RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394450.6

PRELID2-202, Transcript of PRELI domain containing 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRELID2, Length 1,102 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID2-202ENST00000394450 NCOA1Q15788 1441 aa46.03■■■■■ 4.96
PRELID2-202ENST00000394450 MYO3AQ8NEV4 1616 aa46■■■■■ 4.95
PRELID2-202ENST00000394450 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa45.99■■■■■ 4.95
PRELID2-202ENST00000394450 PTPN23Q9H3S7 1636 aa45.95■■■■■ 4.95
PRELID2-202ENST00000394450 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP45.94■■■■■ 4.94
PRELID2-202ENST00000394450 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP45.92■■■■■ 4.94
PRELID2-202ENST00000394450 PZPP20742 1482 aa45.91■■■■■ 4.94
PRELID2-202ENST00000394450 FGD6Q6ZV73 1430 aa45.89■■■■■ 4.94
PRELID2-202ENST00000394450 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP45.89■■■■■ 4.94
PRELID2-202ENST00000394450 TNRQ92752 1358 aa45.88■■■■■ 4.94
PRELID2-202ENST00000394450 ABCC5O15440 1437 aa45.86■■■■■ 4.93
PRELID2-202ENST00000394450 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP45.86■■■■■ 4.93
PRELID2-202ENST00000394450 PKD2Q13563 968 aa45.86■■■■■ 4.93
PRELID2-202ENST00000394450 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa45.85■■■■■ 4.93
PRELID2-202ENST00000394450 DUOX2Q9NRD8 1548 aa45.85■■■■■ 4.93
PRELID2-202ENST00000394450 A2ML1A8K2U0 1454 aa45.85■■■■■ 4.93
PRELID2-202ENST00000394450 PLA2R1Q13018 1463 aa45.85■■■■■ 4.93
PRELID2-202ENST00000394450 SHANK2Q9UPX8 1470 aa45.85■■■■■ 4.93
PRELID2-202ENST00000394450 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP45.84■■■■■ 4.93
PRELID2-202ENST00000394450 KIF15Q9NS87 1388 aa45.82■■■■■ 4.93
PRELID2-202ENST00000394450 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP45.8■■■■■ 4.92
PRELID2-202ENST00000394450 DAPK1P53355 1430 aa45.8■■■■■ 4.92
PRELID2-202ENST00000394450 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa45.8■■■■■ 4.92
PRELID2-202ENST00000394450 CROCC2H7BZ55 1655 aa45.78■■■■■ 4.92
PRELID2-202ENST00000394450 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP45.75■■■■■ 4.91
PRELID2-202ENST00000394450 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP45.74■■■■■ 4.91
PRELID2-202ENST00000394450 ABCC3O15438 1527 aa45.74■■■■■ 4.91
PRELID2-202ENST00000394450 ERBINQ96RT1 1412 aa45.71■■■■■ 4.91
PRELID2-202ENST00000394450 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa45.69■■■■■ 4.9
PRELID2-202ENST00000394450 CHIC2Q9UKJ5 165 aa45.68■■■■■ 4.9
PRELID2-202ENST00000394450 NLRP1Q9C000 1473 aa45.68■■■■■ 4.9
PRELID2-202ENST00000394450 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP45.66■■■■■ 4.9
PRELID2-202ENST00000394450 MROH1Q8NDA8 1641 aa45.64■■■■■ 4.9
PRELID2-202ENST00000394450 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP45.64■■■■■ 4.9
PRELID2-202ENST00000394450 LTBP4Q8N2S1 1624 aa45.61■■■■■ 4.89
PRELID2-202ENST00000394450 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP45.6■■■■■ 4.89
PRELID2-202ENST00000394450 KANK1Q14678 1352 aa45.57■■■■■ 4.88
PRELID2-202ENST00000394450 CEP152O94986 1710 aa45.56■■■■■ 4.88
PRELID2-202ENST00000394450 ANKLE2Q86XL3 938 aa45.56■■■■■ 4.88
PRELID2-202ENST00000394450 UGGT1Q9NYU2 1555 aa45.56■■■■■ 4.88
PRELID2-202ENST00000394450 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa45.55■■■■■ 4.88
PRELID2-202ENST00000394450 ERVK-7P63135 1459 aa45.55■■■■■ 4.88
PRELID2-202ENST00000394450 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP45.54■■■■■ 4.88
PRELID2-202ENST00000394450 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP45.54■■■■■ 4.88
PRELID2-202ENST00000394450 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP45.53■■■■■ 4.88
PRELID2-202ENST00000394450 IQSEC2Q5JU85 1478 aa45.49■■■■■ 4.87
PRELID2-202ENST00000394450 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP45.46■■■■■ 4.87
PRELID2-202ENST00000394450 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa45.45■■■■■ 4.87
PRELID2-202ENST00000394450 ADGRL2O95490 1459 aa45.43■■■■■ 4.86
PRELID2-202ENST00000394450 DEPDC5O75140 1603 aa45.43■■■■■ 4.86
PRELID2-202ENST00000394450 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP45.41■■■■■ 4.86
PRELID2-202ENST00000394450 NEURL4Q96JN8 1562 aa45.38■■■■■ 4.86
PRELID2-202ENST00000394450 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP45.33■■■■■ 4.85
PRELID2-202ENST00000394450 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa45.31■■■■■ 4.84
PRELID2-202ENST00000394450 LMTK2Q8IWU2 1503 aa45.29■■■■■ 4.84
PRELID2-202ENST00000394450 MED14O60244 1454 aa45.29■■■■■ 4.84
PRELID2-202ENST00000394450 VWDEQ8N2E2 1590 aa45.25■■■■■ 4.83
PRELID2-202ENST00000394450 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP45.25■■■■■ 4.83
PRELID2-202ENST00000394450 STAG3Q9UJ98 1225 aa45.24■■■■■ 4.83
PRELID2-202ENST00000394450 UBR1Q8IWV7 1749 aa45.23■■■■■ 4.83
PRELID2-202ENST00000394450 UBAP1LF5GYI3 381 aa45.22■■■■■ 4.83
PRELID2-202ENST00000394450 CPS1P31327 1500 aa45.2■■■■■ 4.83
PRELID2-202ENST00000394450 IQGAP1P46940 1657 aa45.18■■■■■ 4.82
PRELID2-202ENST00000394450 EID1Q9Y6B2 187 aa45.16■■■■■ 4.82
PRELID2-202ENST00000394450 TXNDC2Q86VQ3 553 aa45.15■■■■■ 4.82
PRELID2-202ENST00000394450 EFCAB6Q5THR3 1501 aa45.15■■■■■ 4.82
PRELID2-202ENST00000394450 ROCK1Q13464 1354 aa45.14■■■■■ 4.82
PRELID2-202ENST00000394450 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP45.14■■■■■ 4.82
PRELID2-202ENST00000394450 ITGAEP38570 1179 aa45.13■■■■■ 4.82
PRELID2-202ENST00000394450 IDI1Q13907 227 aa45.11■■■■■ 4.81
PRELID2-202ENST00000394450 PIK3C2BO00750 1634 aa45.1■■■■■ 4.81
PRELID2-202ENST00000394450 SLIT1O75093 1534 aa45.1■■■■■ 4.81
PRELID2-202ENST00000394450 ARHGAP23Q9P227 1491 aa45.09■■■■■ 4.81
PRELID2-202ENST00000394450 LTKP29376 864 aa45.07■■■■■ 4.81
PRELID2-202ENST00000394450 NOS1P29475 1434 aa45.06■■■■■ 4.8
PRELID2-202ENST00000394450 SLC52A1Q9NWF4 448 aa45.05■■■■■ 4.8
PRELID2-202ENST00000394450 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP45.04■■■■■ 4.8
PRELID2-202ENST00000394450 TMEM2Q9UHN6 1383 aa45.04■■■■■ 4.8
PRELID2-202ENST00000394450 TOM1O60784 492 aa45.01■■■■■ 4.8
PRELID2-202ENST00000394450 SYNMO15061 1565 aa45.01■■■■■ 4.8
PRELID2-202ENST00000394450 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP44.99■■■■■ 4.79
PRELID2-202ENST00000394450 TET3O43151 1660 aa44.97■■■■■ 4.79
PRELID2-202ENST00000394450 UNC13BO14795 1591 aa44.97■■■■■ 4.79
PRELID2-202ENST00000394450 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP44.95■■■■■ 4.79
PRELID2-202ENST00000394450 ADGRB3O60242 1522 aa44.9■■■■■ 4.78
PRELID2-202ENST00000394450 PIP4K2BP78356 416 aa44.89■■■■■ 4.78
PRELID2-202ENST00000394450 GCC2Q8IWJ2 1684 aa44.88■■■■■ 4.78
PRELID2-202ENST00000394450 NUP155O75694 1391 aa44.86■■■■■ 4.77
PRELID2-202ENST00000394450 LRRC7Q96NW7 1537 aa44.82■■■■■ 4.77
PRELID2-202ENST00000394450 DISP3Q9P2K9 1392 aa44.82■■■■■ 4.76
PRELID2-202ENST00000394450 STRCP1A6NGW2 1772 aa44.81■■■■■ 4.76
PRELID2-202ENST00000394450 IQGAP3Q86VI3 1631 aa44.8■■■■■ 4.76
PRELID2-202ENST00000394450 HDGFP51858 240 aaKnown RBP44.8■■■■■ 4.76
PRELID2-202ENST00000394450 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP44.79■■■■■ 4.76
PRELID2-202ENST00000394450 BCANQ96GW7 911 aa44.79■■■■■ 4.76
PRELID2-202ENST00000394450 CHGAP10645 457 aaKnown RBP44.76■■■■■ 4.76
PRELID2-202ENST00000394450 E9PCH4 1651 aa44.74■■■■■ 4.75
PRELID2-202ENST00000394450 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP44.72■■■■■ 4.75
PRELID2-202ENST00000394450 SLC26A8Q96RN1 970 aa44.72■■■■■ 4.75
PRELID2-202ENST00000394450 HSPA1LP34931 641 aa44.66■■■■■ 4.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms