RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355904.8

GTF2E2-201, Transcript of general transcription factor IIE subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2E2, Length 1,762 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2-201ENST00000355904 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.14■■■■□ 3.22
GTF2E2-201ENST00000355904 RICTORQ6R327 1708 aa35.14■■■■□ 3.22
GTF2E2-201ENST00000355904 DEPDC5O75140 1603 aa35.14■■■■□ 3.22
GTF2E2-201ENST00000355904 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.13■■■■□ 3.21
GTF2E2-201ENST00000355904 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
GTF2E2-201ENST00000355904 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.13■■■■□ 3.219e-11■■□□□ 11.9
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GTF2E2-201ENST00000355904 RAPGEF3O95398 923 aa35.08■■■■□ 3.21
GTF2E2-201ENST00000355904 A2MP01023 1474 aa35.08■■■■□ 3.21
GTF2E2-201ENST00000355904 ABCA6Q8N139 1617 aa35.07■■■■□ 3.2
GTF2E2-201ENST00000355904 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.06■■■■□ 3.2
GTF2E2-201ENST00000355904 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
GTF2E2-201ENST00000355904 VWDEQ8N2E2 1590 aa35■■■■□ 3.19
GTF2E2-201ENST00000355904 KIF3BO15066 747 aa35■■■■□ 3.19
GTF2E2-201ENST00000355904 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34.99■■■■□ 3.19
GTF2E2-201ENST00000355904 MROH1Q8NDA8 1641 aa34.99■■■■□ 3.19
GTF2E2-201ENST00000355904 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa34.99■■■■□ 3.19
GTF2E2-201ENST00000355904 KANK1Q14678 1352 aa34.97■■■■□ 3.19
GTF2E2-201ENST00000355904 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
GTF2E2-201ENST00000355904 L3MBTL2Q969R5 705 aa34.96■■■■□ 3.19
GTF2E2-201ENST00000355904 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.95■■■■□ 3.18
GTF2E2-201ENST00000355904 TET3O43151 1660 aa34.93■■■■□ 3.18
GTF2E2-201ENST00000355904 PLA2R1Q13018 1463 aa34.9■■■■□ 3.18
GTF2E2-201ENST00000355904 E9PCH4 1651 aa34.89■■■■□ 3.18
GTF2E2-201ENST00000355904 ATP10AO60312 1499 aa34.89■■■■□ 3.18
GTF2E2-201ENST00000355904 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.88■■■■□ 3.17
GTF2E2-201ENST00000355904 CCDC144AA2RUR9 1427 aa34.87■■■■□ 3.17
GTF2E2-201ENST00000355904 LMTK2Q8IWU2 1503 aa34.82■■■■□ 3.16
GTF2E2-201ENST00000355904 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.78■■■■□ 3.16
GTF2E2-201ENST00000355904 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
GTF2E2-201ENST00000355904 TRPM2O94759 1503 aa34.77■■■■□ 3.16
GTF2E2-201ENST00000355904 CEP152O94986 1710 aa34.76■■■■□ 3.15
GTF2E2-201ENST00000355904 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa34.76■■■■□ 3.15
GTF2E2-201ENST00000355904 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.75■■■■□ 3.15
GTF2E2-201ENST00000355904 PTPRTO14522 1441 aa34.74■■■■□ 3.15
GTF2E2-201ENST00000355904 REREQ9P2R6 1566 aa34.71■■■■□ 3.15
GTF2E2-201ENST00000355904 GGT6Q6P531 493 aa34.7■■■■□ 3.15
GTF2E2-201ENST00000355904 ABCC3O15438 1527 aa34.69■■■■□ 3.14
GTF2E2-201ENST00000355904 NBPF8Q3BBV2 869 aa34.69■■■■□ 3.14
GTF2E2-201ENST00000355904 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.67■■■■□ 3.14
GTF2E2-201ENST00000355904 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.66■■■■□ 3.14
GTF2E2-201ENST00000355904 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa34.65■■■■□ 3.14
GTF2E2-201ENST00000355904 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
GTF2E2-201ENST00000355904 CLTCL1P53675 1640 aa34.62■■■■□ 3.13
GTF2E2-201ENST00000355904 AGLP35573 1532 aa34.62■■■■□ 3.13
GTF2E2-201ENST00000355904 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa34.6■■■■□ 3.13
GTF2E2-201ENST00000355904 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa34.6■■■■□ 3.13
GTF2E2-201ENST00000355904 NPATQ14207 1427 aa34.57■■■■□ 3.12
GTF2E2-201ENST00000355904 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa34.57■■■■□ 3.12
GTF2E2-201ENST00000355904 DCAF11Q8TEB1 546 aa34.57■■■■□ 3.12
GTF2E2-201ENST00000355904 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
GTF2E2-201ENST00000355904 RGL3Q3MIN7 710 aa34.53■■■■□ 3.12
GTF2E2-201ENST00000355904 RALGAPBQ86X10 1494 aa34.52■■■■□ 3.12
GTF2E2-201ENST00000355904 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa34.51■■■■□ 3.11
GTF2E2-201ENST00000355904 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
GTF2E2-201ENST00000355904 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
GTF2E2-201ENST00000355904 NEURL4Q96JN8 1562 aa34.5■■■■□ 3.11
GTF2E2-201ENST00000355904 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.49■■■■□ 3.11
GTF2E2-201ENST00000355904 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP34.49■■■■□ 3.11
GTF2E2-201ENST00000355904 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa34.49■■■■□ 3.11
GTF2E2-201ENST00000355904 UGGT1Q9NYU2 1555 aa34.48■■■■□ 3.11
GTF2E2-201ENST00000355904 PRAG1Q86YV5 1406 aa34.47■■■■□ 3.11
GTF2E2-201ENST00000355904 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.47■■■■□ 3.11
GTF2E2-201ENST00000355904 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
GTF2E2-201ENST00000355904 NOS1P29475 1434 aa34.42■■■■□ 3.1
GTF2E2-201ENST00000355904 KIF1BO60333 1816 aa34.41■■■■□ 3.1
GTF2E2-201ENST00000355904 PPP6R1Q9UPN7 881 aa34.41■■■■□ 3.1
GTF2E2-201ENST00000355904 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa34.4■■■■□ 3.1
GTF2E2-201ENST00000355904 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
GTF2E2-201ENST00000355904 ADGRB3O60242 1522 aa34.35■■■■□ 3.09
GTF2E2-201ENST00000355904 SYNMO15061 1565 aa34.35■■■■□ 3.09
GTF2E2-201ENST00000355904 MROH2AA6NES4 1674 aa34.34■■■■□ 3.09
GTF2E2-201ENST00000355904 USP47Q96K76 1375 aa34.33■■■■□ 3.09
GTF2E2-201ENST00000355904 PIK3C2BO00750 1634 aa34.33■■■■□ 3.09
GTF2E2-201ENST00000355904 STAC3Q96MF2 364 aa34.33■■■■□ 3.09
GTF2E2-201ENST00000355904 MADDQ8WXG6 1647 aa34.32■■■■□ 3.09
GTF2E2-201ENST00000355904 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
GTF2E2-201ENST00000355904 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
GTF2E2-201ENST00000355904 PREX1Q8TCU6 1659 aa34.3■■■■□ 3.08
GTF2E2-201ENST00000355904 CARD11Q9BXL7 1154 aa34.29■■■■□ 3.08
GTF2E2-201ENST00000355904 LAMC1P11047 1609 aa34.27■■■■□ 3.08
GTF2E2-201ENST00000355904 GPRASP1Q5JY77 1395 aa34.26■■■■□ 3.08
GTF2E2-201ENST00000355904 IFT172Q9UG01 1749 aa34.26■■■■□ 3.08
GTF2E2-201ENST00000355904 MYOM2P54296 1465 aa34.26■■■■□ 3.07
GTF2E2-201ENST00000355904 MLECQ14165 292 aa34.25■■■■□ 3.07
GTF2E2-201ENST00000355904 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
GTF2E2-201ENST00000355904 ERVK-7P63135 1459 aa34.22■■■■□ 3.07
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GTF2E2-201ENST00000355904 WASHC2AQ641Q2 1341 aa34.19■■■■□ 3.06
GTF2E2-201ENST00000355904 CHGAP10645 457 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
GTF2E2-201ENST00000355904 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
GTF2E2-201ENST00000355904 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.18■■■■□ 3.06
GTF2E2-201ENST00000355904 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP34.17■■■■□ 3.06
GTF2E2-201ENST00000355904 NBPF1Q3BBV0 1214 aa34.17■■■■□ 3.06
GTF2E2-201ENST00000355904 PPLO60437 1756 aa34.14■■■■□ 3.06
GTF2E2-201ENST00000355904 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa34.14■■■■□ 3.06
GTF2E2-201ENST00000355904 CCDC7Q96M83 1385 aa34.14■■■■□ 3.06
GTF2E2-201ENST00000355904 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa34.13■■■■□ 3.05
GTF2E2-201ENST00000355904 NRXN1Q9ULB1 1477 aa34.13■■■■□ 3.05
GTF2E2-201ENST00000355904 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
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