RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410506.1

RNU6-1077P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1077, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1077P, Length 102 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GLMNQ92990 594 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TXNDC2Q86VQ3 553 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 OXER1Q8TDS5 423 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 C8orf37Q96NL8 207 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SNRKQ9NRH2 765 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 POM121CA8CG34 1229 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MARCH6O60337 910 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RFX1P22670 979 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 WWC1Q8IX03 1113 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RASEFQ8IZ41 740 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 VRTNQ9H8Y1 702 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 UBXN4Q92575 508 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SIRT1Q96EB6 747 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GDPD2Q9HCC8 539 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NUTM2FA1L443 756 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PLEKHD1A6NEE1 506 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RNF39Q9H2S5 420 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GNPATO15228 680 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ABL2P42684 1182 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NLRP6P59044 892 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 BANK1Q8NDB2 785 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FBXO22Q8NEZ5 403 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ERCC3P19447 782 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FECHP22830 423 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CFAP70Q5T0N1 1121 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GIMAP6Q6P9H5 292 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 BCL2L13Q9BXK5 485 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 POLR3EQ9NVU0 708 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DPYSL4O14531 572 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZNF662Q6ZS27 426 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 EXOC8Q8IYI6 725 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GIPC2Q8TF65 315 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PPME1Q9Y570 386 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TMEM88BA6NKF7 163 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RFC5P40937 340 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NAALADL2Q58DX5 795 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 BCL11AQ9H165 835 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MYH16Q9H6N6 1097 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PHF8Q9UPP1 1060 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DSG3P32926 999 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 HIC1Q14526 733 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PDIA6Q15084 440 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MTMR14Q8NCE2 650 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RAB11FIP3O75154 756 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FCHSD2O94868 740 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PSEN1P49768 467 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FOSBP53539 338 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DPH6Q7L8W6 267 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TEX2Q8IWB9 1127 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CREBZFQ9NS37 354 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GRXCR2A6NFK2 248 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TMEM259Q4ZIN3 620 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GORABQ5T7V8 394 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 EFCAB3Q8N7B9 438 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PRM3Q9NNZ6 103 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PCDHB8Q9UN66 801 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SOX12O15370 315 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1077P-201ENST00000410506 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.3 ms