RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368242.7

C1orf61-203, Transcript of chromosome 1 open reading frame 61, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene C1orf61, Length 867 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61-203ENST00000368242 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
C1orf61-203ENST00000368242 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.48■■■□□ 2.31
C1orf61-203ENST00000368242 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.47■■■□□ 2.31
C1orf61-203ENST00000368242 TSPY4P0CV99 314 aa29.47■■■□□ 2.31
C1orf61-203ENST00000368242 TSPY10P0CW01 314 aa29.47■■■□□ 2.31
C1orf61-203ENST00000368242 APLP2Q06481 763 aa29.47■■■□□ 2.31
C1orf61-203ENST00000368242 KIF3BO15066 747 aa29.46■■■□□ 2.31
C1orf61-203ENST00000368242 DAPK1P53355 1430 aa29.44■■■□□ 2.3
C1orf61-203ENST00000368242 FBXO41Q8TF61 875 aa29.43■■■□□ 2.3
C1orf61-203ENST00000368242 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.4■■■□□ 2.3
C1orf61-203ENST00000368242 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.29
C1orf61-203ENST00000368242 PZPP20742 1482 aa29.38■■■□□ 2.29
C1orf61-203ENST00000368242 ABCC3O15438 1527 aa29.38■■■□□ 2.29
C1orf61-203ENST00000368242 NCOA1Q15788 1441 aa29.37■■■□□ 2.29
C1orf61-203ENST00000368242 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
C1orf61-203ENST00000368242 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.35■■■□□ 2.29
C1orf61-203ENST00000368242 CEP152O94986 1710 aa29.34■■■□□ 2.29
C1orf61-203ENST00000368242 KIF15Q9NS87 1388 aa29.33■■■□□ 2.29
C1orf61-203ENST00000368242 DEPDC5O75140 1603 aa29.33■■■□□ 2.29
C1orf61-203ENST00000368242 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
C1orf61-203ENST00000368242 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
C1orf61-203ENST00000368242 ERBINQ96RT1 1412 aa29.29■■■□□ 2.28
C1orf61-203ENST00000368242 ADGRL2O95490 1459 aa29.29■■■□□ 2.28
C1orf61-203ENST00000368242 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.28■■■□□ 2.28
C1orf61-203ENST00000368242 PTPRTO14522 1441 aa29.28■■■□□ 2.28
C1orf61-203ENST00000368242 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.27■■■□□ 2.28
C1orf61-203ENST00000368242 PLA2R1Q13018 1463 aa29.25■■■□□ 2.27
C1orf61-203ENST00000368242 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.25■■■□□ 2.27
C1orf61-203ENST00000368242 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.24■■■□□ 2.27
C1orf61-203ENST00000368242 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.24■■■□□ 2.27
C1orf61-203ENST00000368242 TNRQ92752 1358 aa29.24■■■□□ 2.27
C1orf61-203ENST00000368242 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.22■■■□□ 2.27
C1orf61-203ENST00000368242 CERKQ8TCT0 537 aa29.21■■■□□ 2.27
C1orf61-203ENST00000368242 ERVK-7P63135 1459 aa29.19■■■□□ 2.26
C1orf61-203ENST00000368242 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.19■■■□□ 2.26
C1orf61-203ENST00000368242 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.18■■■□□ 2.26
C1orf61-203ENST00000368242 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.18■■■□□ 2.26
C1orf61-203ENST00000368242 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
C1orf61-203ENST00000368242 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.16■■■□□ 2.26
C1orf61-203ENST00000368242 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.15■■■□□ 2.26
C1orf61-203ENST00000368242 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
C1orf61-203ENST00000368242 NLRP1Q9C000 1473 aa29.14■■■□□ 2.26
C1orf61-203ENST00000368242 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.13■■■□□ 2.25
C1orf61-203ENST00000368242 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
C1orf61-203ENST00000368242 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.13■■■□□ 2.25
C1orf61-203ENST00000368242 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
C1orf61-203ENST00000368242 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.08■■■□□ 2.25
C1orf61-203ENST00000368242 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.07■■■□□ 2.24
C1orf61-203ENST00000368242 PKD2Q13563 968 aa29.05■■■□□ 2.24
C1orf61-203ENST00000368242 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.04■■■□□ 2.24
C1orf61-203ENST00000368242 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.04■■■□□ 2.24
C1orf61-203ENST00000368242 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.02■■■□□ 2.248e-7■■■■■ 64.2
C1orf61-203ENST00000368242 UNC13BO14795 1591 aa29.02■■■□□ 2.24
C1orf61-203ENST00000368242 SYNMO15061 1565 aa29.01■■■□□ 2.23
C1orf61-203ENST00000368242 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29■■■□□ 2.23
C1orf61-203ENST00000368242 ROCK1Q13464 1354 aa29■■■□□ 2.23
C1orf61-203ENST00000368242 PIK3C2BO00750 1634 aa28.97■■■□□ 2.23
C1orf61-203ENST00000368242 MED14O60244 1454 aa28.97■■■□□ 2.23
C1orf61-203ENST00000368242 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
C1orf61-203ENST00000368242 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
C1orf61-203ENST00000368242 KANK1Q14678 1352 aa28.95■■■□□ 2.22
C1orf61-203ENST00000368242 NOS1P29475 1434 aa28.94■■■□□ 2.22
C1orf61-203ENST00000368242 TET3O43151 1660 aa28.94■■■□□ 2.22
C1orf61-203ENST00000368242 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.92■■■□□ 2.22
C1orf61-203ENST00000368242 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
C1orf61-203ENST00000368242 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
C1orf61-203ENST00000368242 IQGAP1P46940 1657 aa28.91■■■□□ 2.22
C1orf61-203ENST00000368242 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.91■■■□□ 2.22
C1orf61-203ENST00000368242 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.91■■■□□ 2.22
C1orf61-203ENST00000368242 SLIT1O75093 1534 aa28.9■■■□□ 2.22
C1orf61-203ENST00000368242 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.88■■■□□ 2.21
C1orf61-203ENST00000368242 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
C1orf61-203ENST00000368242 E9PCH4 1651 aa28.86■■■□□ 2.21
C1orf61-203ENST00000368242 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.85■■■□□ 2.21
C1orf61-203ENST00000368242 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
C1orf61-203ENST00000368242 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.85■■■□□ 2.21
C1orf61-203ENST00000368242 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
C1orf61-203ENST00000368242 ITGAEP38570 1179 aa28.81■■■□□ 2.2
C1orf61-203ENST00000368242 ADGRB3O60242 1522 aa28.8■■■□□ 2.2
C1orf61-203ENST00000368242 IDI1Q13907 227 aa28.8■■■□□ 2.2
C1orf61-203ENST00000368242 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.8■■■□□ 2.2
C1orf61-203ENST00000368242 LTKP29376 864 aa28.79■■■□□ 2.2
C1orf61-203ENST00000368242 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.75■■■□□ 2.19
C1orf61-203ENST00000368242 CPS1P31327 1500 aa28.75■■■□□ 2.19
C1orf61-203ENST00000368242 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.72■■■□□ 2.19
C1orf61-203ENST00000368242 NAIPQ13075 1403 aa28.72■■■□□ 2.19
C1orf61-203ENST00000368242 ALKQ9UM73 1620 aa28.69■■■□□ 2.18
C1orf61-203ENST00000368242 NUP155O75694 1391 aa28.68■■■□□ 2.18
C1orf61-203ENST00000368242 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.66■■■□□ 2.18
C1orf61-203ENST00000368242 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.66■■■□□ 2.18
C1orf61-203ENST00000368242 ZFYVE9O95405 1425 aa28.66■■■□□ 2.18
C1orf61-203ENST00000368242 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
C1orf61-203ENST00000368242 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.63■■■□□ 2.17
C1orf61-203ENST00000368242 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.63■■■□□ 2.17
C1orf61-203ENST00000368242 HFM1A2PYH4 1435 aa28.62■■■□□ 2.17
C1orf61-203ENST00000368242 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.58■■■□□ 2.17
C1orf61-203ENST00000368242 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.57■■■□□ 2.16
C1orf61-203ENST00000368242 EID1Q9Y6B2 187 aa28.56■■■□□ 2.16
C1orf61-203ENST00000368242 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.53■■■□□ 2.16
C1orf61-203ENST00000368242 NWD1Q149M9 1564 aa28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms