RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325558.10

PGA3-201, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGA3, Length 1,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-201ENST00000325558 SCAPERQ9BY12 1400 aa15.94■□□□□ 0.14
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PGA3-201ENST00000325558 KDM5CP41229 1560 aa15.93■□□□□ 0.14
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PGA3-201ENST00000325558 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
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PGA3-201ENST00000325558 CFAP74Q9C0B2 1584 aa15.89■□□□□ 0.13
PGA3-201ENST00000325558 CD109Q6YHK3 1445 aa15.89■□□□□ 0.13
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PGA3-201ENST00000325558 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa15.86■□□□□ 0.13
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PGA3-201ENST00000325558 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa15.73■□□□□ 0.11
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PGA3-201ENST00000325558 DIP2BQ9P265 1576 aa15.68■□□□□ 0.1
PGA3-201ENST00000325558 IFT172Q9UG01 1749 aa15.68■□□□□ 0.1
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PGA3-201ENST00000325558 ADGRB3O60242 1522 aa15.63■□□□□ 0.09
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PGA3-201ENST00000325558 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa15.62■□□□□ 0.09
PGA3-201ENST00000325558 MROH2AA6NES4 1674 aa15.62■□□□□ 0.09
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PGA3-201ENST00000325558 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PGA3-201ENST00000325558 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PGA3-201ENST00000325558 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
PGA3-201ENST00000325558 REREQ9P2R6 1566 aa15.58■□□□□ 0.08
PGA3-201ENST00000325558 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
PGA3-201ENST00000325558 DISP3Q9P2K9 1392 aa15.58■□□□□ 0.08
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PGA3-201ENST00000325558 PPLO60437 1756 aa15.57■□□□□ 0.08
PGA3-201ENST00000325558 GGT6Q6P531 493 aa15.56■□□□□ 0.08
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