RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369484.7

CMC4-202, Transcript of C-X9-C motif containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMC4, Length 1,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC4-202ENST00000369484 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.44■■■■■ 4.38
CMC4-202ENST00000369484 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa42.42■■■■■ 4.38
CMC4-202ENST00000369484 KIF3BO15066 747 aa42.41■■■■■ 4.38
CMC4-202ENST00000369484 PZPP20742 1482 aa42.38■■■■■ 4.38
CMC4-202ENST00000369484 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
CMC4-202ENST00000369484 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
CMC4-202ENST00000369484 MAST1Q9Y2H9 1570 aa42.32■■■■■ 4.37
CMC4-202ENST00000369484 TNRQ92752 1358 aa42.31■■■■■ 4.36
CMC4-202ENST00000369484 MAP3K1Q13233 1512 aa42.3■■■■■ 4.36
CMC4-202ENST00000369484 TSPY4P0CV99 314 aa42.28■■■■■ 4.36
CMC4-202ENST00000369484 TSPY10P0CW01 314 aa42.28■■■■■ 4.36
CMC4-202ENST00000369484 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP42.28■■■■■ 4.36
CMC4-202ENST00000369484 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
CMC4-202ENST00000369484 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa42.27■■■■■ 4.36
CMC4-202ENST00000369484 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.26■■■■■ 4.36
CMC4-202ENST00000369484 NEURL4Q96JN8 1562 aa42.24■■■■■ 4.35
CMC4-202ENST00000369484 DISP3Q9P2K9 1392 aa42.22■■■■■ 4.35
CMC4-202ENST00000369484 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP42.21■■■■■ 4.35
CMC4-202ENST00000369484 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP42.21■■■■■ 4.35
CMC4-202ENST00000369484 NLRP1Q9C000 1473 aa42.17■■■■■ 4.34
CMC4-202ENST00000369484 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP42.17■■■■■ 4.34
CMC4-202ENST00000369484 MIA2Q96PC5 1412 aa42.17■■■■■ 4.34
CMC4-202ENST00000369484 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa42.17■■■■■ 4.34
CMC4-202ENST00000369484 MYOM3Q5VTT5 1437 aa42.16■■■■■ 4.34
CMC4-202ENST00000369484 ABCC3O15438 1527 aa42.14■■■■■ 4.34
CMC4-202ENST00000369484 UGGT1Q9NYU2 1555 aa42.11■■■■■ 4.33
CMC4-202ENST00000369484 MROH1Q8NDA8 1641 aa42.11■■■■■ 4.33
CMC4-202ENST00000369484 UBAP1LF5GYI3 381 aa42.09■■■■■ 4.33
CMC4-202ENST00000369484 DEPDC5O75140 1603 aa42.07■■■■■ 4.33
CMC4-202ENST00000369484 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP42.07■■■■■ 4.33
CMC4-202ENST00000369484 CEP152O94986 1710 aa42.06■■■■■ 4.32
CMC4-202ENST00000369484 CPS1P31327 1500 aa42.05■■■■■ 4.32
CMC4-202ENST00000369484 ILDR2Q71H61 639 aa42.04■■■■■ 4.32
CMC4-202ENST00000369484 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
CMC4-202ENST00000369484 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
CMC4-202ENST00000369484 CROCC2H7BZ55 1655 aa42.03■■■■■ 4.32
CMC4-202ENST00000369484 ANKLE2Q86XL3 938 aa42.02■■■■■ 4.32
CMC4-202ENST00000369484 DUOX2Q9NRD8 1548 aa42.01■■■■■ 4.32
CMC4-202ENST00000369484 MED14O60244 1454 aa42.01■■■■■ 4.32
CMC4-202ENST00000369484 SHANK2Q9UPX8 1470 aa42.01■■■■■ 4.32
CMC4-202ENST00000369484 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.99■■■■■ 4.31
CMC4-202ENST00000369484 ERVK-7P63135 1459 aa41.98■■■■■ 4.31
CMC4-202ENST00000369484 IQGAP1P46940 1657 aa41.96■■■■■ 4.31
CMC4-202ENST00000369484 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
CMC4-202ENST00000369484 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.94■■■■■ 4.3
CMC4-202ENST00000369484 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.9■■■■■ 4.3
CMC4-202ENST00000369484 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.9■■■■■ 4.3
CMC4-202ENST00000369484 ABCC5O15440 1437 aa41.88■■■■■ 4.3
CMC4-202ENST00000369484 KIF15Q9NS87 1388 aa41.87■■■■■ 4.29
CMC4-202ENST00000369484 ERBINQ96RT1 1412 aa41.86■■■■■ 4.29
CMC4-202ENST00000369484 STRCP1A6NGW2 1772 aa41.83■■■■■ 4.29
CMC4-202ENST00000369484 SOCS7O14512 581 aa41.82■■■■■ 4.29
CMC4-202ENST00000369484 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.8■■■■■ 4.28
CMC4-202ENST00000369484 DAPK1P53355 1430 aa41.78■■■■■ 4.28
CMC4-202ENST00000369484 TOM1O60784 492 aa41.77■■■■■ 4.28
CMC4-202ENST00000369484 APLP2Q06481 763 aa41.77■■■■■ 4.28
CMC4-202ENST00000369484 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.77■■■■■ 4.28
CMC4-202ENST00000369484 ALKQ9UM73 1620 aa41.73■■■■■ 4.27
CMC4-202ENST00000369484 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.73■■■■■ 4.27
CMC4-202ENST00000369484 SYNMO15061 1565 aa41.71■■■■■ 4.27
CMC4-202ENST00000369484 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP41.7■■■■■ 4.27
CMC4-202ENST00000369484 SLIT1O75093 1534 aa41.7■■■■■ 4.27
CMC4-202ENST00000369484 PIP4K2BP78356 416 aa41.7■■■■■ 4.27
CMC4-202ENST00000369484 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.7■■■■■ 4.27
CMC4-202ENST00000369484 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.26
CMC4-202ENST00000369484 HSPA1LP34931 641 aa41.68■■■■■ 4.26
CMC4-202ENST00000369484 PIK3C2BO00750 1634 aa41.66■■■■■ 4.26
CMC4-202ENST00000369484 LRRC7Q96NW7 1537 aa41.65■■■■■ 4.26
CMC4-202ENST00000369484 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.62■■■■■ 4.25
CMC4-202ENST00000369484 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
CMC4-202ENST00000369484 KANK1Q14678 1352 aa41.61■■■■■ 4.25
CMC4-202ENST00000369484 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.61■■■■■ 4.25
CMC4-202ENST00000369484 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.6■■■■■ 4.25
CMC4-202ENST00000369484 LTKP29376 864 aa41.58■■■■■ 4.25
CMC4-202ENST00000369484 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
CMC4-202ENST00000369484 TXNDC2Q86VQ3 553 aa41.53■■■■■ 4.24
CMC4-202ENST00000369484 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.53■■■■■ 4.24
CMC4-202ENST00000369484 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
CMC4-202ENST00000369484 ADGRL2O95490 1459 aa41.52■■■■■ 4.24
CMC4-202ENST00000369484 TMEM2Q9UHN6 1383 aa41.5■■■■■ 4.23
CMC4-202ENST00000369484 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.49■■■■■ 4.23
CMC4-202ENST00000369484 EID1Q9Y6B2 187 aa41.46■■■■■ 4.23
CMC4-202ENST00000369484 NOS1P29475 1434 aa41.43■■■■■ 4.22
CMC4-202ENST00000369484 IDI1Q13907 227 aa41.4■■■■■ 4.22
CMC4-202ENST00000369484 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.4■■■■■ 4.22
CMC4-202ENST00000369484 ADGRB3O60242 1522 aa41.38■■■■■ 4.21
CMC4-202ENST00000369484 TET3O43151 1660 aa41.33■■■■■ 4.21
CMC4-202ENST00000369484 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.32■■■■■ 4.21
CMC4-202ENST00000369484 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
CMC4-202ENST00000369484 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
CMC4-202ENST00000369484 MYO5BQ9ULV0 1848 aa41.29■■■■■ 4.2
CMC4-202ENST00000369484 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.26■■■■■ 4.2
CMC4-202ENST00000369484 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.25■■■■■ 4.19
CMC4-202ENST00000369484 UNC13BO14795 1591 aa41.22■■■■■ 4.19
CMC4-202ENST00000369484 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
CMC4-202ENST00000369484 NWD1Q149M9 1564 aa41.2■■■■■ 4.19
CMC4-202ENST00000369484 TMEM94Q12767 1356 aa41.18■■■■■ 4.18
CMC4-202ENST00000369484 KCNA6P17658 529 aa41.18■■■■■ 4.18
CMC4-202ENST00000369484 SLC26A8Q96RN1 970 aa41.17■■■■■ 4.18
CMC4-202ENST00000369484 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
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