RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323081.12

SPNS1-202, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPNS1, Length 2,102 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-202ENST00000323081 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SPNS1-202ENST00000323081 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.35■■□□□ 1.49
SPNS1-202ENST00000323081 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.35■■□□□ 1.49
SPNS1-202ENST00000323081 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.34■■□□□ 1.49
SPNS1-202ENST00000323081 FKBP8Q14318 412 aa24.34■■□□□ 1.49
SPNS1-202ENST00000323081 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.33■■□□□ 1.49
SPNS1-202ENST00000323081 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.33■■□□□ 1.49
SPNS1-202ENST00000323081 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.32■■□□□ 1.48
SPNS1-202ENST00000323081 CCDC184Q52MB2 194 aa24.32■■□□□ 1.48
SPNS1-202ENST00000323081 AFAP1Q8N556 730 aa24.3■■□□□ 1.48
SPNS1-202ENST00000323081 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.3■■□□□ 1.48
SPNS1-202ENST00000323081 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.29■■□□□ 1.48
SPNS1-202ENST00000323081 FANCAO15360 1455 aa24.29■■□□□ 1.48
SPNS1-202ENST00000323081 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
SPNS1-202ENST00000323081 NEFLP07196 543 aa24.29■■□□□ 1.48
SPNS1-202ENST00000323081 ASXL2Q76L83 1435 aa24.28■■□□□ 1.48
SPNS1-202ENST00000323081 ATP10AO60312 1499 aa24.27■■□□□ 1.48
SPNS1-202ENST00000323081 BCANQ96GW7 911 aa24.27■■□□□ 1.48
SPNS1-202ENST00000323081 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.27■■□□□ 1.48
SPNS1-202ENST00000323081 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.25■■□□□ 1.47
SPNS1-202ENST00000323081 MRS2Q9HD23 443 aa24.25■■□□□ 1.47
SPNS1-202ENST00000323081 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.24■■□□□ 1.47
SPNS1-202ENST00000323081 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SPNS1-202ENST00000323081 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SPNS1-202ENST00000323081 A2MP01023 1474 aa24.24■■□□□ 1.47
SPNS1-202ENST00000323081 OSCARQ8IYS5 282 aa24.24■■□□□ 1.47
SPNS1-202ENST00000323081 ATP7AQ04656 1500 aa24.22■■□□□ 1.47
SPNS1-202ENST00000323081 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.22■■□□□ 1.47
SPNS1-202ENST00000323081 RGL3Q3MIN7 710 aa24.21■■□□□ 1.47
SPNS1-202ENST00000323081 DEPDC5O75140 1603 aa24.21■■□□□ 1.47
SPNS1-202ENST00000323081 ADGRL1O94910 1474 aa24.21■■□□□ 1.47
SPNS1-202ENST00000323081 E9PCH4 1651 aa24.2■■□□□ 1.46
SPNS1-202ENST00000323081 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
SPNS1-202ENST00000323081 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
SPNS1-202ENST00000323081 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.18■■□□□ 1.46
SPNS1-202ENST00000323081 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.18■■□□□ 1.46
SPNS1-202ENST00000323081 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.17■■□□□ 1.46
SPNS1-202ENST00000323081 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
SPNS1-202ENST00000323081 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.12■■□□□ 1.45
SPNS1-202ENST00000323081 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.12■■□□□ 1.45
SPNS1-202ENST00000323081 LAMC1P11047 1609 aa24.11■■□□□ 1.45
SPNS1-202ENST00000323081 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.11■■□□□ 1.45
SPNS1-202ENST00000323081 TET3O43151 1660 aa24.11■■□□□ 1.45
SPNS1-202ENST00000323081 TRPM2O94759 1503 aa24.1■■□□□ 1.45
SPNS1-202ENST00000323081 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.1■■□□□ 1.45
SPNS1-202ENST00000323081 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
SPNS1-202ENST00000323081 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.09■■□□□ 1.45
SPNS1-202ENST00000323081 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.45
SPNS1-202ENST00000323081 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
SPNS1-202ENST00000323081 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.08■■□□□ 1.44
SPNS1-202ENST00000323081 PTPRTO14522 1441 aa24.07■■□□□ 1.44
SPNS1-202ENST00000323081 CEP152O94986 1710 aa24.07■■□□□ 1.44
SPNS1-202ENST00000323081 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.06■■□□□ 1.44
SPNS1-202ENST00000323081 CLTCL1P53675 1640 aa24.05■■□□□ 1.44
SPNS1-202ENST00000323081 KIF3BO15066 747 aa24.04■■□□□ 1.44
SPNS1-202ENST00000323081 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.04■■□□□ 1.44
SPNS1-202ENST00000323081 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.03■■□□□ 1.44
SPNS1-202ENST00000323081 KANK1Q14678 1352 aa24.02■■□□□ 1.44
SPNS1-202ENST00000323081 CD109Q6YHK3 1445 aa24.01■■□□□ 1.43
SPNS1-202ENST00000323081 MADDQ8WXG6 1647 aa24.01■■□□□ 1.43
SPNS1-202ENST00000323081 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24■■□□□ 1.43
SPNS1-202ENST00000323081 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
SPNS1-202ENST00000323081 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
SPNS1-202ENST00000323081 TESK2Q96S53 571 aa23.96■■□□□ 1.43
SPNS1-202ENST00000323081 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.96■■□□□ 1.43
SPNS1-202ENST00000323081 TMC1Q8TDI8 760 aa23.95■■□□□ 1.42
SPNS1-202ENST00000323081 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.94■■□□□ 1.42
SPNS1-202ENST00000323081 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.93■■□□□ 1.42
SPNS1-202ENST00000323081 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
SPNS1-202ENST00000323081 RALBP1Q15311 655 aa23.92■■□□□ 1.42
SPNS1-202ENST00000323081 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
SPNS1-202ENST00000323081 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.91■■□□□ 1.42
SPNS1-202ENST00000323081 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.91■■□□□ 1.42
SPNS1-202ENST00000323081 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.91■■□□□ 1.42
SPNS1-202ENST00000323081 IQGAP1P46940 1657 aa23.91■■□□□ 1.42
SPNS1-202ENST00000323081 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
SPNS1-202ENST00000323081 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.91■■□□□ 1.42
SPNS1-202ENST00000323081 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.9■■□□□ 1.42
SPNS1-202ENST00000323081 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
SPNS1-202ENST00000323081 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.89■■□□□ 1.42
SPNS1-202ENST00000323081 STAC3Q96MF2 364 aa23.87■■□□□ 1.41
SPNS1-202ENST00000323081 ABCA6Q8N139 1617 aa23.86■■□□□ 1.41
SPNS1-202ENST00000323081 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
SPNS1-202ENST00000323081 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.86■■□□□ 1.41
SPNS1-202ENST00000323081 KIF1BO60333 1816 aa23.85■■□□□ 1.41
SPNS1-202ENST00000323081 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
SPNS1-202ENST00000323081 NEO1Q92859 1461 aa23.84■■□□□ 1.41
SPNS1-202ENST00000323081 TMF1P82094 1093 aa23.84■■□□□ 1.41
SPNS1-202ENST00000323081 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.82■■□□□ 1.4
SPNS1-202ENST00000323081 MROH2AA6NES4 1674 aa23.82■■□□□ 1.4
SPNS1-202ENST00000323081 IFT172Q9UG01 1749 aa23.81■■□□□ 1.4
SPNS1-202ENST00000323081 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.81■■□□□ 1.4
SPNS1-202ENST00000323081 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.81■■□□□ 1.4
SPNS1-202ENST00000323081 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.81■■□□□ 1.4
SPNS1-202ENST00000323081 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
SPNS1-202ENST00000323081 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
SPNS1-202ENST00000323081 MYOM2P54296 1465 aa23.79■■□□□ 1.4
SPNS1-202ENST00000323081 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
SPNS1-202ENST00000323081 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.78■■□□□ 1.4
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