RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438357.1

RPS6KA3-202, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A3, humanhuman

TSL 5

Gene RPS6KA3, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3-202ENST00000438357 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.45■■□□□ 1.34
RPS6KA3-202ENST00000438357 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.45■■□□□ 1.34
RPS6KA3-202ENST00000438357 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.44■■□□□ 1.34
RPS6KA3-202ENST00000438357 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.44■■□□□ 1.34
RPS6KA3-202ENST00000438357 PLA2R1Q13018 1463 aa23.43■■□□□ 1.34
RPS6KA3-202ENST00000438357 MIA2Q96PC5 1412 aa23.43■■□□□ 1.34
RPS6KA3-202ENST00000438357 PKD2Q13563 968 aa23.43■■□□□ 1.34
RPS6KA3-202ENST00000438357 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.42■■□□□ 1.34
RPS6KA3-202ENST00000438357 APLP2Q06481 763 aa23.41■■□□□ 1.34
RPS6KA3-202ENST00000438357 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
RPS6KA3-202ENST00000438357 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.4■■□□□ 1.34
RPS6KA3-202ENST00000438357 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.4■■□□□ 1.34
RPS6KA3-202ENST00000438357 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.4■■□□□ 1.34
RPS6KA3-202ENST00000438357 TNRQ92752 1358 aa23.4■■□□□ 1.34
RPS6KA3-202ENST00000438357 PZPP20742 1482 aa23.39■■□□□ 1.34
RPS6KA3-202ENST00000438357 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
RPS6KA3-202ENST00000438357 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
RPS6KA3-202ENST00000438357 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.35■■□□□ 1.33
RPS6KA3-202ENST00000438357 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
RPS6KA3-202ENST00000438357 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA3-202ENST00000438357 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA3-202ENST00000438357 NLRP1Q9C000 1473 aa23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA3-202ENST00000438357 ABCC3O15438 1527 aa23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA3-202ENST00000438357 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA3-202ENST00000438357 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
RPS6KA3-202ENST00000438357 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
RPS6KA3-202ENST00000438357 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.26■■□□□ 1.31
RPS6KA3-202ENST00000438357 KIF15Q9NS87 1388 aa23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA3-202ENST00000438357 ABCC5O15440 1437 aa23.25■■□□□ 1.31
RPS6KA3-202ENST00000438357 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.24■■□□□ 1.31
RPS6KA3-202ENST00000438357 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.24■■□□□ 1.31
RPS6KA3-202ENST00000438357 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.312e-9■■■■□ 23
RPS6KA3-202ENST00000438357 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.23■■□□□ 1.31
RPS6KA3-202ENST00000438357 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA3-202ENST00000438357 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA3-202ENST00000438357 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA3-202ENST00000438357 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA3-202ENST00000438357 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.2■■□□□ 1.3
RPS6KA3-202ENST00000438357 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.2■■□□□ 1.3
RPS6KA3-202ENST00000438357 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.2■■□□□ 1.3
RPS6KA3-202ENST00000438357 DAPK1P53355 1430 aa23.2■■□□□ 1.3
RPS6KA3-202ENST00000438357 ERBINQ96RT1 1412 aa23.2■■□□□ 1.3
RPS6KA3-202ENST00000438357 ERVK-7P63135 1459 aa23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA3-202ENST00000438357 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA3-202ENST00000438357 CEP152O94986 1710 aa23.16■■□□□ 1.3
RPS6KA3-202ENST00000438357 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
RPS6KA3-202ENST00000438357 MED14O60244 1454 aa23.14■■□□□ 1.29
RPS6KA3-202ENST00000438357 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.14■■□□□ 1.292e-8■□□□□ 9.3
RPS6KA3-202ENST00000438357 DEPDC5O75140 1603 aa23.14■■□□□ 1.29
RPS6KA3-202ENST00000438357 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
RPS6KA3-202ENST00000438357 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.14■■□□□ 1.29
RPS6KA3-202ENST00000438357 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.13■■□□□ 1.29
RPS6KA3-202ENST00000438357 KANK1Q14678 1352 aa23.13■■□□□ 1.29
RPS6KA3-202ENST00000438357 CPS1P31327 1500 aa23.13■■□□□ 1.29
RPS6KA3-202ENST00000438357 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA3-202ENST00000438357 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA3-202ENST00000438357 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA3-202ENST00000438357 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA3-202ENST00000438357 IQGAP1P46940 1657 aa23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA3-202ENST00000438357 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
RPS6KA3-202ENST00000438357 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.05■■□□□ 1.28
RPS6KA3-202ENST00000438357 TOM1O60784 492 aa23.04■■□□□ 1.28
RPS6KA3-202ENST00000438357 ADGRL2O95490 1459 aa23.03■■□□□ 1.28
RPS6KA3-202ENST00000438357 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
RPS6KA3-202ENST00000438357 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
RPS6KA3-202ENST00000438357 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.02■■□□□ 1.28
RPS6KA3-202ENST00000438357 PIP4K2BP78356 416 aa23■■□□□ 1.27
RPS6KA3-202ENST00000438357 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23■■□□□ 1.27
RPS6KA3-202ENST00000438357 STAG3Q9UJ98 1225 aa23■■□□□ 1.27
RPS6KA3-202ENST00000438357 EID1Q9Y6B2 187 aa23■■□□□ 1.27
RPS6KA3-202ENST00000438357 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.99■■□□□ 1.27
RPS6KA3-202ENST00000438357 SLIT1O75093 1534 aa22.99■■□□□ 1.27
RPS6KA3-202ENST00000438357 LTKP29376 864 aa22.98■■□□□ 1.27
RPS6KA3-202ENST00000438357 PIK3C2BO00750 1634 aa22.96■■□□□ 1.27
RPS6KA3-202ENST00000438357 IDI1Q13907 227 aa22.95■■□□□ 1.26
RPS6KA3-202ENST00000438357 ILDR2Q71H61 639 aa22.95■■□□□ 1.26
RPS6KA3-202ENST00000438357 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.95■■□□□ 1.26
RPS6KA3-202ENST00000438357 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.94■■□□□ 1.26
RPS6KA3-202ENST00000438357 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.94■■□□□ 1.26
RPS6KA3-202ENST00000438357 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.92■■□□□ 1.26
RPS6KA3-202ENST00000438357 HSPA1LP34931 641 aa22.92■■□□□ 1.26
RPS6KA3-202ENST00000438357 NOS1P29475 1434 aa22.91■■□□□ 1.26
RPS6KA3-202ENST00000438357 SYNMO15061 1565 aa22.91■■□□□ 1.26
RPS6KA3-202ENST00000438357 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.91■■□□□ 1.26
RPS6KA3-202ENST00000438357 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
RPS6KA3-202ENST00000438357 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.89■■□□□ 1.25
RPS6KA3-202ENST00000438357 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
RPS6KA3-202ENST00000438357 ADGRB3O60242 1522 aa22.85■■□□□ 1.25
RPS6KA3-202ENST00000438357 ALKQ9UM73 1620 aa22.85■■□□□ 1.25
RPS6KA3-202ENST00000438357 ROCK1Q13464 1354 aa22.84■■□□□ 1.25
RPS6KA3-202ENST00000438357 SOCS7O14512 581 aa22.83■■□□□ 1.25
RPS6KA3-202ENST00000438357 TET3O43151 1660 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KA3-202ENST00000438357 UNC13BO14795 1591 aa22.8■■□□□ 1.24
RPS6KA3-202ENST00000438357 ITGAEP38570 1179 aa22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA3-202ENST00000438357 FOXD1Q16676 465 aa22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA3-202ENST00000438357 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA3-202ENST00000438357 BCANQ96GW7 911 aa22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA3-202ENST00000438357 KCNA6P17658 529 aa22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA3-202ENST00000438357 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA3-202ENST00000438357 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms