RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa5.68□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 C9orf84Q5VXU9 1444 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 RSPH4AQ5TD94 716 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 SPOCK2Q92563 424 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 CLEC11AQ9Y240 323 aa5.67□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 ADGRL2O95490 1459 aa5.66□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 ARHGAP5Q13017 1502 aa5.66□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa5.66□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 MBD5Q9P267 1494 aa5.66□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 KDM5BQ9UGL1 1544 aa5.66□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 PKD2Q13563 968 aa5.66□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa5.66□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 L3MBTL2Q969R5 705 aa5.66□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 KIF15Q9NS87 1388 aa5.66□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 NUP155O75694 1391 aa5.66□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa5.66□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 TTC37Q6PGP7 1564 aa5.65□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa5.65□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC141Q6ZP82 1450 aa5.65□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa5.65□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 PZPP20742 1482 aa5.64□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 SHANK2Q9UPX8 1470 aa5.64□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 ADGBQ8N7X0 1667 aa5.64□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 PREX2Q70Z35 1606 aa5.64□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 PLCH2O75038 1416 aa5.64□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 SYCP2Q9BX26 1530 aa5.64□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 CROCC2H7BZ55 1655 aa5.64□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 ARHGEF5Q12774 1597 aa5.63□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 GSE1Q14687 1217 aa5.62□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 AFAP1Q8N556 730 aa5.62□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa5.62□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa5.62□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 HAX1O00165 279 aa5.62□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 MYT1LQ9UL68 1186 aa5.62□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa5.62□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 TAOK2Q9UL54 1235 aa5.62□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 WDR7Q9Y4E6 1490 aa5.62□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 MYO5CQ9NQX4 1742 aa5.62□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 PLEKHG5O94827 1062 aa5.61□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 NBPF8Q3BBV2 869 aa5.61□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 ASXL2Q76L83 1435 aa5.61□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa5.61□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP5.61□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 GABBR2O75899 941 aa5.6□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 CD44P16070 742 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa5.59□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 TEX14Q8IWB6 1497 aa5.59□□□□□ -1.51
LRRTM4-201ENST00000409088 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 CYB5RLQ6IPT4 315 aa5.59□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 FANCAO15360 1455 aa5.59□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 ABCC1P33527 1531 aa5.58□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 MAST1Q9Y2H9 1570 aa5.58□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 SCAPERQ9BY12 1400 aa5.58□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM135AQ9P2D6 1515 aa5.58□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 EVX2Q03828 476 aa5.57□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 RGL3Q3MIN7 710 aa5.57□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 DCAF11Q8TEB1 546 aa5.57□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 KDM5DQ9BY66 1539 aa5.57□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 ANP32CO43423 234 aa5.57□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 DUOX2Q9NRD8 1548 aa5.57□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 WASHC2AQ641Q2 1341 aa5.57□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 ADGRL1O94910 1474 aa5.57□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 ARAP3Q8WWN8 1544 aa5.57□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 KIF3BO15066 747 aa5.56□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 NUBP1P53384 320 aa5.56□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 CD109Q6YHK3 1445 aa5.56□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 ABCA9Q8IUA7 1624 aa5.56□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 PLXNC1O60486 1568 aa5.56□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC144AA2RUR9 1427 aa5.56□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa5.56□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 ERBINQ96RT1 1412 aa5.56□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 CHADLQ6NUI6 762 aa5.55□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa5.55□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 POLR3GLQ9BT43 218 aa5.55□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 CARD11Q9BXL7 1154 aa5.55□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 PLA2R1Q13018 1463 aa5.54□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 UNC13BO14795 1591 aa5.54□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa5.54□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC61Q9Y6R9 512 aa5.54□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 USP47Q96K76 1375 aa5.53□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC7Q96M83 1385 aa5.53□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP7AQ04656 1500 aa5.53□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa5.53□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 RAPGEF3O95398 923 aa5.53□□□□□ -1.52
LRRTM4-201ENST00000409088 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
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