RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381218.8

ZBED1-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED1, Length 2,832 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-201ENST00000381218 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
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ZBED1-201ENST00000381218 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED1-201ENST00000381218 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.61■□□□□ 0.89
ZBED1-201ENST00000381218 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
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ZBED1-201ENST00000381218 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.59■□□□□ 0.89
ZBED1-201ENST00000381218 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.58■□□□□ 0.89
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ZBED1-201ENST00000381218 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
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ZBED1-201ENST00000381218 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.56■□□□□ 0.88
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ZBED1-201ENST00000381218 ASXL2Q76L83 1435 aa20.44■□□□□ 0.86
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ZBED1-201ENST00000381218 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.41■□□□□ 0.86
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ZBED1-201ENST00000381218 CD109Q6YHK3 1445 aa20.22■□□□□ 0.83
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ZBED1-201ENST00000381218 UNC13BO14795 1591 aa20.22■□□□□ 0.83
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ZBED1-201ENST00000381218 RALBP1Q15311 655 aa20.17■□□□□ 0.82
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ZBED1-201ENST00000381218 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.11■□□□□ 0.81
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ZBED1-201ENST00000381218 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
ZBED1-201ENST00000381218 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.07■□□□□ 0.8
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