RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324659.12

NLRC3-201, Transcript of NLR family CARD domain containing 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NLRC3, Length 3,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3-201ENST00000324659 RNF123Q5XPI4 1314 aa16.06■□□□□ 0.16
NLRC3-201ENST00000324659 RRP1P56182 461 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
NLRC3-201ENST00000324659 SKAP1Q86WV1 359 aa16.06■□□□□ 0.16
NLRC3-201ENST00000324659 KDM5CP41229 1560 aa16.05■□□□□ 0.16
NLRC3-201ENST00000324659 PLIN1O60240 522 aa16.05■□□□□ 0.16
NLRC3-201ENST00000324659 CDCA7LQ96GN5 454 aa16.05■□□□□ 0.16
NLRC3-201ENST00000324659 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
NLRC3-201ENST00000324659 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
NLRC3-201ENST00000324659 RCAN3Q9UKA8 241 aa16.05■□□□□ 0.16
NLRC3-201ENST00000324659 SYNJ2O15056 1496 aa16.04■□□□□ 0.16
NLRC3-201ENST00000324659 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
NLRC3-201ENST00000324659 NEFMP07197 916 aa16.02■□□□□ 0.15
NLRC3-201ENST00000324659 NBPF1Q3BBV0 1214 aa16.01■□□□□ 0.15
NLRC3-201ENST00000324659 RALBP1Q15311 655 aa16■□□□□ 0.15
NLRC3-201ENST00000324659 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
NLRC3-201ENST00000324659 C9orf84Q5VXU9 1444 aa16■□□□□ 0.15
NLRC3-201ENST00000324659 RALGAPBQ86X10 1494 aa15.99■□□□□ 0.15
NLRC3-201ENST00000324659 CHGAP10645 457 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NLRC3-201ENST00000324659 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
NLRC3-201ENST00000324659 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.98■□□□□ 0.15
NLRC3-201ENST00000324659 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NLRC3-201ENST00000324659 NLRP13Q86W25 1043 aa15.97■□□□□ 0.15
NLRC3-201ENST00000324659 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
NLRC3-201ENST00000324659 ITSN2Q9NZM3 1697 aa15.97■□□□□ 0.15
NLRC3-201ENST00000324659 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
NLRC3-201ENST00000324659 PDE4AP27815 886 aa15.96■□□□□ 0.15
NLRC3-201ENST00000324659 ADGRL2O95490 1459 aa15.95■□□□□ 0.14
NLRC3-201ENST00000324659 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa15.94■□□□□ 0.14
NLRC3-201ENST00000324659 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa15.94■□□□□ 0.14
NLRC3-201ENST00000324659 BRPF3Q9ULD4 1205 aa15.93■□□□□ 0.14
NLRC3-201ENST00000324659 PANK3Q9H999 370 aa15.93■□□□□ 0.14
NLRC3-201ENST00000324659 ATP10BO94823 1461 aa15.92■□□□□ 0.14
NLRC3-201ENST00000324659 AFAP1Q8N556 730 aa15.92■□□□□ 0.14
NLRC3-201ENST00000324659 CRBNQ96SW2 442 aa15.92■□□□□ 0.14
NLRC3-201ENST00000324659 CEP170Q5SW79 1584 aa15.92■□□□□ 0.14
NLRC3-201ENST00000324659 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
NLRC3-201ENST00000324659 CROCC2H7BZ55 1655 aa15.91■□□□□ 0.14
NLRC3-201ENST00000324659 CCDC144AA2RUR9 1427 aa15.9■□□□□ 0.14
NLRC3-201ENST00000324659 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.9■□□□□ 0.14
NLRC3-201ENST00000324659 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.13
NLRC3-201ENST00000324659 C20orf194Q5TEA3 1177 aa15.88■□□□□ 0.13
NLRC3-201ENST00000324659 DISP3Q9P2K9 1392 aa15.88■□□□□ 0.13
NLRC3-201ENST00000324659 BACH2Q9BYV9 841 aa15.88■□□□□ 0.13
NLRC3-201ENST00000324659 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
NLRC3-201ENST00000324659 SLC4A3P48751 1232 aa15.87■□□□□ 0.13
NLRC3-201ENST00000324659 PARD3Q8TEW0 1356 aa15.87■□□□□ 0.13
NLRC3-201ENST00000324659 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa15.87■□□□□ 0.13
NLRC3-201ENST00000324659 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa15.87■□□□□ 0.13
NLRC3-201ENST00000324659 PDE3BQ13370 1112 aa15.85■□□□□ 0.13
NLRC3-201ENST00000324659 KIF3BO15066 747 aa15.84■□□□□ 0.13
NLRC3-201ENST00000324659 ADAMTS8Q9UP79 889 aa15.84■□□□□ 0.13
NLRC3-201ENST00000324659 PRAG1Q86YV5 1406 aa15.84■□□□□ 0.13
NLRC3-201ENST00000324659 NUP160Q12769 1436 aa15.83■□□□□ 0.12
NLRC3-201ENST00000324659 FAM135AQ9P2D6 1515 aa15.83■□□□□ 0.12
NLRC3-201ENST00000324659 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
NLRC3-201ENST00000324659 ABCC10Q5T3U5 1492 aa15.83■□□□□ 0.12
NLRC3-201ENST00000324659 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.82■□□□□ 0.12
NLRC3-201ENST00000324659 TESK2Q96S53 571 aa15.82■□□□□ 0.12
NLRC3-201ENST00000324659 ARHGAP5Q13017 1502 aa15.82■□□□□ 0.12
NLRC3-201ENST00000324659 TMF1P82094 1093 aa15.82■□□□□ 0.12
NLRC3-201ENST00000324659 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP15.8■□□□□ 0.12
NLRC3-201ENST00000324659 GGT6Q6P531 493 aa15.8■□□□□ 0.12
NLRC3-201ENST00000324659 KDM5DQ9BY66 1539 aa15.8■□□□□ 0.12
NLRC3-201ENST00000324659 SHANK2Q9UPX8 1470 aa15.8■□□□□ 0.12
NLRC3-201ENST00000324659 RGS3P49796 1198 aa15.79■□□□□ 0.12
NLRC3-201ENST00000324659 CCDC146Q8IYE0 955 aa15.79■□□□□ 0.12
NLRC3-201ENST00000324659 RSPH4AQ5TD94 716 aa15.79■□□□□ 0.12
NLRC3-201ENST00000324659 E9PCH4 1651 aa15.79■□□□□ 0.12
NLRC3-201ENST00000324659 KNSTRNQ9Y448 316 aa15.78■□□□□ 0.12
NLRC3-201ENST00000324659 ERBINQ96RT1 1412 aa15.78■□□□□ 0.12
NLRC3-201ENST00000324659 A2MP01023 1474 aa15.78■□□□□ 0.12
NLRC3-201ENST00000324659 MS4A1P11836 297 aa15.78■□□□□ 0.12
NLRC3-201ENST00000324659 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
NLRC3-201ENST00000324659 CCDC141Q6ZP82 1450 aa15.77■□□□□ 0.12
NLRC3-201ENST00000324659 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.11
NLRC3-201ENST00000324659 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa15.76■□□□□ 0.11
NLRC3-201ENST00000324659 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
NLRC3-201ENST00000324659 ABCA8O94911 1581 aa15.75■□□□□ 0.11
NLRC3-201ENST00000324659 PLA2R1Q13018 1463 aa15.75■□□□□ 0.11
NLRC3-201ENST00000324659 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa15.74■□□□□ 0.11
NLRC3-201ENST00000324659 SYCP2Q9BX26 1530 aa15.74■□□□□ 0.11
NLRC3-201ENST00000324659 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
NLRC3-201ENST00000324659 PPP2R1AP30153 589 aa15.73■□□□□ 0.11
NLRC3-201ENST00000324659 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa15.73■□□□□ 0.11
NLRC3-201ENST00000324659 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa15.73■□□□□ 0.11
NLRC3-201ENST00000324659 GSE1Q14687 1217 aa15.72■□□□□ 0.11
NLRC3-201ENST00000324659 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
NLRC3-201ENST00000324659 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.1
NLRC3-201ENST00000324659 DUSP27Q5VZP5 1158 aa15.71■□□□□ 0.1
NLRC3-201ENST00000324659 GOLGA2Q08379 1002 aa15.7■□□□□ 0.1
NLRC3-201ENST00000324659 DDRGK1Q96HY6 314 aa15.7■□□□□ 0.1
NLRC3-201ENST00000324659 USP35Q9P2H5 1018 aa15.7■□□□□ 0.1
NLRC3-201ENST00000324659 PKNOX2Q96KN3 472 aa15.69■□□□□ 0.1
NLRC3-201ENST00000324659 GPRASP1Q5JY77 1395 aa15.69■□□□□ 0.1
NLRC3-201ENST00000324659 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa15.69■□□□□ 0.1
NLRC3-201ENST00000324659 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP15.68■□□□□ 0.1
NLRC3-201ENST00000324659 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
NLRC3-201ENST00000324659 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.68■□□□□ 0.1
NLRC3-201ENST00000324659 APAF1O14727 1248 aa15.68■□□□□ 0.1
NLRC3-201ENST00000324659 ARHGEF5Q12774 1597 aa15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms