RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 PLA2R1Q13018 1463 aa21.94■■□□□ 1.1
SHQ1-202ENST00000444040 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.93■■□□□ 1.1
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.93■■□□□ 1.1
SHQ1-202ENST00000444040 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.93■■□□□ 1.1
SHQ1-202ENST00000444040 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.92■■□□□ 1.1
SHQ1-202ENST00000444040 PLCH2O75038 1416 aa21.91■■□□□ 1.1
SHQ1-202ENST00000444040 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.91■■□□□ 1.1
SHQ1-202ENST00000444040 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.9■■□□□ 1.1
SHQ1-202ENST00000444040 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.9■■□□□ 1.1
SHQ1-202ENST00000444040 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.89■■□□□ 1.09
SHQ1-202ENST00000444040 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
SHQ1-202ENST00000444040 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.88■■□□□ 1.09
SHQ1-202ENST00000444040 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa21.88■■□□□ 1.09
SHQ1-202ENST00000444040 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SHQ1-202ENST00000444040 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.87■■□□□ 1.09
SHQ1-202ENST00000444040 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.092e-6■■■■□ 20.7
SHQ1-202ENST00000444040 ERBINQ96RT1 1412 aa21.86■■□□□ 1.09
SHQ1-202ENST00000444040 A2MP01023 1474 aa21.85■■□□□ 1.09
SHQ1-202ENST00000444040 ATP10AO60312 1499 aa21.84■■□□□ 1.09
SHQ1-202ENST00000444040 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.84■■□□□ 1.09
SHQ1-202ENST00000444040 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.83■■□□□ 1.09
SHQ1-202ENST00000444040 ABCC1P33527 1531 aa21.83■■□□□ 1.09
SHQ1-202ENST00000444040 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
SHQ1-202ENST00000444040 RGL3Q3MIN7 710 aa21.82■■□□□ 1.08
SHQ1-202ENST00000444040 E9PCH4 1651 aa21.82■■□□□ 1.08
SHQ1-202ENST00000444040 MYT1Q01538 1121 aa21.81■■□□□ 1.08
SHQ1-202ENST00000444040 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SHQ1-202ENST00000444040 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.8■■□□□ 1.08
SHQ1-202ENST00000444040 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.8■■□□□ 1.08
SHQ1-202ENST00000444040 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SHQ1-202ENST00000444040 LAMC1P11047 1609 aa21.78■■□□□ 1.08
SHQ1-202ENST00000444040 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SHQ1-202ENST00000444040 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
SHQ1-202ENST00000444040 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.76■■□□□ 1.07
SHQ1-202ENST00000444040 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SHQ1-202ENST00000444040 RALBP1Q15311 655 aa21.75■■□□□ 1.07
SHQ1-202ENST00000444040 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.75■■□□□ 1.07
SHQ1-202ENST00000444040 TMC1Q8TDI8 760 aa21.75■■□□□ 1.07
SHQ1-202ENST00000444040 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SHQ1-202ENST00000444040 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SHQ1-202ENST00000444040 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SHQ1-202ENST00000444040 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.73■■□□□ 1.07
SHQ1-202ENST00000444040 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SHQ1-202ENST00000444040 TESK2Q96S53 571 aa21.71■■□□□ 1.07
SHQ1-202ENST00000444040 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
SHQ1-202ENST00000444040 NUDCQ9Y266 331 aa21.7■■□□□ 1.06
SHQ1-202ENST00000444040 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.69■■□□□ 1.06
SHQ1-202ENST00000444040 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SHQ1-202ENST00000444040 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SHQ1-202ENST00000444040 AFAP1Q8N556 730 aa21.69■■□□□ 1.06
SHQ1-202ENST00000444040 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.68■■□□□ 1.06
SHQ1-202ENST00000444040 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.67■■□□□ 1.06
SHQ1-202ENST00000444040 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.66■■□□□ 1.06
SHQ1-202ENST00000444040 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.65■■□□□ 1.06
SHQ1-202ENST00000444040 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SHQ1-202ENST00000444040 TRPM2O94759 1503 aa21.63■■□□□ 1.05
SHQ1-202ENST00000444040 DEPDC5O75140 1603 aa21.63■■□□□ 1.05
SHQ1-202ENST00000444040 PTPRTO14522 1441 aa21.62■■□□□ 1.05
SHQ1-202ENST00000444040 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.62■■□□□ 1.05
SHQ1-202ENST00000444040 NLRP13Q86W25 1043 aa21.62■■□□□ 1.05
SHQ1-202ENST00000444040 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.61■■□□□ 1.05
SHQ1-202ENST00000444040 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.6■■□□□ 1.05
SHQ1-202ENST00000444040 FANCAO15360 1455 aa21.6■■□□□ 1.05
SHQ1-202ENST00000444040 MADDQ8WXG6 1647 aa21.59■■□□□ 1.05
SHQ1-202ENST00000444040 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SHQ1-202ENST00000444040 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.59■■□□□ 1.05
SHQ1-202ENST00000444040 TMF1P82094 1093 aa21.59■■□□□ 1.05
SHQ1-202ENST00000444040 ATP7AQ04656 1500 aa21.58■■□□□ 1.05
SHQ1-202ENST00000444040 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.57■■□□□ 1.04
SHQ1-202ENST00000444040 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.57■■□□□ 1.04
SHQ1-202ENST00000444040 CEP152O94986 1710 aa21.56■■□□□ 1.04
SHQ1-202ENST00000444040 PANK3Q9H999 370 aa21.56■■□□□ 1.04
SHQ1-202ENST00000444040 TET3O43151 1660 aa21.56■■□□□ 1.04
SHQ1-202ENST00000444040 CLTCL1P53675 1640 aa21.56■■□□□ 1.04
SHQ1-202ENST00000444040 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.55■■□□□ 1.04
SHQ1-202ENST00000444040 STAC3Q96MF2 364 aa21.55■■□□□ 1.04
SHQ1-202ENST00000444040 IQGAP1P46940 1657 aa21.53■■□□□ 1.04
SHQ1-202ENST00000444040 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.52■■□□□ 1.04
SHQ1-202ENST00000444040 ADGRL1O94910 1474 aa21.52■■□□□ 1.04
SHQ1-202ENST00000444040 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SHQ1-202ENST00000444040 KANK1Q14678 1352 aa21.51■■□□□ 1.03
SHQ1-202ENST00000444040 ASXL2Q76L83 1435 aa21.5■■□□□ 1.03
SHQ1-202ENST00000444040 MROH1Q8NDA8 1641 aa21.49■■□□□ 1.03
SHQ1-202ENST00000444040 INSRP06213 1382 aa21.49■■□□□ 1.03
SHQ1-202ENST00000444040 KIF3BO15066 747 aa21.49■■□□□ 1.03
SHQ1-202ENST00000444040 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SHQ1-202ENST00000444040 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.48■■□□□ 1.03
SHQ1-202ENST00000444040 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.48■■□□□ 1.03
SHQ1-202ENST00000444040 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.47■■□□□ 1.03
SHQ1-202ENST00000444040 PDE3BQ13370 1112 aa21.45■■□□□ 1.02
SHQ1-202ENST00000444040 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SHQ1-202ENST00000444040 MSH5O43196 834 aa21.42■■□□□ 1.02
SHQ1-202ENST00000444040 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.42■■□□□ 1.02
SHQ1-202ENST00000444040 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.41■■□□□ 1.02
SHQ1-202ENST00000444040 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.41■■□□□ 1.02
SHQ1-202ENST00000444040 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SHQ1-202ENST00000444040 SYNMO15061 1565 aa21.4■■□□□ 1.02
SHQ1-202ENST00000444040 CDCA8Q53HL2 280 aa21.4■■□□□ 1.02
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.4■■□□□ 1.02
SHQ1-202ENST00000444040 UGGT1Q9NYU2 1555 aa21.4■■□□□ 1.02
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