RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 NEFMP07197 916 aa9.05□□□□□ -0.96
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RABGEF1-202ENST00000380828 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
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RABGEF1-202ENST00000380828 ADCY10Q96PN6 1610 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa9□□□□□ -0.97
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RABGEF1-202ENST00000380828 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
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RABGEF1-202ENST00000380828 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
RABGEF1-202ENST00000380828 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa8.95□□□□□ -0.98
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RABGEF1-202ENST00000380828 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-202ENST00000380828 ABCC10Q5T3U5 1492 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-202ENST00000380828 KIAA0556O60303 1618 aa8.92□□□□□ -0.98
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
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RABGEF1-202ENST00000380828 GOLGA3Q08378 1498 aa8.83□□□□□ -1
RABGEF1-202ENST00000380828 PLB1Q6P1J6 1458 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-202ENST00000380828 RALBP1Q15311 655 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-202ENST00000380828 NBPF20Q3BBV1 942 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-202ENST00000380828 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa8.82□□□□□ -1
RABGEF1-202ENST00000380828 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa8.81□□□□□ -1
RABGEF1-202ENST00000380828 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
RABGEF1-202ENST00000380828 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
RABGEF1-202ENST00000380828 TNIKQ9UKE5 1360 aa8.81□□□□□ -1
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