RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 KDM5DQ9BY66 1539 aa19.52■□□□□ 0.72
PRAME-208ENST00000438888 TNRQ92752 1358 aa19.52■□□□□ 0.72
PRAME-208ENST00000438888 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa19.52■□□□□ 0.72
PRAME-208ENST00000438888 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa19.51■□□□□ 0.71
PRAME-208ENST00000438888 TSPY4P0CV99 314 aa19.51■□□□□ 0.71
PRAME-208ENST00000438888 TSPY10P0CW01 314 aa19.51■□□□□ 0.71
PRAME-208ENST00000438888 RSPH4AQ5TD94 716 aa19.51■□□□□ 0.71
PRAME-208ENST00000438888 ARHGEF5Q12774 1597 aa19.5■□□□□ 0.71
PRAME-208ENST00000438888 IQSEC2Q5JU85 1478 aa19.5■□□□□ 0.71
PRAME-208ENST00000438888 PZPP20742 1482 aa19.49■□□□□ 0.71
PRAME-208ENST00000438888 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
PRAME-208ENST00000438888 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
PRAME-208ENST00000438888 UBAP1LF5GYI3 381 aa19.46■□□□□ 0.71
PRAME-208ENST00000438888 FAM135AQ9P2D6 1515 aa19.45■□□□□ 0.7
PRAME-208ENST00000438888 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP19.43■□□□□ 0.7
PRAME-208ENST00000438888 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa19.42■□□□□ 0.7
PRAME-208ENST00000438888 ILDR2Q71H61 639 aa19.42■□□□□ 0.7
PRAME-208ENST00000438888 MYOM3Q5VTT5 1437 aa19.42■□□□□ 0.7
PRAME-208ENST00000438888 MIA2Q96PC5 1412 aa19.41■□□□□ 0.7
PRAME-208ENST00000438888 NEURL4Q96JN8 1562 aa19.4■□□□□ 0.7
PRAME-208ENST00000438888 MAST1Q9Y2H9 1570 aa19.4■□□□□ 0.7
PRAME-208ENST00000438888 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.7
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PRAME-208ENST00000438888 MAP3K1Q13233 1512 aa19.38■□□□□ 0.69
PRAME-208ENST00000438888 ANKLE2Q86XL3 938 aa19.38■□□□□ 0.69
PRAME-208ENST00000438888 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
PRAME-208ENST00000438888 UGGT1Q9NYU2 1555 aa19.38■□□□□ 0.69
PRAME-208ENST00000438888 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
PRAME-208ENST00000438888 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
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PRAME-208ENST00000438888 ERVK-7P63135 1459 aa19.34■□□□□ 0.69
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PRAME-208ENST00000438888 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.69
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PRAME-208ENST00000438888 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
PRAME-208ENST00000438888 CPS1P31327 1500 aa19.32■□□□□ 0.68
PRAME-208ENST00000438888 DUOX2Q9NRD8 1548 aa19.32■□□□□ 0.68
PRAME-208ENST00000438888 KIF15Q9NS87 1388 aa19.32■□□□□ 0.68
PRAME-208ENST00000438888 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa19.31■□□□□ 0.68
PRAME-208ENST00000438888 CEP152O94986 1710 aa19.31■□□□□ 0.68
PRAME-208ENST00000438888 VWDEQ8N2E2 1590 aa19.29■□□□□ 0.68
PRAME-208ENST00000438888 ABCC5O15440 1437 aa19.29■□□□□ 0.68
PRAME-208ENST00000438888 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.29■□□□□ 0.68
PRAME-208ENST00000438888 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP19.28■□□□□ 0.68
PRAME-208ENST00000438888 MED14O60244 1454 aa19.28■□□□□ 0.68
PRAME-208ENST00000438888 DEPDC5O75140 1603 aa19.27■□□□□ 0.68
PRAME-208ENST00000438888 IQGAP1P46940 1657 aa19.27■□□□□ 0.67
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PRAME-208ENST00000438888 TOM1O60784 492 aa19.26■□□□□ 0.67
PRAME-208ENST00000438888 HSPA1LP34931 641 aa19.26■□□□□ 0.67
PRAME-208ENST00000438888 CROCC2H7BZ55 1655 aa19.26■□□□□ 0.67
PRAME-208ENST00000438888 DAPK1P53355 1430 aa19.25■□□□□ 0.67
PRAME-208ENST00000438888 CHIC2Q9UKJ5 165 aa19.25■□□□□ 0.67
PRAME-208ENST00000438888 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
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PRAME-208ENST00000438888 FGD6Q6ZV73 1430 aa19.24■□□□□ 0.67
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PRAME-208ENST00000438888 UBR1Q8IWV7 1749 aa19.21■□□□□ 0.67
PRAME-208ENST00000438888 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
PRAME-208ENST00000438888 KANK1Q14678 1352 aa19.19■□□□□ 0.66
PRAME-208ENST00000438888 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa19.18■□□□□ 0.66
PRAME-208ENST00000438888 LTKP29376 864 aa19.18■□□□□ 0.66
PRAME-208ENST00000438888 TXNDC2Q86VQ3 553 aa19.18■□□□□ 0.66
PRAME-208ENST00000438888 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa19.18■□□□□ 0.66
PRAME-208ENST00000438888 STRCP1A6NGW2 1772 aa19.17■□□□□ 0.66
PRAME-208ENST00000438888 LRRC7Q96NW7 1537 aa19.17■□□□□ 0.66
PRAME-208ENST00000438888 STAG3Q9UJ98 1225 aa19.17■□□□□ 0.66
PRAME-208ENST00000438888 ALKQ9UM73 1620 aa19.15■□□□□ 0.66
PRAME-208ENST00000438888 ARHGAP23Q9P227 1491 aa19.15■□□□□ 0.66
PRAME-208ENST00000438888 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
PRAME-208ENST00000438888 PIK3C2BO00750 1634 aa19.14■□□□□ 0.66
PRAME-208ENST00000438888 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
PRAME-208ENST00000438888 EID1Q9Y6B2 187 aa19.14■□□□□ 0.65
PRAME-208ENST00000438888 SLIT1O75093 1534 aa19.14■□□□□ 0.65
PRAME-208ENST00000438888 SYNMO15061 1565 aa19.14■□□□□ 0.65
PRAME-208ENST00000438888 TMEM2Q9UHN6 1383 aa19.11■□□□□ 0.65
PRAME-208ENST00000438888 LMTK2Q8IWU2 1503 aa19.1■□□□□ 0.65
PRAME-208ENST00000438888 IDI1Q13907 227 aa19.09■□□□□ 0.65
PRAME-208ENST00000438888 EFCAB6Q5THR3 1501 aa19.09■□□□□ 0.65
PRAME-208ENST00000438888 ADGRL2O95490 1459 aa19.07■□□□□ 0.64
PRAME-208ENST00000438888 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
PRAME-208ENST00000438888 NOS1P29475 1434 aa19.04■□□□□ 0.64
PRAME-208ENST00000438888 SLC26A8Q96RN1 970 aa19.04■□□□□ 0.64
PRAME-208ENST00000438888 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa19.04■□□□□ 0.64
PRAME-208ENST00000438888 BCANQ96GW7 911 aa19.03■□□□□ 0.64
PRAME-208ENST00000438888 ADGRB3O60242 1522 aa19.03■□□□□ 0.64
PRAME-208ENST00000438888 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
PRAME-208ENST00000438888 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
PRAME-208ENST00000438888 TMEM94Q12767 1356 aa19■□□□□ 0.63
PRAME-208ENST00000438888 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
PRAME-208ENST00000438888 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
PRAME-208ENST00000438888 SLC52A1Q9NWF4 448 aa18.98■□□□□ 0.63
PRAME-208ENST00000438888 KCNA6P17658 529 aa18.97■□□□□ 0.63
PRAME-208ENST00000438888 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
PRAME-208ENST00000438888 TET3O43151 1660 aa18.96■□□□□ 0.63
PRAME-208ENST00000438888 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
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