RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414009.1

HPS1-205, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene HPS1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-205ENST00000414009 A2MP01023 1474 aa22.46■■□□□ 1.19
HPS1-205ENST00000414009 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.46■■□□□ 1.19
HPS1-205ENST00000414009 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.46■■□□□ 1.19
HPS1-205ENST00000414009 MLECQ14165 292 aa22.44■■□□□ 1.18
HPS1-205ENST00000414009 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
HPS1-205ENST00000414009 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.42■■□□□ 1.18
HPS1-205ENST00000414009 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.42■■□□□ 1.18
HPS1-205ENST00000414009 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
HPS1-205ENST00000414009 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
HPS1-205ENST00000414009 AGLP35573 1532 aa22.41■■□□□ 1.18
HPS1-205ENST00000414009 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
HPS1-205ENST00000414009 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.4■■□□□ 1.18
HPS1-205ENST00000414009 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.4■■□□□ 1.18
HPS1-205ENST00000414009 ITGAEP38570 1179 aa22.4■■□□□ 1.18
HPS1-205ENST00000414009 PLXNC1O60486 1568 aa22.39■■□□□ 1.18
HPS1-205ENST00000414009 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.39■■□□□ 1.17
HPS1-205ENST00000414009 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HPS1-205ENST00000414009 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.37■■□□□ 1.17
HPS1-205ENST00000414009 KIF15Q9NS87 1388 aa22.36■■□□□ 1.17
HPS1-205ENST00000414009 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.35■■□□□ 1.17
HPS1-205ENST00000414009 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.35■■□□□ 1.17
HPS1-205ENST00000414009 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.34■■□□□ 1.17
HPS1-205ENST00000414009 KIF3BO15066 747 aa22.33■■□□□ 1.17
HPS1-205ENST00000414009 GGT6Q6P531 493 aa22.32■■□□□ 1.16
HPS1-205ENST00000414009 NCOA1Q15788 1441 aa22.31■■□□□ 1.16
HPS1-205ENST00000414009 MADDQ8WXG6 1647 aa22.31■■□□□ 1.16
HPS1-205ENST00000414009 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.31■■□□□ 1.16
HPS1-205ENST00000414009 ADGRL2O95490 1459 aa22.31■■□□□ 1.16
HPS1-205ENST00000414009 ABCB7O75027 752 aa22.29■■□□□ 1.16
HPS1-205ENST00000414009 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HPS1-205ENST00000414009 ERBINQ96RT1 1412 aa22.28■■□□□ 1.16
HPS1-205ENST00000414009 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HPS1-205ENST00000414009 ROCK1Q13464 1354 aa22.27■■□□□ 1.16
HPS1-205ENST00000414009 PTPRKQ15262 1439 aa22.27■■□□□ 1.16
HPS1-205ENST00000414009 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.24■■□□□ 1.15
HPS1-205ENST00000414009 PTPRMP28827 1452 aa22.23■■□□□ 1.15
HPS1-205ENST00000414009 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.21■■□□□ 1.15
HPS1-205ENST00000414009 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.2■■□□□ 1.14
HPS1-205ENST00000414009 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HPS1-205ENST00000414009 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.18■■□□□ 1.14
HPS1-205ENST00000414009 KANK1Q14678 1352 aa22.18■■□□□ 1.14
HPS1-205ENST00000414009 ZBTB22O15209 634 aa22.18■■□□□ 1.14
HPS1-205ENST00000414009 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HPS1-205ENST00000414009 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.16■■□□□ 1.14
HPS1-205ENST00000414009 MROH2AA6NES4 1674 aa22.15■■□□□ 1.14
HPS1-205ENST00000414009 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HPS1-205ENST00000414009 ZMYM3Q14202 1370 aa22.12■■□□□ 1.13
HPS1-205ENST00000414009 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HPS1-205ENST00000414009 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HPS1-205ENST00000414009 C3P01024 1663 aa22.11■■□□□ 1.13
HPS1-205ENST00000414009 DEPDC5O75140 1603 aa22.1■■□□□ 1.13
HPS1-205ENST00000414009 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.09■■□□□ 1.13
HPS1-205ENST00000414009 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.08■■□□□ 1.13
HPS1-205ENST00000414009 HFM1A2PYH4 1435 aa22.08■■□□□ 1.13
HPS1-205ENST00000414009 NAIPQ13075 1403 aa22.08■■□□□ 1.13
HPS1-205ENST00000414009 ABCC3O15438 1527 aa22.07■■□□□ 1.12
HPS1-205ENST00000414009 CEP152O94986 1710 aa22.06■■□□□ 1.12
HPS1-205ENST00000414009 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HPS1-205ENST00000414009 UNC13BO14795 1591 aa22.04■■□□□ 1.12
HPS1-205ENST00000414009 NPATQ14207 1427 aa22.03■■□□□ 1.12
HPS1-205ENST00000414009 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.02■■□□□ 1.12
HPS1-205ENST00000414009 PZPP20742 1482 aa22.02■■□□□ 1.12
HPS1-205ENST00000414009 NUP155O75694 1391 aa22.01■■□□□ 1.11
HPS1-205ENST00000414009 TRIM52Q96A61 297 aa22■■□□□ 1.11
HPS1-205ENST00000414009 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
HPS1-205ENST00000414009 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.99■■□□□ 1.11
HPS1-205ENST00000414009 LMTK2Q8IWU2 1503 aa21.99■■□□□ 1.11
HPS1-205ENST00000414009 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.98■■□□□ 1.11
HPS1-205ENST00000414009 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
HPS1-205ENST00000414009 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.98■■□□□ 1.11
HPS1-205ENST00000414009 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.97■■□□□ 1.11
HPS1-205ENST00000414009 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.97■■□□□ 1.11
HPS1-205ENST00000414009 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
HPS1-205ENST00000414009 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.95■■□□□ 1.1
HPS1-205ENST00000414009 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
HPS1-205ENST00000414009 TNRQ92752 1358 aa21.95■■□□□ 1.1
HPS1-205ENST00000414009 TET3O43151 1660 aa21.94■■□□□ 1.1
HPS1-205ENST00000414009 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.93■■□□□ 1.1
HPS1-205ENST00000414009 ERVK-7P63135 1459 aa21.91■■□□□ 1.1
HPS1-205ENST00000414009 POLA2Q14181 598 aa21.91■■□□□ 1.1
HPS1-205ENST00000414009 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
HPS1-205ENST00000414009 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
HPS1-205ENST00000414009 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.9■■□□□ 1.1
HPS1-205ENST00000414009 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.89■■□□□ 1.09
HPS1-205ENST00000414009 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.88■■□□□ 1.09
HPS1-205ENST00000414009 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.87■■□□□ 1.09
HPS1-205ENST00000414009 NLRP1Q9C000 1473 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS1-205ENST00000414009 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
HPS1-205ENST00000414009 HSPA2P54652 639 aa21.84■■□□□ 1.09
HPS1-205ENST00000414009 E9PCH4 1651 aa21.84■■□□□ 1.09
HPS1-205ENST00000414009 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.83■■□□□ 1.09
HPS1-205ENST00000414009 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HPS1-205ENST00000414009 HRCP23327 699 aa21.81■■□□□ 1.08
HPS1-205ENST00000414009 PKD2Q13563 968 aa21.81■■□□□ 1.08
HPS1-205ENST00000414009 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.81■■□□□ 1.08
HPS1-205ENST00000414009 NOS1P29475 1434 aa21.8■■□□□ 1.08
HPS1-205ENST00000414009 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.8■■□□□ 1.08
HPS1-205ENST00000414009 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
HPS1-205ENST00000414009 UGGT1Q9NYU2 1555 aa21.78■■□□□ 1.08
HPS1-205ENST00000414009 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.77■■□□□ 1.08
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