RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361320.4

LRRTM3-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM3, Length 4,358 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3-201ENST00000361320 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
LRRTM3-201ENST00000361320 ADAMTS12P58397 1594 aa9.33□□□□□ -0.92
LRRTM3-201ENST00000361320 AMPHP49418 695 aa9.33□□□□□ -0.92
LRRTM3-201ENST00000361320 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
LRRTM3-201ENST00000361320 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa9.33□□□□□ -0.92
LRRTM3-201ENST00000361320 NUP160Q12769 1436 aa9.32□□□□□ -0.92
LRRTM3-201ENST00000361320 CFAP70Q5T0N1 1121 aa9.32□□□□□ -0.92
LRRTM3-201ENST00000361320 AKNAQ7Z591 1439 aa9.32□□□□□ -0.92
LRRTM3-201ENST00000361320 PIP4K2BP78356 416 aa9.32□□□□□ -0.92
LRRTM3-201ENST00000361320 EVC2Q86UK5 1308 aa9.31□□□□□ -0.92
LRRTM3-201ENST00000361320 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
LRRTM3-201ENST00000361320 TIAM1Q13009 1591 aa9.31□□□□□ -0.92
LRRTM3-201ENST00000361320 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
LRRTM3-201ENST00000361320 EVA1CP58658 441 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM3-201ENST00000361320 CCDC141Q6ZP82 1450 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM3-201ENST00000361320 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
LRRTM3-201ENST00000361320 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
LRRTM3-201ENST00000361320 DAPK1P53355 1430 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM3-201ENST00000361320 TEX14Q8IWB6 1497 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM3-201ENST00000361320 WDR7Q9Y4E6 1490 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM3-201ENST00000361320 KIF14Q15058 1648 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM3-201ENST00000361320 ESCO1Q5FWF5 840 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM3-201ENST00000361320 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
LRRTM3-201ENST00000361320 NUTM2GQ5VZR2 741 aa9.28□□□□□ -0.92
LRRTM3-201ENST00000361320 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
LRRTM3-201ENST00000361320 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
LRRTM3-201ENST00000361320 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 COG3Q96JB2 828 aa9.27□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 HSPA2P54652 639 aa9.26□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa9.26□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 ABCC2Q92887 1545 aa9.26□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa9.26□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 IDI1Q13907 227 aa9.26□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 STAC3Q96MF2 364 aa9.26□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 PRAM1Q96QH2 718 aa9.26□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 CABP2Q9NPB3 220 aa9.26□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 PLCH2O75038 1416 aa9.25□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 UGGT2Q9NYU1 1516 aa9.25□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 CEP170Q5SW79 1584 aa9.25□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 PANK3Q9H999 370 aa9.25□□□□□ -0.93
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LRRTM3-201ENST00000361320 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 USP47Q96K76 1375 aa9.24□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa9.23□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 NLRP6P59044 892 aa9.23□□□□□ -0.93
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LRRTM3-201ENST00000361320 NBPF1Q3BBV0 1214 aa9.23□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 USP35Q9P2H5 1018 aa9.23□□□□□ -0.93
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LRRTM3-201ENST00000361320 DMRT2Q9Y5R5 561 aa9.22□□□□□ -0.93
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LRRTM3-201ENST00000361320 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 PPP6R1Q9UPN7 881 aa9.22□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 HFM1A2PYH4 1435 aa9.22□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 MYH16Q9H6N6 1097 aa9.21□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 DISP1Q96F81 1524 aa9.21□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 CGNL1Q0VF96 1302 aa9.21□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
LRRTM3-201ENST00000361320 ERBINQ96RT1 1412 aa9.21□□□□□ -0.94
LRRTM3-201ENST00000361320 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa9.21□□□□□ -0.94
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LRRTM3-201ENST00000361320 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
LRRTM3-201ENST00000361320 FKBP8Q14318 412 aa9.21□□□□□ -0.94
LRRTM3-201ENST00000361320 ABTB2Q8N961 1025 aa9.21□□□□□ -0.94
LRRTM3-201ENST00000361320 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa9.2□□□□□ -0.94
LRRTM3-201ENST00000361320 GPRASP1Q5JY77 1395 aa9.2□□□□□ -0.94
LRRTM3-201ENST00000361320 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
LRRTM3-201ENST00000361320 PBRM1Q86U86 1689 aa9.2□□□□□ -0.94
LRRTM3-201ENST00000361320 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa9.2□□□□□ -0.94
LRRTM3-201ENST00000361320 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
LRRTM3-201ENST00000361320 NCOA1Q15788 1441 aa9.19□□□□□ -0.94
LRRTM3-201ENST00000361320 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
LRRTM3-201ENST00000361320 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.19□□□□□ -0.94
LRRTM3-201ENST00000361320 NLRP2Q9NX02 1062 aa9.19□□□□□ -0.94
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa9.18□□□□□ -0.94
LRRTM3-201ENST00000361320 NAIPQ13075 1403 aa9.18□□□□□ -0.94
LRRTM3-201ENST00000361320 ROCK1Q13464 1354 aa9.18□□□□□ -0.94
LRRTM3-201ENST00000361320 TNRQ92752 1358 aa9.18□□□□□ -0.94
LRRTM3-201ENST00000361320 RALBP1Q15311 655 aa9.18□□□□□ -0.94
LRRTM3-201ENST00000361320 WAPLQ7Z5K2 1190 aa9.18□□□□□ -0.94
LRRTM3-201ENST00000361320 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa9.18□□□□□ -0.94
LRRTM3-201ENST00000361320 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa9.18□□□□□ -0.94
LRRTM3-201ENST00000361320 STRN4Q9NRL3 753 aa9.17□□□□□ -0.94
LRRTM3-201ENST00000361320 CCDC136Q96JN2 1154 aa9.17□□□□□ -0.94
LRRTM3-201ENST00000361320 CDK19Q9BWU1 502 aa9.17□□□□□ -0.94
LRRTM3-201ENST00000361320 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa9.16□□□□□ -0.94
LRRTM3-201ENST00000361320 CCDC146Q8IYE0 955 aa9.16□□□□□ -0.94
LRRTM3-201ENST00000361320 A2MP01023 1474 aa9.16□□□□□ -0.94
LRRTM3-201ENST00000361320 MSH5O43196 834 aa9.16□□□□□ -0.94
LRRTM3-201ENST00000361320 CABP1Q9NZU7 370 aa9.16□□□□□ -0.94
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