF4 448 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-206ENST00000446904 SOCS7O14512 581 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4-206ENST00000446904 ITGAEP38570 1179 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC26A8Q96RN1 970 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-206ENST00000446904 BCANQ96GW7 911 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-206ENST00000446904 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-206ENST00000446904 ADGRB3O60242 1522 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-206ENST00000446904 ROCK1Q13464 1354 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-206ENST00000446904 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-206ENST00000446904 KCNA6P17658 529 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4-206ENST00000446904 TET3O43151 1660 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM94Q12767 1356 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-206ENST00000446904 CHGAP10645 457 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
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