RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436673.5

UPP1-208, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene UPP1, Length 918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-208ENST00000436673 PLA2R1Q13018 1463 aa41.85■■■■■ 4.29
UPP1-208ENST00000436673 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.83■■■■■ 4.29
UPP1-208ENST00000436673 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.82■■■■■ 4.29
UPP1-208ENST00000436673 PKD2Q13563 968 aa41.8■■■■■ 4.28
UPP1-208ENST00000436673 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
UPP1-208ENST00000436673 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.78■■■■■ 4.28
UPP1-208ENST00000436673 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.77■■■■■ 4.28
UPP1-208ENST00000436673 MIA2Q96PC5 1412 aa41.77■■■■■ 4.28
UPP1-208ENST00000436673 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
UPP1-208ENST00000436673 PZPP20742 1482 aa41.76■■■■■ 4.28
UPP1-208ENST00000436673 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.76■■■■■ 4.28
UPP1-208ENST00000436673 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.74■■■■■ 4.27
UPP1-208ENST00000436673 TNRQ92752 1358 aa41.73■■■■■ 4.27
UPP1-208ENST00000436673 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.7■■■■■ 4.27
UPP1-208ENST00000436673 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.7■■■■■ 4.27
UPP1-208ENST00000436673 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
UPP1-208ENST00000436673 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
UPP1-208ENST00000436673 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
UPP1-208ENST00000436673 APLP2Q06481 763 aa41.56■■■■■ 4.24
UPP1-208ENST00000436673 ABCC3O15438 1527 aa41.55■■■■■ 4.24
UPP1-208ENST00000436673 NLRP1Q9C000 1473 aa41.54■■■■■ 4.24
UPP1-208ENST00000436673 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.5■■■■■ 4.23
UPP1-208ENST00000436673 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
UPP1-208ENST00000436673 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.49■■■■■ 4.23
UPP1-208ENST00000436673 ABCC5O15440 1437 aa41.48■■■■■ 4.23
UPP1-208ENST00000436673 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
UPP1-208ENST00000436673 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.48■■■■■ 4.23
UPP1-208ENST00000436673 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.47■■■■■ 4.23
UPP1-208ENST00000436673 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.46■■■■■ 4.23
UPP1-208ENST00000436673 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP41.46■■■■■ 4.23
UPP1-208ENST00000436673 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.46■■■■■ 4.23
UPP1-208ENST00000436673 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.45■■■■■ 4.23
UPP1-208ENST00000436673 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.44■■■■■ 4.22
UPP1-208ENST00000436673 KIF15Q9NS87 1388 aa41.44■■■■■ 4.22
UPP1-208ENST00000436673 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.43■■■■■ 4.22
UPP1-208ENST00000436673 ERVK-7P63135 1459 aa41.4■■■■■ 4.22
UPP1-208ENST00000436673 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.39■■■■■ 4.22
UPP1-208ENST00000436673 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.39■■■■■ 4.22
UPP1-208ENST00000436673 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.38■■■■■ 4.21
UPP1-208ENST00000436673 DAPK1P53355 1430 aa41.37■■■■■ 4.21
UPP1-208ENST00000436673 UBAP1LF5GYI3 381 aa41.37■■■■■ 4.21
UPP1-208ENST00000436673 ERBINQ96RT1 1412 aa41.36■■■■■ 4.21
UPP1-208ENST00000436673 CEP152O94986 1710 aa41.34■■■■■ 4.21
UPP1-208ENST00000436673 MED14O60244 1454 aa41.33■■■■■ 4.21
UPP1-208ENST00000436673 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.2
UPP1-208ENST00000436673 DEPDC5O75140 1603 aa41.32■■■■■ 4.2
UPP1-208ENST00000436673 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
UPP1-208ENST00000436673 DISP3Q9P2K9 1392 aa41.29■■■■■ 4.2
UPP1-208ENST00000436673 CPS1P31327 1500 aa41.28■■■■■ 4.2
UPP1-208ENST00000436673 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.26■■■■■ 4.19
UPP1-208ENST00000436673 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.24■■■■■ 4.19
UPP1-208ENST00000436673 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.22■■■■■ 4.19
UPP1-208ENST00000436673 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.21■■■■■ 4.19
UPP1-208ENST00000436673 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.2■■■■■ 4.19
UPP1-208ENST00000436673 IQGAP1P46940 1657 aa41.18■■■■■ 4.18
UPP1-208ENST00000436673 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
UPP1-208ENST00000436673 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.15■■■■■ 4.18
UPP1-208ENST00000436673 KANK1Q14678 1352 aa41.14■■■■■ 4.18
UPP1-208ENST00000436673 ILDR2Q71H61 639 aa41.09■■■■■ 4.17
UPP1-208ENST00000436673 TOM1O60784 492 aa41.08■■■■■ 4.17
UPP1-208ENST00000436673 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.08■■■■■ 4.17
UPP1-208ENST00000436673 ADGRL2O95490 1459 aa41.07■■■■■ 4.16
UPP1-208ENST00000436673 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.16
UPP1-208ENST00000436673 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.07■■■■■ 4.16
UPP1-208ENST00000436673 SLIT1O75093 1534 aa41.06■■■■■ 4.16
UPP1-208ENST00000436673 LTKP29376 864 aa41.04■■■■■ 4.16
UPP1-208ENST00000436673 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.04■■■■■ 4.16
UPP1-208ENST00000436673 PIP4K2BP78356 416 aa41.03■■■■■ 4.16
UPP1-208ENST00000436673 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
UPP1-208ENST00000436673 TXNDC2Q86VQ3 553 aa41.01■■■■■ 4.16
UPP1-208ENST00000436673 PIK3C2BO00750 1634 aa40.98■■■■■ 4.15
UPP1-208ENST00000436673 STRCP1A6NGW2 1772 aa40.98■■■■■ 4.15
UPP1-208ENST00000436673 LRRC7Q96NW7 1537 aa40.96■■■■■ 4.15
UPP1-208ENST00000436673 EID1Q9Y6B2 187 aa40.95■■■■■ 4.15
UPP1-208ENST00000436673 HSPA1LP34931 641 aa40.94■■■■■ 4.14
UPP1-208ENST00000436673 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.94■■■■■ 4.14
UPP1-208ENST00000436673 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.93■■■■■ 4.14
UPP1-208ENST00000436673 IDI1Q13907 227 aa40.93■■■■■ 4.14
UPP1-208ENST00000436673 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.92■■■■■ 4.14
UPP1-208ENST00000436673 ALKQ9UM73 1620 aa40.92■■■■■ 4.14
UPP1-208ENST00000436673 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.92■■■■■ 4.14
UPP1-208ENST00000436673 NOS1P29475 1434 aa40.91■■■■■ 4.14
UPP1-208ENST00000436673 SYNMO15061 1565 aa40.91■■■■■ 4.14
UPP1-208ENST00000436673 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
UPP1-208ENST00000436673 SOCS7O14512 581 aa40.82■■■■■ 4.13
UPP1-208ENST00000436673 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
UPP1-208ENST00000436673 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.79■■■■■ 4.12
UPP1-208ENST00000436673 ADGRB3O60242 1522 aa40.77■■■■■ 4.12
UPP1-208ENST00000436673 ROCK1Q13464 1354 aa40.71■■■■■ 4.11
UPP1-208ENST00000436673 TET3O43151 1660 aa40.7■■■■■ 4.11
UPP1-208ENST00000436673 UNC13BO14795 1591 aa40.68■■■■■ 4.1
UPP1-208ENST00000436673 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
UPP1-208ENST00000436673 SLC26A8Q96RN1 970 aa40.66■■■■■ 4.1
UPP1-208ENST00000436673 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.1
UPP1-208ENST00000436673 KCNA6P17658 529 aa40.63■■■■■ 4.09
UPP1-208ENST00000436673 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.61■■■■■ 4.09
UPP1-208ENST00000436673 ZFYVE9O95405 1425 aa40.58■■■■■ 4.09
UPP1-208ENST00000436673 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.09
UPP1-208ENST00000436673 TMEM94Q12767 1356 aa40.57■■■■■ 4.08
UPP1-208ENST00000436673 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.6 ms