RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423431.5

SPCS1-202, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SPCS1, Length 822 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-202ENST00000423431 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
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SPCS1-202ENST00000423431 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa15.13■□□□□ 0.01
SPCS1-202ENST00000423431 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
SPCS1-202ENST00000423431 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa15.11■□□□□ 0.01
SPCS1-202ENST00000423431 TOM1O60784 492 aa15.11■□□□□ 0.01
SPCS1-202ENST00000423431 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
SPCS1-202ENST00000423431 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
SPCS1-202ENST00000423431 C3P01024 1663 aa15.09■□□□□ 0.01
SPCS1-202ENST00000423431 MIER1Q8N108 512 aa15.08■□□□□ 0
SPCS1-202ENST00000423431 MS4A3Q96HJ5 214 aa15.06■□□□□ 0
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SPCS1-202ENST00000423431 CCDC61Q9Y6R9 512 aa15.02■□□□□ -0
SPCS1-202ENST00000423431 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
SPCS1-202ENST00000423431 PRXQ9BXM0 1461 aa15□□□□□ -0.01
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SPCS1-202ENST00000423431 FKBP8Q14318 412 aa14.98□□□□□ -0.01
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SPCS1-202ENST00000423431 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-202ENST00000423431 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-202ENST00000423431 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.97□□□□□ -0.01
SPCS1-202ENST00000423431 POTEB2H3BUK9 544 aa14.95□□□□□ -0.02
SPCS1-202ENST00000423431 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
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SPCS1-202ENST00000423431 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.94□□□□□ -0.02
SPCS1-202ENST00000423431 ZMYM3Q14202 1370 aa14.94□□□□□ -0.02
SPCS1-202ENST00000423431 PLA2R1Q13018 1463 aa14.94□□□□□ -0.02
SPCS1-202ENST00000423431 AGLP35573 1532 aa14.93□□□□□ -0.02
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SPCS1-202ENST00000423431 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SPCS1-202ENST00000423431 KIF12Q96FN5 646 aa14.93□□□□□ -0.02
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SPCS1-202ENST00000423431 ABCA6Q8N139 1617 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-202ENST00000423431 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-202ENST00000423431 ARHGAP5Q13017 1502 aa14.92□□□□□ -0.02
SPCS1-202ENST00000423431 KDM5CP41229 1560 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-202ENST00000423431 CPS1P31327 1500 aa14.91□□□□□ -0.02
SPCS1-202ENST00000423431 REREQ9P2R6 1566 aa14.9□□□□□ -0.02
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SPCS1-202ENST00000423431 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.89□□□□□ -0.03
SPCS1-202ENST00000423431 OTUD5Q96G74 571 aa14.88□□□□□ -0.03
SPCS1-202ENST00000423431 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SPCS1-202ENST00000423431 MYO5CQ9NQX4 1742 aa14.88□□□□□ -0.03
SPCS1-202ENST00000423431 MYO3AQ8NEV4 1616 aa14.88□□□□□ -0.03
SPCS1-202ENST00000423431 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.87□□□□□ -0.03
SPCS1-202ENST00000423431 MAP3K13O43283 966 aa14.85□□□□□ -0.03
SPCS1-202ENST00000423431 METRNQ9UJH8 293 aa14.85□□□□□ -0.03
SPCS1-202ENST00000423431 SLC39A7Q92504 469 aa14.84□□□□□ -0.03
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SPCS1-202ENST00000423431 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SPCS1-202ENST00000423431 TRPC6Q9Y210 931 aa14.83□□□□□ -0.04
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SPCS1-202ENST00000423431 C7P10643 843 aa14.82□□□□□ -0.04
SPCS1-202ENST00000423431 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SPCS1-202ENST00000423431 NUBP1P53384 320 aa14.81□□□□□ -0.04
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SPCS1-202ENST00000423431 KIF14Q15058 1648 aa14.81□□□□□ -0.04
SPCS1-202ENST00000423431 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SPCS1-202ENST00000423431 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SPCS1-202ENST00000423431 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.78□□□□□ -0.04
SPCS1-202ENST00000423431 ANKLE2Q86XL3 938 aa14.78□□□□□ -0.04
SPCS1-202ENST00000423431 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
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SPCS1-202ENST00000423431 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SPCS1-202ENST00000423431 CLIP1P30622 1438 aa14.75□□□□□ -0.05
SPCS1-202ENST00000423431 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.75□□□□□ -0.05
SPCS1-202ENST00000423431 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.75□□□□□ -0.05
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SPCS1-202ENST00000423431 TIE1P35590 1138 aa14.74□□□□□ -0.05
SPCS1-202ENST00000423431 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
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SPCS1-202ENST00000423431 ABCC1P33527 1531 aa14.73□□□□□ -0.05
SPCS1-202ENST00000423431 POTEJP0CG39 1038 aa14.73□□□□□ -0.05
SPCS1-202ENST00000423431 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SPCS1-202ENST00000423431 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SPCS1-202ENST00000423431 LRRC7Q96NW7 1537 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS1-202ENST00000423431 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS1-202ENST00000423431 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SPCS1-202ENST00000423431 TRIM52Q96A61 297 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-202ENST00000423431 TNRQ92752 1358 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-202ENST00000423431 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-202ENST00000423431 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-202ENST00000423431 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SPCS1-202ENST00000423431 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-202ENST00000423431 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-202ENST00000423431 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.68□□□□□ -0.06
SPCS1-202ENST00000423431 FAM212AQ96EL1 285 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-202ENST00000423431 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-202ENST00000423431 A2MP01023 1474 aa14.66□□□□□ -0.06
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