RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CCSAP-203ENST00000366687 UACAQ9BZF9 1416 aa25.38■■□□□ 1.65
CCSAP-203ENST00000366687 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CCSAP-203ENST00000366687 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.38■■□□□ 1.65
CCSAP-203ENST00000366687 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.659e-8■■□□□ 13.9
CCSAP-203ENST00000366687 PTPRGP23470 1445 aa25.37■■□□□ 1.65
CCSAP-203ENST00000366687 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.35■■□□□ 1.65
CCSAP-203ENST00000366687 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
CCSAP-203ENST00000366687 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.33■■□□□ 1.65
CCSAP-203ENST00000366687 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.32■■□□□ 1.64
CCSAP-203ENST00000366687 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CCSAP-203ENST00000366687 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.32■■□□□ 1.64
CCSAP-203ENST00000366687 NUTM2FA1L443 756 aa25.31■■□□□ 1.64
CCSAP-203ENST00000366687 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.31■■□□□ 1.64
CCSAP-203ENST00000366687 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.3■■□□□ 1.64
CCSAP-203ENST00000366687 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CCSAP-203ENST00000366687 EVC2Q86UK5 1308 aa25.29■■□□□ 1.64
CCSAP-203ENST00000366687 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CCSAP-203ENST00000366687 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.29■■□□□ 1.64
CCSAP-203ENST00000366687 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CCSAP-203ENST00000366687 USP47Q96K76 1375 aa25.28■■□□□ 1.64
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.27■■□□□ 1.64
CCSAP-203ENST00000366687 E9PSI1 815 aa25.26■■□□□ 1.63
CCSAP-203ENST00000366687 SMARCA4P51532 1647 aa25.26■■□□□ 1.63
CCSAP-203ENST00000366687 COG3Q96JB2 828 aa25.25■■□□□ 1.63
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC34Q96HJ3 373 aa25.24■■□□□ 1.63
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CCSAP-203ENST00000366687 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CCSAP-203ENST00000366687 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CCSAP-203ENST00000366687 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.22■■□□□ 1.63
CCSAP-203ENST00000366687 NGEFQ8N5V2 710 aa25.21■■□□□ 1.63
CCSAP-203ENST00000366687 ST18O60284 1047 aa25.21■■□□□ 1.63
CCSAP-203ENST00000366687 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.21■■□□□ 1.63
CCSAP-203ENST00000366687 IGF1RP08069 1367 aa25.19■■□□□ 1.62
CCSAP-203ENST00000366687 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CCSAP-203ENST00000366687 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.19■■□□□ 1.62
CCSAP-203ENST00000366687 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.19■■□□□ 1.62
CCSAP-203ENST00000366687 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
CCSAP-203ENST00000366687 CLSTN1O94985 981 aa25.17■■□□□ 1.62
CCSAP-203ENST00000366687 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.17■■□□□ 1.62
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa25.17■■□□□ 1.62
CCSAP-203ENST00000366687 STAC3Q96MF2 364 aa25.16■■□□□ 1.62
CCSAP-203ENST00000366687 KIF3AQ9Y496 699 aa25.16■■□□□ 1.62
CCSAP-203ENST00000366687 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CCSAP-203ENST00000366687 APAF1O14727 1248 aa25.15■■□□□ 1.62
CCSAP-203ENST00000366687 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CCSAP-203ENST00000366687 TPM4P67936 248 aa25.14■■□□□ 1.62
CCSAP-203ENST00000366687 TEFQ10587 303 aa25.13■■□□□ 1.61
CCSAP-203ENST00000366687 FAM161AQ3B820 660 aa25.12■■□□□ 1.61
CCSAP-203ENST00000366687 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.12■■□□□ 1.61
CCSAP-203ENST00000366687 KIF16BQ96L93 1317 aa25.12■■□□□ 1.61
CCSAP-203ENST00000366687 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CCSAP-203ENST00000366687 PLIN1O60240 522 aa25.11■■□□□ 1.61
CCSAP-203ENST00000366687 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.11■■□□□ 1.61
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.11■■□□□ 1.61
CCSAP-203ENST00000366687 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CCSAP-203ENST00000366687 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.1■■□□□ 1.61
CCSAP-203ENST00000366687 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.1■■□□□ 1.61
CCSAP-203ENST00000366687 PDE4AP27815 886 aa25.09■■□□□ 1.61
CCSAP-203ENST00000366687 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CCSAP-203ENST00000366687 OSCARQ8IYS5 282 aa25.09■■□□□ 1.61
CCSAP-203ENST00000366687 COG6Q9Y2V7 657 aa25.09■■□□□ 1.61
CCSAP-203ENST00000366687 FOXD4L1Q9NU39 408 aa25.08■■□□□ 1.61
CCSAP-203ENST00000366687 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.08■■□□□ 1.61
CCSAP-203ENST00000366687 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.07■■□□□ 1.6
CCSAP-203ENST00000366687 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CCSAP-203ENST00000366687 CRBNQ96SW2 442 aa25.06■■□□□ 1.6
CCSAP-203ENST00000366687 TOMM22Q9NS69 142 aa25.06■■□□□ 1.6
CCSAP-203ENST00000366687 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.05■■□□□ 1.6
CCSAP-203ENST00000366687 PHF14O94880 888 aa25.04■■□□□ 1.6
CCSAP-203ENST00000366687 RILPL2Q969X0 211 aa25.04■■□□□ 1.6
CCSAP-203ENST00000366687 CHMP4CQ96CF2 233 aa25.04■■□□□ 1.6
CCSAP-203ENST00000366687 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.03■■□□□ 1.6
CCSAP-203ENST00000366687 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CCSAP-203ENST00000366687 USP35Q9P2H5 1018 aa25.03■■□□□ 1.6
CCSAP-203ENST00000366687 DDX11L8A8MPP1 907 aa25.02■■□□□ 1.6
CCSAP-203ENST00000366687 RASSF8Q8NHQ8 419 aa25.02■■□□□ 1.6
CCSAP-203ENST00000366687 G3V3G9 751 aa25.01■■□□□ 1.59
CCSAP-203ENST00000366687 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
CCSAP-203ENST00000366687 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.01■■□□□ 1.59
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CCSAP-203ENST00000366687 RIPK4P57078 832 aa25■■□□□ 1.59
CCSAP-203ENST00000366687 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
CCSAP-203ENST00000366687 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa24.99■■□□□ 1.59
CCSAP-203ENST00000366687 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CCSAP-203ENST00000366687 TTC5Q8N0Z6 440 aa24.98■■□□□ 1.59
CCSAP-203ENST00000366687 RUNDC1Q96C34 613 aa24.97■■□□□ 1.59
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC7Q96M83 1385 aa24.97■■□□□ 1.59
CCSAP-203ENST00000366687 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.97■■□□□ 1.59
CCSAP-203ENST00000366687 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
CCSAP-203ENST00000366687 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CCSAP-203ENST00000366687 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.96■■□□□ 1.59
CCSAP-203ENST00000366687 REC8O95072 547 aa24.96■■□□□ 1.59
CCSAP-203ENST00000366687 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.95■■□□□ 1.59
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.95■■□□□ 1.58
CCSAP-203ENST00000366687 RUFY2Q8WXA3 655 aa24.95■■□□□ 1.58
CCSAP-203ENST00000366687 CUX1P39880 1505 aa24.95■■□□□ 1.58
CCSAP-203ENST00000366687 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CCSAP-203ENST00000366687 EVA1CP58658 441 aa24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms