RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355531.7

AFG3L1P-201, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene AFG3L1P, Length 1,329 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-201ENST00000355531 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.61■■□□□ 1.37
AFG3L1P-201ENST00000355531 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.6■■□□□ 1.37
AFG3L1P-201ENST00000355531 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.6■■□□□ 1.37
AFG3L1P-201ENST00000355531 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
AFG3L1P-201ENST00000355531 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
AFG3L1P-201ENST00000355531 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.58■■□□□ 1.37
AFG3L1P-201ENST00000355531 KIF3BO15066 747 aa23.58■■□□□ 1.36
AFG3L1P-201ENST00000355531 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.56■■□□□ 1.36
AFG3L1P-201ENST00000355531 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.56■■□□□ 1.36
AFG3L1P-201ENST00000355531 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
AFG3L1P-201ENST00000355531 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
AFG3L1P-201ENST00000355531 MAP3K1Q13233 1512 aa23.55■■□□□ 1.36
AFG3L1P-201ENST00000355531 PKD2Q13563 968 aa23.55■■□□□ 1.36
AFG3L1P-201ENST00000355531 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.55■■□□□ 1.36
AFG3L1P-201ENST00000355531 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
AFG3L1P-201ENST00000355531 PZPP20742 1482 aa23.54■■□□□ 1.36
AFG3L1P-201ENST00000355531 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
AFG3L1P-201ENST00000355531 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
AFG3L1P-201ENST00000355531 TNRQ92752 1358 aa23.5■■□□□ 1.35
AFG3L1P-201ENST00000355531 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
AFG3L1P-201ENST00000355531 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.5■■□□□ 1.35
AFG3L1P-201ENST00000355531 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
AFG3L1P-201ENST00000355531 TSPY4P0CV99 314 aa23.49■■□□□ 1.35
AFG3L1P-201ENST00000355531 TSPY10P0CW01 314 aa23.49■■□□□ 1.35
AFG3L1P-201ENST00000355531 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.49■■□□□ 1.35
AFG3L1P-201ENST00000355531 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.48■■□□□ 1.35
AFG3L1P-201ENST00000355531 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.48■■□□□ 1.35
AFG3L1P-201ENST00000355531 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.47■■□□□ 1.35
AFG3L1P-201ENST00000355531 CEP152O94986 1710 aa23.46■■□□□ 1.35
AFG3L1P-201ENST00000355531 ABCC3O15438 1527 aa23.46■■□□□ 1.35
AFG3L1P-201ENST00000355531 MIA2Q96PC5 1412 aa23.45■■□□□ 1.34
AFG3L1P-201ENST00000355531 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
AFG3L1P-201ENST00000355531 CPS1P31327 1500 aa23.44■■□□□ 1.34
AFG3L1P-201ENST00000355531 HSPA1LP34931 641 aa23.41■■□□□ 1.34
AFG3L1P-201ENST00000355531 NLRP1Q9C000 1473 aa23.41■■□□□ 1.34
AFG3L1P-201ENST00000355531 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.41■■□□□ 1.34
AFG3L1P-201ENST00000355531 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
AFG3L1P-201ENST00000355531 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.4■■□□□ 1.34
AFG3L1P-201ENST00000355531 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.39■■□□□ 1.33
AFG3L1P-201ENST00000355531 PIP4K2BP78356 416 aa23.37■■□□□ 1.33
AFG3L1P-201ENST00000355531 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
AFG3L1P-201ENST00000355531 DEPDC5O75140 1603 aa23.36■■□□□ 1.33
AFG3L1P-201ENST00000355531 ERVK-7P63135 1459 aa23.35■■□□□ 1.33
AFG3L1P-201ENST00000355531 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.35■■□□□ 1.33
AFG3L1P-201ENST00000355531 TOM1O60784 492 aa23.34■■□□□ 1.33
AFG3L1P-201ENST00000355531 IQGAP1P46940 1657 aa23.34■■□□□ 1.33
AFG3L1P-201ENST00000355531 ABCC5O15440 1437 aa23.33■■□□□ 1.33
AFG3L1P-201ENST00000355531 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
AFG3L1P-201ENST00000355531 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.33■■□□□ 1.33
AFG3L1P-201ENST00000355531 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.32■■□□□ 1.32
AFG3L1P-201ENST00000355531 KIF15Q9NS87 1388 aa23.31■■□□□ 1.32
AFG3L1P-201ENST00000355531 MED14O60244 1454 aa23.3■■□□□ 1.32
AFG3L1P-201ENST00000355531 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
AFG3L1P-201ENST00000355531 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
AFG3L1P-201ENST00000355531 ALKQ9UM73 1620 aa23.29■■□□□ 1.32
AFG3L1P-201ENST00000355531 DAPK1P53355 1430 aa23.29■■□□□ 1.32
AFG3L1P-201ENST00000355531 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.29■■□□□ 1.32
AFG3L1P-201ENST00000355531 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
AFG3L1P-201ENST00000355531 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.28■■□□□ 1.32
AFG3L1P-201ENST00000355531 ERBINQ96RT1 1412 aa23.28■■□□□ 1.32
AFG3L1P-201ENST00000355531 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.27■■□□□ 1.32
AFG3L1P-201ENST00000355531 APLP2Q06481 763 aa23.27■■□□□ 1.32
AFG3L1P-201ENST00000355531 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.24■■□□□ 1.31
AFG3L1P-201ENST00000355531 SYNMO15061 1565 aa23.23■■□□□ 1.31
AFG3L1P-201ENST00000355531 PIK3C2BO00750 1634 aa23.21■■□□□ 1.31
AFG3L1P-201ENST00000355531 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.2■■□□□ 1.31
AFG3L1P-201ENST00000355531 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.34e-7■■■□□ 16.2
AFG3L1P-201ENST00000355531 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.16■■□□□ 1.3
AFG3L1P-201ENST00000355531 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
AFG3L1P-201ENST00000355531 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.16■■□□□ 1.3
AFG3L1P-201ENST00000355531 SLIT1O75093 1534 aa23.15■■□□□ 1.3
AFG3L1P-201ENST00000355531 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.15■■□□□ 1.3
AFG3L1P-201ENST00000355531 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.14■■□□□ 1.29
AFG3L1P-201ENST00000355531 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.13■■□□□ 1.29
AFG3L1P-201ENST00000355531 KANK1Q14678 1352 aa23.13■■□□□ 1.29
AFG3L1P-201ENST00000355531 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
AFG3L1P-201ENST00000355531 ADGRL2O95490 1459 aa23.12■■□□□ 1.29
AFG3L1P-201ENST00000355531 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.11■■□□□ 1.29
AFG3L1P-201ENST00000355531 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
AFG3L1P-201ENST00000355531 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
AFG3L1P-201ENST00000355531 LTKP29376 864 aa23.09■■□□□ 1.29
AFG3L1P-201ENST00000355531 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.06■■□□□ 1.28
AFG3L1P-201ENST00000355531 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
AFG3L1P-201ENST00000355531 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.04■■□□□ 1.28
AFG3L1P-201ENST00000355531 ADGRB3O60242 1522 aa23.03■■□□□ 1.28
AFG3L1P-201ENST00000355531 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.03■■□□□ 1.28
AFG3L1P-201ENST00000355531 NOS1P29475 1434 aa23.02■■□□□ 1.28
AFG3L1P-201ENST00000355531 TET3O43151 1660 aa23.01■■□□□ 1.27
AFG3L1P-201ENST00000355531 EID1Q9Y6B2 187 aa23.01■■□□□ 1.27
AFG3L1P-201ENST00000355531 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23■■□□□ 1.27
AFG3L1P-201ENST00000355531 IDI1Q13907 227 aa23■■□□□ 1.27
AFG3L1P-201ENST00000355531 STAG3Q9UJ98 1225 aa23■■□□□ 1.27
AFG3L1P-201ENST00000355531 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23■■□□□ 1.27
AFG3L1P-201ENST00000355531 UNC13BO14795 1591 aa22.99■■□□□ 1.27
AFG3L1P-201ENST00000355531 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
AFG3L1P-201ENST00000355531 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
AFG3L1P-201ENST00000355531 E9PCH4 1651 aa22.93■■□□□ 1.26
AFG3L1P-201ENST00000355531 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
AFG3L1P-201ENST00000355531 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.91■■□□□ 1.26
AFG3L1P-201ENST00000355531 NWD1Q149M9 1564 aa22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms