RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401762.2

RPS3AP23-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 23, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP23, Length 784 nt, Biotype transcribed processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP23-201ENST00000401762 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
RPS3AP23-201ENST00000401762 POTEEQ6S8J3 1075 aa9.51□□□□□ -0.89
RPS3AP23-201ENST00000401762 P3H3Q8IVL6 736 aa9.51□□□□□ -0.89
RPS3AP23-201ENST00000401762 KCNH8Q96L42 1107 aa9.51□□□□□ -0.89
RPS3AP23-201ENST00000401762 MMRN1Q13201 1228 aa9.5□□□□□ -0.89
RPS3AP23-201ENST00000401762 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa9.5□□□□□ -0.89
RPS3AP23-201ENST00000401762 TYW1BQ6NUM6 668 aa9.49□□□□□ -0.89
RPS3AP23-201ENST00000401762 TK2O00142 265 aa9.48□□□□□ -0.89
RPS3AP23-201ENST00000401762 PTPREP23469 700 aa9.47□□□□□ -0.89
RPS3AP23-201ENST00000401762 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa9.47□□□□□ -0.89
RPS3AP23-201ENST00000401762 AXIN2Q9Y2T1 843 aa9.47□□□□□ -0.89
RPS3AP23-201ENST00000401762 CUX2O14529 1486 aa9.47□□□□□ -0.89
RPS3AP23-201ENST00000401762 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.46□□□□□ -0.9
RPS3AP23-201ENST00000401762 SLC4A5Q9BY07 1137 aa9.46□□□□□ -0.9
RPS3AP23-201ENST00000401762 ADAM33Q9BZ11 813 aa9.46□□□□□ -0.9
RPS3AP23-201ENST00000401762 PSEN2P49810 448 aa9.44□□□□□ -0.9
RPS3AP23-201ENST00000401762 DDX12PQ92771 950 aa9.44□□□□□ -0.9
RPS3AP23-201ENST00000401762 KCNK17Q96T54 332 aa9.44□□□□□ -0.9
RPS3AP23-201ENST00000401762 DMRTA1Q5VZB9 504 aa9.42□□□□□ -0.9
RPS3AP23-201ENST00000401762 NCAPD3P42695 1498 aa9.41□□□□□ -0.9
RPS3AP23-201ENST00000401762 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa9.41□□□□□ -0.9
RPS3AP23-201ENST00000401762 ADGRD1Q6QNK2 874 aa9.41□□□□□ -0.9
RPS3AP23-201ENST00000401762 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa9.39□□□□□ -0.91
RPS3AP23-201ENST00000401762 GRXCR2A6NFK2 248 aa9.38□□□□□ -0.91
RPS3AP23-201ENST00000401762 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa9.38□□□□□ -0.91
RPS3AP23-201ENST00000401762 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
RPS3AP23-201ENST00000401762 OSBPP22059 807 aa9.38□□□□□ -0.91
RPS3AP23-201ENST00000401762 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
RPS3AP23-201ENST00000401762 NBR1Q14596 966 aa9.38□□□□□ -0.91
RPS3AP23-201ENST00000401762 ZBED2Q9BTP6 218 aa9.38□□□□□ -0.91
RPS3AP23-201ENST00000401762 HRO43593 1189 aa9.37□□□□□ -0.91
RPS3AP23-201ENST00000401762 MYT1LQ9UL68 1186 aa9.37□□□□□ -0.91
RPS3AP23-201ENST00000401762 CERKQ8TCT0 537 aa9.35□□□□□ -0.91
RPS3AP23-201ENST00000401762 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
RPS3AP23-201ENST00000401762 ERCC6Q03468 1493 aa9.34□□□□□ -0.91
RPS3AP23-201ENST00000401762 SMARCA2P51531 1590 aa9.34□□□□□ -0.91
RPS3AP23-201ENST00000401762 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
RPS3AP23-201ENST00000401762 MAP3K7O43318 606 aa9.34□□□□□ -0.91
RPS3AP23-201ENST00000401762 COL9A1P20849 921 aa9.34□□□□□ -0.91
RPS3AP23-201ENST00000401762 STAC3Q96MF2 364 aa9.34□□□□□ -0.91
RPS3AP23-201ENST00000401762 HMGXB3Q12766 1538 aa9.34□□□□□ -0.91
RPS3AP23-201ENST00000401762 RABGEF1Q9UJ41 708 aa9.32□□□□□ -0.92
RPS3AP23-201ENST00000401762 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa9.32□□□□□ -0.92
RPS3AP23-201ENST00000401762 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
RPS3AP23-201ENST00000401762 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.31□□□□□ -0.92
RPS3AP23-201ENST00000401762 SEMA3EO15041 775 aa9.3□□□□□ -0.92
RPS3AP23-201ENST00000401762 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RPS3AP23-201ENST00000401762 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
RPS3AP23-201ENST00000401762 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
RPS3AP23-201ENST00000401762 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
RPS3AP23-201ENST00000401762 NBPF3Q9H094 633 aa9.28□□□□□ -0.92
RPS3AP23-201ENST00000401762 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa9.27□□□□□ -0.93
RPS3AP23-201ENST00000401762 PRSS12P56730 875 aa9.27□□□□□ -0.93
RPS3AP23-201ENST00000401762 LAPTM4BQ86VI4 370 aa9.27□□□□□ -0.93
RPS3AP23-201ENST00000401762 PACS2Q86VP3 889 aa9.27□□□□□ -0.93
RPS3AP23-201ENST00000401762 KIAA1468Q9P260 1216 aa9.27□□□□□ -0.93
RPS3AP23-201ENST00000401762 PROX2Q3B8N5 592 aa9.26□□□□□ -0.93
RPS3AP23-201ENST00000401762 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RPS3AP23-201ENST00000401762 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RPS3AP23-201ENST00000401762 SMARCA4P51532 1647 aa9.25□□□□□ -0.93
RPS3AP23-201ENST00000401762 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RPS3AP23-201ENST00000401762 PEG3Q9GZU2 1588 aa9.24□□□□□ -0.93
RPS3AP23-201ENST00000401762 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
RPS3AP23-201ENST00000401762 CDCA7LQ96GN5 454 aa9.24□□□□□ -0.93
RPS3AP23-201ENST00000401762 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa9.22□□□□□ -0.93
RPS3AP23-201ENST00000401762 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.22□□□□□ -0.93
RPS3AP23-201ENST00000401762 HCSTQ9UBK5 93 aa9.22□□□□□ -0.93
RPS3AP23-201ENST00000401762 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
RPS3AP23-201ENST00000401762 TTC13Q8NBP0 860 aa9.21□□□□□ -0.94
RPS3AP23-201ENST00000401762 TSKSQ9UJT2 592 aa9.21□□□□□ -0.94
RPS3AP23-201ENST00000401762 PTGDRQ13258 359 aa9.2□□□□□ -0.94
RPS3AP23-201ENST00000401762 CDHR5Q9HBB8 845 aa9.2□□□□□ -0.94
RPS3AP23-201ENST00000401762 PDS5BQ9NTI5 1447 aa9.19□□□□□ -0.94
RPS3AP23-201ENST00000401762 NUTM2FA1L443 756 aa9.18□□□□□ -0.94
RPS3AP23-201ENST00000401762 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
RPS3AP23-201ENST00000401762 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
RPS3AP23-201ENST00000401762 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
RPS3AP23-201ENST00000401762 FCHSD2O94868 740 aa9.17□□□□□ -0.94
RPS3AP23-201ENST00000401762 TATDN2Q93075 761 aa9.17□□□□□ -0.94
RPS3AP23-201ENST00000401762 WNT2BQ93097 391 aa9.17□□□□□ -0.94
RPS3AP23-201ENST00000401762 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
RPS3AP23-201ENST00000401762 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
RPS3AP23-201ENST00000401762 FAM198AQ9UFP1 575 aa9.16□□□□□ -0.94
RPS3AP23-201ENST00000401762 NESP48681 1621 aa9.16□□□□□ -0.94
RPS3AP23-201ENST00000401762 NBPF26B4DH59 902 aa9.15□□□□□ -0.94
RPS3AP23-201ENST00000401762 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
RPS3AP23-201ENST00000401762 ANKK1Q8NFD2 765 aa9.15□□□□□ -0.94
RPS3AP23-201ENST00000401762 THSD4Q6ZMP0 1018 aa9.14□□□□□ -0.95
RPS3AP23-201ENST00000401762 HIC1Q14526 733 aa9.13□□□□□ -0.95
RPS3AP23-201ENST00000401762 PADI6Q6TGC4 694 aa9.13□□□□□ -0.95
RPS3AP23-201ENST00000401762 SOWAHBA6NEL2 793 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3AP23-201ENST00000401762 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
RPS3AP23-201ENST00000401762 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3AP23-201ENST00000401762 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
RPS3AP23-201ENST00000401762 PNMA3Q9UL41 463 aa9.12□□□□□ -0.95
RPS3AP23-201ENST00000401762 EYA1Q99502 592 aa9.11□□□□□ -0.95
RPS3AP23-201ENST00000401762 CADPSQ9ULU8 1353 aa9.1□□□□□ -0.95
RPS3AP23-201ENST00000401762 NYAP1Q6ZVC0 841 aa9.09□□□□□ -0.95
RPS3AP23-201ENST00000401762 C3orf80F5H4A9 247 aa9.08□□□□□ -0.96
RPS3AP23-201ENST00000401762 GNPATO15228 680 aa9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms