RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
GINS3-202ENST00000328514 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.93□□□□□ -0.02
GINS3-202ENST00000328514 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.92□□□□□ -0.02
GINS3-202ENST00000328514 KDM5DQ9BY66 1539 aa14.92□□□□□ -0.02
GINS3-202ENST00000328514 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
GINS3-202ENST00000328514 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.9□□□□□ -0.02
GINS3-202ENST00000328514 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GINS3-202ENST00000328514 PKD2Q13563 968 aa14.9□□□□□ -0.02
GINS3-202ENST00000328514 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
GINS3-202ENST00000328514 CARD11Q9BXL7 1154 aa14.89□□□□□ -0.03
GINS3-202ENST00000328514 KIAA0556O60303 1618 aa14.89□□□□□ -0.03
GINS3-202ENST00000328514 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.89□□□□□ -0.03
GINS3-202ENST00000328514 ADCY10Q96PN6 1610 aa14.89□□□□□ -0.03
GINS3-202ENST00000328514 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
GINS3-202ENST00000328514 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.88□□□□□ -0.03
GINS3-202ENST00000328514 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.88□□□□□ -0.03
GINS3-202ENST00000328514 CEP170Q5SW79 1584 aa14.88□□□□□ -0.03
GINS3-202ENST00000328514 GSE1Q14687 1217 aa14.88□□□□□ -0.03
GINS3-202ENST00000328514 POLR3GLQ9BT43 218 aa14.88□□□□□ -0.03
GINS3-202ENST00000328514 DISP1Q96F81 1524 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS3-202ENST00000328514 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS3-202ENST00000328514 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS3-202ENST00000328514 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS3-202ENST00000328514 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa14.87□□□□□ -0.03
GINS3-202ENST00000328514 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
GINS3-202ENST00000328514 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa14.86□□□□□ -0.03
GINS3-202ENST00000328514 PTPRGP23470 1445 aa14.85□□□□□ -0.03
GINS3-202ENST00000328514 KDM2BQ8NHM5 1336 aa14.84□□□□□ -0.03
GINS3-202ENST00000328514 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
GINS3-202ENST00000328514 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
GINS3-202ENST00000328514 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
GINS3-202ENST00000328514 NFKBIBQ15653 356 aa14.83□□□□□ -0.04
GINS3-202ENST00000328514 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
GINS3-202ENST00000328514 SLC24A1O60721 1099 aa14.82□□□□□ -0.04
GINS3-202ENST00000328514 LAMC1P11047 1609 aa14.82□□□□□ -0.04
GINS3-202ENST00000328514 GPRASP1Q5JY77 1395 aa14.81□□□□□ -0.04
GINS3-202ENST00000328514 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
GINS3-202ENST00000328514 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.8□□□□□ -0.04
GINS3-202ENST00000328514 CDCA7LQ96GN5 454 aa14.8□□□□□ -0.04
GINS3-202ENST00000328514 CRBNQ96SW2 442 aa14.8□□□□□ -0.04
GINS3-202ENST00000328514 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
GINS3-202ENST00000328514 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa14.8□□□□□ -0.04
GINS3-202ENST00000328514 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
GINS3-202ENST00000328514 NUP155O75694 1391 aa14.79□□□□□ -0.04
GINS3-202ENST00000328514 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
GINS3-202ENST00000328514 PRAG1Q86YV5 1406 aa14.78□□□□□ -0.04
GINS3-202ENST00000328514 ARID3CA6NKF2 412 aa14.77□□□□□ -0.04
GINS3-202ENST00000328514 BRPF3Q9ULD4 1205 aa14.77□□□□□ -0.04
GINS3-202ENST00000328514 FAM161AQ3B820 660 aa14.76□□□□□ -0.05
GINS3-202ENST00000328514 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.76□□□□□ -0.05
GINS3-202ENST00000328514 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.76□□□□□ -0.05
GINS3-202ENST00000328514 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa14.75□□□□□ -0.05
GINS3-202ENST00000328514 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
GINS3-202ENST00000328514 PLIN1O60240 522 aa14.74□□□□□ -0.05
GINS3-202ENST00000328514 C8orf34Q49A92 452 aa14.74□□□□□ -0.05
GINS3-202ENST00000328514 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
GINS3-202ENST00000328514 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.74□□□□□ -0.05
GINS3-202ENST00000328514 DCAF11Q8TEB1 546 aa14.73□□□□□ -0.05
GINS3-202ENST00000328514 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
GINS3-202ENST00000328514 ERCC6L2Q5T890 1561 aa14.72□□□□□ -0.05
GINS3-202ENST00000328514 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.72□□□□□ -0.05
GINS3-202ENST00000328514 ABCC10Q5T3U5 1492 aa14.71□□□□□ -0.05
GINS3-202ENST00000328514 ZNF521Q96K83 1311 aa14.71□□□□□ -0.05
GINS3-202ENST00000328514 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.7□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 TESK2Q96S53 571 aa14.7□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 C20orf194Q5TEA3 1177 aa14.69□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa14.69□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 HECW2Q9P2P5 1572 aa14.69□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.69□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 NUP160Q12769 1436 aa14.69□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 DUSP27Q5VZP5 1158 aa14.68□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 SKAP1Q86WV1 359 aa14.68□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 GRIN2AQ12879 1464 aa14.68□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 FBXO41Q8TF61 875 aa14.68□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 ERBINQ96RT1 1412 aa14.67□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.67□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 SYNJ2O15056 1496 aa14.67□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 DISP3Q9P2K9 1392 aa14.67□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 PLB1Q6P1J6 1458 aa14.66□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 SLC4A3P48751 1232 aa14.66□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 CCDC144AA2RUR9 1427 aa14.66□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 A2MP01023 1474 aa14.65□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.65□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 PANK3Q9H999 370 aa14.65□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa14.65□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.65□□□□□ -0.06
GINS3-202ENST00000328514 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GINS3-202ENST00000328514 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GINS3-202ENST00000328514 TSPY4P0CV99 314 aa14.64□□□□□ -0.07
GINS3-202ENST00000328514 TSPY10P0CW01 314 aa14.64□□□□□ -0.07
GINS3-202ENST00000328514 ADAMTS8Q9UP79 889 aa14.64□□□□□ -0.07
GINS3-202ENST00000328514 PLA2R1Q13018 1463 aa14.63□□□□□ -0.07
GINS3-202ENST00000328514 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms