RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 NEUROD1Q13562 356 aa29.55■■■□□ 2.32
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HDDC3-202ENST00000394272 ABCA6Q8N139 1617 aa29.54■■■□□ 2.32
HDDC3-202ENST00000394272 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.53■■■□□ 2.32
HDDC3-202ENST00000394272 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.52■■■□□ 2.32
HDDC3-202ENST00000394272 A2MP01023 1474 aa29.51■■■□□ 2.32
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HDDC3-202ENST00000394272 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.48■■■□□ 2.31
HDDC3-202ENST00000394272 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.46■■■□□ 2.31
HDDC3-202ENST00000394272 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.44■■■□□ 2.3
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HDDC3-202ENST00000394272 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.41■■■□□ 2.3
HDDC3-202ENST00000394272 TONSLQ96HA7 1378 aa29.41■■■□□ 2.3
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HDDC3-202ENST00000394272 ATP10AO60312 1499 aa29.28■■■□□ 2.28
HDDC3-202ENST00000394272 PLA2R1Q13018 1463 aa29.28■■■□□ 2.28
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HDDC3-202ENST00000394272 CEP152O94986 1710 aa29.24■■■□□ 2.27
HDDC3-202ENST00000394272 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
HDDC3-202ENST00000394272 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.24■■■□□ 2.27
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HDDC3-202ENST00000394272 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.22■■■□□ 2.27
HDDC3-202ENST00000394272 GGT6Q6P531 493 aa29.19■■■□□ 2.26
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.19■■■□□ 2.26
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HDDC3-202ENST00000394272 AGLP35573 1532 aa29.19■■■□□ 2.26
HDDC3-202ENST00000394272 PTPRTO14522 1441 aa29.18■■■□□ 2.26
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HDDC3-202ENST00000394272 TRPM2O94759 1503 aa29.16■■■□□ 2.26
HDDC3-202ENST00000394272 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.15■■■□□ 2.26
HDDC3-202ENST00000394272 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
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HDDC3-202ENST00000394272 NPATQ14207 1427 aa29.08■■■□□ 2.25
HDDC3-202ENST00000394272 CLTCL1P53675 1640 aa29.06■■■□□ 2.24
HDDC3-202ENST00000394272 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.03■■■□□ 2.24
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HDDC3-202ENST00000394272 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29■■■□□ 2.23
HDDC3-202ENST00000394272 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.99■■■□□ 2.23
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HDDC3-202ENST00000394272 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.96■■■□□ 2.23
HDDC3-202ENST00000394272 NOS1P29475 1434 aa28.95■■■□□ 2.22
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HDDC3-202ENST00000394272 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.88■■■□□ 2.21
HDDC3-202ENST00000394272 PIK3C2BO00750 1634 aa28.88■■■□□ 2.21
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HDDC3-202ENST00000394272 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.86■■■□□ 2.21
HDDC3-202ENST00000394272 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.85■■■□□ 2.21
HDDC3-202ENST00000394272 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.85■■■□□ 2.21
HDDC3-202ENST00000394272 MROH2AA6NES4 1674 aa28.84■■■□□ 2.21
HDDC3-202ENST00000394272 ADGRB3O60242 1522 aa28.84■■■□□ 2.21
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
HDDC3-202ENST00000394272 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
HDDC3-202ENST00000394272 ERVK-7P63135 1459 aa28.8■■■□□ 2.2
HDDC3-202ENST00000394272 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.8■■■□□ 2.2
HDDC3-202ENST00000394272 IFT172Q9UG01 1749 aa28.78■■■□□ 2.2
HDDC3-202ENST00000394272 STAC3Q96MF2 364 aa28.78■■■□□ 2.2
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HDDC3-202ENST00000394272 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.76■■■□□ 2.19
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HDDC3-202ENST00000394272 MADDQ8WXG6 1647 aa28.75■■■□□ 2.19
HDDC3-202ENST00000394272 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
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HDDC3-202ENST00000394272 PPLO60437 1756 aa28.69■■■□□ 2.18
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HDDC3-202ENST00000394272 LAMC1P11047 1609 aa28.67■■■□□ 2.18
HDDC3-202ENST00000394272 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
HDDC3-202ENST00000394272 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.66■■■□□ 2.18
HDDC3-202ENST00000394272 USP47Q96K76 1375 aa28.66■■■□□ 2.18
HDDC3-202ENST00000394272 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.65■■■□□ 2.18
HDDC3-202ENST00000394272 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.65■■■□□ 2.18
HDDC3-202ENST00000394272 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.65■■■□□ 2.18
HDDC3-202ENST00000394272 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.64■■■□□ 2.18
HDDC3-202ENST00000394272 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.64■■■□□ 2.18
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