RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343028.8

TM7SF3-201, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM7SF3, Length 2,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-201ENST00000343028 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
TM7SF3-201ENST00000343028 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.56■■□□□ 1.84
TM7SF3-201ENST00000343028 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.56■■□□□ 1.84
TM7SF3-201ENST00000343028 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.56■■□□□ 1.84
TM7SF3-201ENST00000343028 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.55■■□□□ 1.84
TM7SF3-201ENST00000343028 AFAP1Q8N556 730 aa26.51■■□□□ 1.83
TM7SF3-201ENST00000343028 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
TM7SF3-201ENST00000343028 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.5■■□□□ 1.83
TM7SF3-201ENST00000343028 PLA2R1Q13018 1463 aa26.5■■□□□ 1.83
TM7SF3-201ENST00000343028 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.48■■□□□ 1.83
TM7SF3-201ENST00000343028 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.47■■□□□ 1.83
TM7SF3-201ENST00000343028 PLCH2O75038 1416 aa26.46■■□□□ 1.83
TM7SF3-201ENST00000343028 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.45■■□□□ 1.82
TM7SF3-201ENST00000343028 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.44■■□□□ 1.82
TM7SF3-201ENST00000343028 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.42■■□□□ 1.82
TM7SF3-201ENST00000343028 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.42■■□□□ 1.82
TM7SF3-201ENST00000343028 TMC1Q8TDI8 760 aa26.41■■□□□ 1.82
TM7SF3-201ENST00000343028 BCL11AQ9H165 835 aa26.41■■□□□ 1.82
TM7SF3-201ENST00000343028 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.41■■□□□ 1.82
TM7SF3-201ENST00000343028 A2MP01023 1474 aa26.4■■□□□ 1.82
TM7SF3-201ENST00000343028 UNC13BO14795 1591 aa26.4■■□□□ 1.82
TM7SF3-201ENST00000343028 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
TM7SF3-201ENST00000343028 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
TM7SF3-201ENST00000343028 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.37■■□□□ 1.81
TM7SF3-201ENST00000343028 PLXNC1O60486 1568 aa26.37■■□□□ 1.81
TM7SF3-201ENST00000343028 ABCC1P33527 1531 aa26.33■■□□□ 1.81
TM7SF3-201ENST00000343028 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.33■■□□□ 1.81
TM7SF3-201ENST00000343028 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.33■■□□□ 1.81
TM7SF3-201ENST00000343028 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
TM7SF3-201ENST00000343028 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
TM7SF3-201ENST00000343028 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.3■■□□□ 1.8
TM7SF3-201ENST00000343028 ERBINQ96RT1 1412 aa26.3■■□□□ 1.8
TM7SF3-201ENST00000343028 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.28■■□□□ 1.8
TM7SF3-201ENST00000343028 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.27■■□□□ 1.8
TM7SF3-201ENST00000343028 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
TM7SF3-201ENST00000343028 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
TM7SF3-201ENST00000343028 TESK2Q96S53 571 aa26.25■■□□□ 1.79
TM7SF3-201ENST00000343028 KIF3BO15066 747 aa26.24■■□□□ 1.79
TM7SF3-201ENST00000343028 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
TM7SF3-201ENST00000343028 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.22■■□□□ 1.79
TM7SF3-201ENST00000343028 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.21■■□□□ 1.79
TM7SF3-201ENST00000343028 FANCAO15360 1455 aa26.21■■□□□ 1.79
TM7SF3-201ENST00000343028 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.2■■□□□ 1.79
TM7SF3-201ENST00000343028 PANK3Q9H999 370 aa26.2■■□□□ 1.79
TM7SF3-201ENST00000343028 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.2■■□□□ 1.78
TM7SF3-201ENST00000343028 RALBP1Q15311 655 aa26.19■■□□□ 1.78
TM7SF3-201ENST00000343028 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.18■■□□□ 1.78
TM7SF3-201ENST00000343028 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.18■■□□□ 1.78
TM7SF3-201ENST00000343028 NUDCQ9Y266 331 aa26.17■■□□□ 1.78
TM7SF3-201ENST00000343028 E9PCH4 1651 aa26.17■■□□□ 1.78
TM7SF3-201ENST00000343028 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
TM7SF3-201ENST00000343028 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
TM7SF3-201ENST00000343028 TMF1P82094 1093 aa26.15■■□□□ 1.78
TM7SF3-201ENST00000343028 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
TM7SF3-201ENST00000343028 ATP10AO60312 1499 aa26.14■■□□□ 1.77
TM7SF3-201ENST00000343028 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
TM7SF3-201ENST00000343028 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
TM7SF3-201ENST00000343028 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
TM7SF3-201ENST00000343028 ADGRL1O94910 1474 aa26.12■■□□□ 1.77
TM7SF3-201ENST00000343028 ASXL2Q76L83 1435 aa26.11■■□□□ 1.77
TM7SF3-201ENST00000343028 NLRP13Q86W25 1043 aa26.11■■□□□ 1.77
TM7SF3-201ENST00000343028 ATP7AQ04656 1500 aa26.1■■□□□ 1.77
TM7SF3-201ENST00000343028 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.09■■□□□ 1.77
TM7SF3-201ENST00000343028 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.08■■□□□ 1.77
TM7SF3-201ENST00000343028 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
TM7SF3-201ENST00000343028 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
TM7SF3-201ENST00000343028 KANK1Q14678 1352 aa26.06■■□□□ 1.76
TM7SF3-201ENST00000343028 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.06■■□□□ 1.76
TM7SF3-201ENST00000343028 CLTCL1P53675 1640 aa26.05■■□□□ 1.76
TM7SF3-201ENST00000343028 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.05■■□□□ 1.76
TM7SF3-201ENST00000343028 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.03■■□□□ 1.76
TM7SF3-201ENST00000343028 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.03■■□□□ 1.76
TM7SF3-201ENST00000343028 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
TM7SF3-201ENST00000343028 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.02■■□□□ 1.76
TM7SF3-201ENST00000343028 TRPM2O94759 1503 aa26.02■■□□□ 1.76
TM7SF3-201ENST00000343028 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.02■■□□□ 1.76
TM7SF3-201ENST00000343028 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.01■■□□□ 1.75
TM7SF3-201ENST00000343028 MADDQ8WXG6 1647 aa26.01■■□□□ 1.75
TM7SF3-201ENST00000343028 LAMC1P11047 1609 aa26■■□□□ 1.75
TM7SF3-201ENST00000343028 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
TM7SF3-201ENST00000343028 CDCA7LQ96GN5 454 aa26■■□□□ 1.75
TM7SF3-201ENST00000343028 PTPRTO14522 1441 aa25.98■■□□□ 1.75
TM7SF3-201ENST00000343028 GGT6Q6P531 493 aa25.98■■□□□ 1.75
TM7SF3-201ENST00000343028 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
TM7SF3-201ENST00000343028 OSCARQ8IYS5 282 aa25.98■■□□□ 1.75
TM7SF3-201ENST00000343028 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.97■■□□□ 1.75
TM7SF3-201ENST00000343028 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TM7SF3-201ENST00000343028 DEPDC5O75140 1603 aa25.96■■□□□ 1.75
TM7SF3-201ENST00000343028 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.96■■□□□ 1.75
TM7SF3-201ENST00000343028 CEP152O94986 1710 aa25.95■■□□□ 1.75
TM7SF3-201ENST00000343028 TET3O43151 1660 aa25.95■■□□□ 1.75
TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.94■■□□□ 1.74
TM7SF3-201ENST00000343028 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
TM7SF3-201ENST00000343028 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.91■■□□□ 1.74
TM7SF3-201ENST00000343028 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
TM7SF3-201ENST00000343028 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.9■■□□□ 1.74
TM7SF3-201ENST00000343028 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.9■■□□□ 1.74
TM7SF3-201ENST00000343028 IQGAP1P46940 1657 aa25.89■■□□□ 1.73
TM7SF3-201ENST00000343028 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.88■■□□□ 1.73
TM7SF3-201ENST00000343028 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.6 ms